Tuy hoạt động không vì mục đích lợi nhuận, thực hiện chính sách tín dụng ưu đãi đối với người nghèo và các đối tượng chính sách khác, nhưng NHCSXH luôn phải đảm bảo chỉ tiêu thu lãi để bù đắp chi phí hoạt động. Bên cạnh đó, nguồn thu của NHCSXH Tây Ninh chủ yếu là nguồn thu từ lãi cho vay các chương trình. Về các khoản phải chi thì chủ yếu là chi phí ủy thác, phí hoa hồng cho các hội đoàn thể nhận ủy thác và các tổ TK&VV.
Trong những năm qua tình hình thu lãi của chi nhánh NHCSXH được cải thiện rõ rệt. Theo báo cáo kết quả tài chính đến cuối tháng 12/2014 thì tổng thu đạt 106.488 triệu đồng, tổng chi 74.696 triệu đồng, chênh lệch thu chi 31.792 triệu đồng, tỷ lệ thu lãi đạt 98,45% ( trong khi tỷ lệ thu lãi được giao khoán là 95% lãi phải thu). Như vậy, khả năng bảo toàn vốn của chi nhánh là được đảm bảo.
Bên cạnh một số hộ vay vốn do hoàn cảnh quá khó khăn hoặc khả năng lập kế hoạch trả nợ hạn chế nên chưa có khả năng tích lũy tiền để trả nợ gốc đúng hạn. Dẫn đến tồn đọng nợ phân kỳ, dồn về kỳ cuối và rất khó khăn trong việc trả nợ khi đến hạn trả nợ cuối cùng. Kiến thức, kinh nghiệm về kỹ thuật sản xuất kinh doanh và quản lý của người sử dụng vốn ở nhiều nơi còn yếu dẫn đến sử dụng vốn vay không hiệu quả nên khó tích lũy tiền trả lãi và nợ gốc tiền vay. Một bộ phận hộ vay nhận thức chưa rõ về trách nhiệm sử dụng và hoàn trả vốn vay nên chưa có ý thức tích lũy tiền trả lãi và nợ gốc hoặc chây ỳ không chịu trả nợ. Thậm chí một số hộ vẫn còn tâm lý ỷ lại chính sách của Chính phủ, xem vốn vay là vốn cho không của Chính phủ.
Tuy nhiên, nhìn chung đa số hộ vay vốn sử dụng vốn vay có hiệu quả, trả nợ ngân hàng đúng hạn, tỷ lệ nợ quá ở mức thấp. Vì vậy có thể đảm bảo an toàn về nguồn vốn cho vay hộ nghèo.