Xác định kiểu cách cư trú và gen độc lực của staphylococcus aureus ở nhóm người làm việc tại một số cơ sở dịch vụ ăn ux

khóa luận, tiểu luận, chuyên đề, đề tài, luận văn

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI LÊ KHÁNH TRÂM LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Hà Nội - 2013 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI LÊ KHÁNH TRÂM Chuyên ngành: Vi sinh y học Mã số: 62720115 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS. TS. ĐINH HỮU DUNG PGS. TS. NGUYỄN VŨ TRUNG Hà Nội - 2013 Lời cám ơn Để hoàn thành luận án này, tôi đã nhận được rất nhiều sự giúp đỡ của các thày cô giáo, bạn bè, đồng nghiệp và gia đình. Tôi xin bày tỏ lòng kính trọng và biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Đinh Hữu Dung, PGS.TS. Nguyễn Vũ Trung, những người thày đã trực tiếp hướng dẫn và tạo điều kiện thuận lợi cho tôi trong quá trình thực hiện luận án. Tôi xin trân trọng cảm ơn PGS.TS. Lê Văn Phủng, Trưởng Bộ môn Vi sinh Trường Đại học Y Hà Nội, PGS.TS. Nguyễn Thị Vinh, TS. Phạm Hồng Nhung, TS. Lê Văn Duyệt, ThS. Văn Đình Tráng hướng dẫn và đóng góp cho tôi những ý kiến quý báu trong suốt quá trình học tập, nghiên cứu. Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn CN. Nguyễn Thị Minh Thư, CN. Vũ Thị Hồ Vân, KTV. Lê Thị Hải, KTV. Phạm Thị Vinh, những người đã giúp đỡ tận tình trong quá trình thực hiện nghiên cứu. Tôi xin trân trọng cám ơn Ban Giám hiệu, Phòng Đào tạo Sau đại học, các thày cô giáo Bộ môn Vi sinh, Trường Đại học Y Hà Nội đã trang bị kiến thức, tạo điều kiện, giúp đỡ cho tôi trong thời gian học tập tại trường. Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn tới Ban Giám đốc Bệnh viện Bạch Mai, Ban Lãnh đạo và tập thể Khoa Vi sinh Bệnh viện Bạch Mai đã tạo điều kiện và động viên tôi học tập tốt. Tôi xin chân thành cảm ơn Ban Giám đốc và Tập thể khoa xét nghiệm Bệnh viện Nhiệt đới Trung ương, Trung tâm Y tế Dự phòng Hà Nội, Trung tâm Y tế Quận Đống Đa, các nhân viên của các cơ sở dịch vụ ăn uống tham gia nghiên cứu, đã giúp đỡ tôi thực hiện nghiên cứu, thu thập số liệu phục vụ luận án này. Tôi vô cùng biết ơn những người thân trong gia đình và bạn bè thân thiết đã động viên, hỗ trợ tôi cả về tinh thần và vật chất trong suốt quá trình học tập, nghiên cứu. Hà Nội, tháng 8 năm 2013 Lê Khánh Trâm CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan, đây là công trình nghiên cứu do tôi chủ trì thực hiện dưới sự hướng dẫn của PGS.TS Đinh Hữu Dung và PGS.TS Nguyễn Vũ Trung. Các số liệu trong luận án là trung thực và kết quả nghiên cứu chưa từng được ai công bố trong bất kỳ công trình nào khác. Tác giả Lê Khánh Trâm MỤC LỤC Lời cam đoan Mục lục Chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục biểu đồ Danh mục hình CHỮ VIẾT TẮT A: Adenine bp: Base pair (cặp bazơ) C: Cytosine DNA: Deoxyribonucleic acid dNTP: Deoxyribonucleotid triphosphate ELISA: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (Phản ứng miễn dịch gắn enzyme) EFT: Exfoliatin toxin G Guanine MLST: Multi-locus sequence typing (Giải trình tự gen nhiều locus) MRSA: Methicillin resistant Staphylococcus aureus (Tụ cầu vàng kháng methicillin) PCR: Polymerase Chain Reaction (Phản ứng trùng hợp chuỗi) RFLP: Restriction fragment length polymorphism (Kỹ thuật xác định tính đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn) SE: Staphyloccocal enterotoxin (Độc tố ruột của tụ cầu) T: Thymine TNF: Tumor necrosis factor (Yếu tố hoại tử u) TSST: Toxic shock syndrome toxin (Độc tố gây hội chứng shock nhiễm độc) DANH MỤC BẢNG DANH MỤC HÌNH 10 ĐẶT VẤN ĐỀ Staphylococcus aureus là một trong những vi khuẩn hay gặp nhất trên cơ thể người, nó cũng là căn nguyên của nhiều loại nhiễm trùng khác nhau. S. aureus có thể gây nhiễm trùng ngoài da, ngộ độc thực phẩm, viêm tủy xương, nhiễm khuẩn huyết…Tùy vào mức độ và loại nhiễm trùng mà biểu hiện trên lâm sàng khác nhau. S. aureus là thành viên của hệ vi khuẩn ở người. Khoảng 30% người khoẻ mạnh mang S. aureus. S. aureus được phát hiện thấy ở nhiều vùng của cơ thể như da ở vùng cổ, ngực, bụng, bàn tay…và một số hốc tự nhiên trên cơ thể. Vị trí cư trú hay gặp nhất của S. aureus là lỗ mũi trước. S. aureus có thể cư trú thường xuyên, không thường xuyên và không cư trú trên cơ thể người. Khi có tổn thương da, niêm mạc, sức đề kháng của cơ thể suy giảm thì các nhiễm trùng do S. aureus dễ dàng xuất hiện. Sự có mặt và số lượng S. aureus ở trên cơ thể phụ thuộc vào tình trạng vệ sinh, miễn dịch, và nhiều yếu tố khác của cơ thể vật chủ cũng như của vi khuẩn [6]. Phần lớn các chủng S. aureus đều có một hoặc một số gen độc lực liên quan đến những tình trạng nhiễm trùng và bệnh lý khác nhau. Một số gen chịu trách nhiệm sản xuất các độc tố ruột (Staphylococcal enterotoxins-SE), gen liên quan đến hội chứng sốc nhiễm độc (Toxic shock syndrome toxin 1- tsst1), gen mã hóa coagulase gây đông huyết tương . Ngoài ra, nhiều gen khác chịu trách nhiệm việc S. aureus kháng lại nhiều kháng sinh và một số kiểu gen của S. aureus cũng liên quan đến những bệnh cảnh lâm sàng đặc thù do vi khuẩn này gây ra [57]. Trên thế giới, ngày càng có nhiều nghiên cứu dịch tễ học phân tử của S. aureus và mối liên quan giữa các yếu tố độc lực, các kiểu gen cũng như vai trò của các yếu tố này với tình trạng nhiễm trùng và kháng kháng sinh của của S. aureus [9]. . ‘ Xác định kiểu cách cư trú và gen độc lực của Staphylococcus aureus ở nhóm người làm việc tại một số cơ sở dịch vụ ăn uống” với hai mục tiêu sau: 1. Xác. 1. Xác định tỷ lệ mang, kiểu cách cư trú của S. aureus ở mũi và tay của nhóm người làm việc tại một số cơ sở dịch vụ ăn uống tại Hà Nội. 2. Xác định sự