Căn cứ theo Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn các Luật thuế hiện hành thì các doanh nghiệp khai thác khoáng sản phải thực hiện tự tính, tự khai, tự nộp thuế như sau:
- Nguyên tắc tính thuế, khai thuế:
+ Người nộp thuế phải tính số tiền thuế phải nộp ngân sách nhà nước, trừ trường hợp cơ quan thuế ấn định thuế hoặc tính thuế theo quy định tại Điều 37 và Điều 38 của Luật Quản lý thuế.
+ Người nộp thuế phải khai chính xác, trung thực, đầy đủ các nội dung trong tờ khai thuế với cơ quan thuế theo mẫu do Bộ Tài chính quy định và nộp đủ các chứng từ, tài liệu quy định trong hồ sơ khai thuế.
+ Đối với loại thuế khai theo tháng, quý hoặc năm, nếu trong kỳ tính thuế không phát sinh nghĩa vụ thuế hoặc người nộp thuế đang thuộc diện được hưởng ưu đãi, miễn giảm thuế thì người nộp thuế vẫn phải nộp hồ sơ khai thuế cho cơ quan thuế theo đúng thời hạn quy định, trừ trường hợp đã chấm dứt hoạt động phát sinh nghĩa vụ thuế và trường hợp tạm ngừng kinh doanh theo quy định.
+ Đối với loại thuế khai theo tháng hoặc khai theo quý, kỳ tính thuế đầu tiên được tính từ ngày bắt đầu hoạt động phát sinh nghĩa vụ thuế đến ngày cuối cùng của tháng hoặc quý, kỳ tính thuế cuối cùng được tính từ ngày đầu tiên của tháng hoặc quý đến ngày kết thúc hoạt động phát sinh nghĩa vụ thuế. Kỳ tính thuế năm của thuế thu nhập doanh nghiệp hoặc thuế tài nguyên được tính theo năm dương lịch hoặc năm tài chính của người nộp thuế. Kỳ tính thuế năm của các loại thuế khác là năm dương lịch.
+ Người nộp thuế trong thời gian tạm ngừng kinh doanh và không phát sinh nghĩa vụ thuế thì không phải nộp hồ sơ khai thuế của thời gian tạm ngừng hoạt động kinh doanh.
Trước khi tạm ngừng kinh doanh, người nộp thuế phải có thông báo bằng văn bản gửi cơ quan thuế quản lý trực tiếp chậm nhất năm (5) ngày trước khi tạm ngừng kinh doanh. Hết thời hạn tạm ngừng kinh doanh, người nộp thuế phải thực hiện kê khai thuế theo quy định. Trường hợp người nộp thuế ra kinh doanh trước thời hạn theo thông báo tạm ngừng kinh doanh thì phải có thông báo bằng văn bản gửi cơ quan thuế quản lý trực tiếp đồng thời thực hiện nộp hồ sơ khai thuế theo quy định.
- Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của một số hồ sơ phát sinh thường xuyên như sau: + Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế tháng chậm nhất là ngày thứ hai mươi của tháng tiếp theo tháng phát sinh nghĩa vụ thuế. Bao gồm các tờ khai thuế GTGT ( từ 01/07/2013 căn cứ Thông tư 156/2013/TT-BTC ngày 06/11/2013 của Bộ Tài chính thì doanh nghiệp có doanh thu dưới 20 tỷ/năm thì được phép kê khai thuế GTGT theo quý), thuế Tài nguyên, phí bảo vệ môi trường, thuế TTĐB…
+ Thời hạn nộp hồ sơ khai thuế quý chậm nhất là ngày thứ ba mươi của quý tiếp theo quý phát sinh nghĩa vụ thuế. Bao gồm các tờ khai thuế TNDN tạm tính, thuế TNCN …
+ Thời hạn nộp hồ sơ quyết toán thuế năm chậm nhất là ngày thứ chín mươi, kể từ ngày kết thúc năm dương lịch hoặc năm tài chính. Bao gồm tờ khai quyết toán thuế TNDN, TNCN, tài nguyên, phí BVMT …
- Địa điểm nộp tờ khai:
Người nộp thuế nộp hồ sơ khai thuế; hồ sơ khai phí, lệ phí và khoản thu khác thuộc ngân sách nhà nước tại cơ quan thuế quản lý trực tiếp (trừ một số trường hợp đặc biệt được hướng dẫn cụ thể).
Cách thức thực hiện:
+ Trực tiếp tại trụ sở Cục Thuế. + Thông qua hệ thống bưu chính.
+ Kê khai thuế qua mạng theo hệ thống ứng dụng iHTKK của ngành thuế. - Người nộp thuế tự kê khai và tự nộp thuế theo thực tế tình hình sản xuất kinh doanh của Công ty. Riêng đối với thuế tài nguyên và phí BVMT người nộp thuế phải ngoài căn cứ vào giá bán thực tế của mình còn căn cứ vào giá bán tối thiểu do UBND tỉnh quy định. Căn cứ theo đề nghị của Cục thuế tỉnh Khánh Hòa, xét tình hình thực tế về sự biến động giá cả trên thị trường và căn cứ các quy định về giá tính thuế và mức thu phí tại các Nghị định có hiệu lực, UBND tỉnh sẽ xây dựng giá tính thuế và mức thu
phí BVMT đối với từng loại khoáng sản khai thác cho phù hợp với điều kiện thực tế của địa phương và trình Hội đồng nhân dân cấp tỉnh quyết định.