Công ty TNHH-MTV Thuỷ lợi Phúc Yên hoạt động với 100% vốn nhà nước, được UBND tỉnh Vĩnh Phúc giao quản lý khai thác các công trình thuỷ lợi trên địa bàn. Hàng năm Công ty nhận được sự quan tâm tạo điều kiền thuận lợi của Tỉnh uỷ, UBND tỉnh Vĩnh Phúc, Đảng uỷ khối Doanh nghiệp, Sở Nông nghiệp và phát triển nông thôn, cùng các ngành hữu quan; UBND các Huyện, Thành, Thị trong Tỉnh và sự chỉ đạo sâu sát của Đảng bộ, ban giám đốc Công ty TNHH-MTV Thuỷ lợi Phúc Yên. Do đó trong năm 2018 một số công trình do Công ty quản lý đang bị xuống cấp hư hỏng đã được kịp thời đầu tư tu bổ sửa chữa, hệ thống kênh mương nội đồng được kiên cố hoá đã làm tăng sự an toàn, ổn định và phát huy hiệu quả trong việc tích nước và dẫn nước đảm bảo phục vụ sản xuất nông nghiệp và cho các nhu cầu dùng nước khác.
Diện tích tưới tiêu phục vụ sản xuất nông nghiệp và dân sinh của tỉnh, từ công trình thuỷ lợi do Công ty trực tiếp quản lý, khai thác, bảo vệ. Công ty hiện có 68 cán bộ công nhân viên được bố trí làm việc ở văn phòng Công ty và 03 đơn vị trực thuộc là Xí Nghiệp Xây dựng;Xí Nghiệp Khảo sát- Thiết kế;Xí Nghiệp Thủy lợi Phúc Yên; dưới xí nghiệp Phúc Yên là các cụm, trạm thủy nông; trạm bơm tưới, tiêu nằm trên địa bàn các xã, phường.
Để đáp ứng được yêu cầu đổi mới và nâng cao hiệu quả sản xuất kinh doanh, Đảng uỷ và ban Giám đốc công ty đã xây dựng công tác quy hoạch cán bộ, ra nghị quyết về quan tâm đào tạo nâng cao trình độ chuyên môn nghiệp vụ, lý luận chính trị cho cán bộ công nhân viên, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ ngày càng cao trong thời kỳ đổi mới, đến nay đội ngũ cán bộ công nhân viên chức trong công ty ngày càng lớn mạnh.
Do tổ chức và thực hiện tốt quy chế dân chủ nên đội ngũ cán bộ công nhân viên Công ty luôn làm việc với tinh thần trách nhiệm cao. Công ty đã tạo dựng một cơ sở vật chất tốt đáp ứng kịp thời nhiệm vụ được giao.