Kiểm tra kiểm soát là một yêu cầu quan trọng nhằm nâng cao chất lượng hoạt động kinh doanh ngân hàng nói chung và lĩnh vực tài chính nói riêng. Hoạt động kinh doanh của ngân hàng có hiệu quả hay không phụ thuộc rất nhiều vào công tác kiểm tra kiểm soát, đặc biệt là kiểm tra kiểm soát nội bộ. Tuy nhiên, hiện nay tại Chi nhánh, công tác này chưa thực sự hiệu quả, còn mang tính thụ động, dàn trải, thiếu trọng tâm, trọng điểm, lực lượng còn mỏng, chưa theo kịp yêu cầu đặt ra, chưa thực sự chú trọng tới công tác quản
lý chi phí. Để nâng cao hiệu quả quản lý doanh thu, chi phí, Chi nhánh cần thực hiện một số biện pháp về công tác kiểm tra kiểm soát như sau:
Thứ nhất, để đảm bảo tính độc lập khách quan trong công tác kiểm tra- kiểm soát chi phí tại chi nhánh, cần phân tách rõ việc thực hiện hạch toán và việc kiểm tra-kiểm soát. Cần thành lập bộ phận chuyên thực hiện công tác kiểm tra-kiểm soát (hiện nay tại chi nhánh đã thành lập phòng Quản lý rủi ro, tuy nhiên hoạt động chủ yếu là giám sát rủi ro tín dụng, các cán bộ không có nhiều kinh nghiệm và chuyên sâu nghiệp vụ trong công tác kế toán do đó mảng kế toán chưa được theo dõi sát sao). Việc phân tách rõ ràng 2 chức năng thực hiện và kiểm tra trong hạch toán chi phí sẽ giảm thiểu được những rủi ro có thể xảy ra do gian lận trong quá trình hạch toán.
Cùng với việc tách bạch hóa 2 bộ phận thực hiện hạch toán tại Phòng kế toán và kiểm tra- giám sát hạch toán tại phòng Quản lý rủi ro thì cần tăng cường trình độ chuyên môn cho đội ngũ cán bộ của phòng Quản lý rủi ro vì hiện nay khối lượng công việc cũng như yêu cầu đòi hỏi công tác kiểm tra ngày càng lớn, phạm vi rộng với mức độ chuyên sâu tuy nhiên lực lượng cán bộ thực hiện công tác này tại Chi nhánh còn rất mỏng cả về số lượng và chất lượng. Một cán bộ kiểm soát giỏi phải có thời gian làm việc thực tế ở các lĩnh vực nghiệp vụ đặc biệt là lĩnh vực tài chính kế toán. Do vậy, cần có kế hoạch đào tạo và bố trí cán bộ để đáp ứng được yêu cầu đặt ra đồng thời chi nhánh sớm hoàn thiện mô hình tổ chức quản lý theo hướng tách bộ phận kiểm tra mảng nghiệp vụ phi tín dụng hoạt động độc lập và hiện nay trực thuộc phòng Quản lý rủi ro.
Thứ hai, tổ chức kiểm tra thường xuyên, đột xuất mọi hoạt động kinh doanh của Chi nhánh, đề phòng, ngăn chặn những rủi ro có thể phát sinh. Kinh doanh tiền tệ là một lĩnh vực luôn ẩn chứa đầy rủi ro, nếu để xẩy ra mất mát, thất thoát tài sản của Ngân hàng chi phí hoạt động sẽ tăng lên rất nhiều
từ đó lợi nhuận sẽ giảm sút. Bên cạnh công tác kiểm tra nội bộ, Chi nhánh cần phối hợp với các công ty kiểm toán độc lập và cơ quan thuế để thực hiện các đợt kiểm tra kiểm soát đảm bảo tính chặt chẽ và pháp lý cho hoạt động của Ngân hàng đồng thời học hỏi được những kinh nghiệm quản lý có hiệu quả.