* An ninh l−ơng thực:
An ninh l−ơng thực là sự bảo đảm bình ổn việc cung cấp đầy đủ l−ơng thực cho tất cả mọi ng−ời ở mọi nơi và trong mọi lúc nhằm đảm bảo nhu cầu dinh d−ỡng để sống và làm việc có năng suất và có hiệu quả. An ninh l−ơng thực phải đảm bảo bốn mục tiêu cơ bản là tính sẵn sàng - đảm bảo đủ l−ơng thực để cung cấp; tính ổn định - đảm bảo phân phối tốt l−ơng thực thoả mãn các yêu cầu đúng số l−ợng, đúng chất l−ợng, đúng nơi, đúng lúc; tính tiếp cận
- đảm bảo mọi ng−ời có khả năng mua l−ơng thực và cuối cùng là tính vệ sinh - đảm bảo tiêu chuẩn vệ sinh, an toàn sức khoẻ dinh d−ỡng. Bảo đảm an ninh l−ơng thực còn là bảo đảm chiến l−ợc phát triển nhân lực quốc gia, động lực phát triển nhiều ngành nghề đa dạng. Không những thế, an ninh l−ơng thực còn đảm bảo sự ổn định chính trị xã hội của đất n−ớc.
Để đảm bảo an ninh l−ơng thực, nhiều Chính phủ áp dụng các ch−ơng trình quốc gia dự trữ l−ơng thực, thực phẩm (lúa gạo, ngô…). Bên cạnh đó, còn có các ch−ơng trình dự trữ các mặt hàng thiết yếu đối với sản xuất nông nghiệp nh− giống cây, thuốc thú y, thuốc bảo vệ thực vật…hay quan trọng đối với phát triển các ngành nghề khác nh− bông…Các biện pháp hạn chế xuất khẩu nh− kiểm soát xuất khẩu l−ơng thực để duy trì sự ổn định cung cầu trên thị tr−ờng nội địa với mục tiêu đảm bảo an ninh l−ơng thực cũng đ−ợc coi nh− các ngoại lệ đ−ợc phép trong bảo hộ nông sản.
* Bảo vệ nguồn gen:
Việc phổ biến các giống cây có năng suất cao đã làm giảm mức độ đa dạng gen trong các loại cây trồng chủ chốt. Một loại cây trồng đ−ợc đ−a vào môi tr−ờng mới đòi hỏi lai cấy hàng nghìn gen mới. Khi đ−ợc trồng trên diện rộng, nó có tác động sinh thái đáng kể đối với hệ động thực vật bản địa, bao gồm cả các côn trùng có lợi. Vì vậy, những quan ngại về “việc ô nhiễm gen” đã làm nảy sinh yêu cầu bảo vệ nguồn gen tr−ớc nguy cơ xâm hại của các giống ngoại lai nhập khẩu. Nhiều n−ớc đã bày tỏ những lo ngại nh− việc cấy ghép gen ngẫu nhiên, tính bất ổn định của gen, và sự đột biến gen do lai cấy gen… Tuy nhiên, nghiên cứu khoa học để phân tích, dự báo và phòng ngừa rủi ro, cộng với việc theo dõi vào kiểm soát chặt chẽ cần phải đ−ợc tiếp tục để hạn chế đến mức thấp nhất những ảnh h−ởng sinh thái tiêu cực của các loài cây trồng biến đổi gen. Mặc dù không nằm trong các điều khoản của Hiệp định Nông nghiệp, các lý do bảo hộ đ−ợc đ−a ra xuất phát từ yêu cầu này th−ờng đ−ợc coi là hợp lý.