Nghiên cứu một số đặc điểm dịch tễ, ứng dụng kit CATT chẩn đoán bệnh tiên mao trùng do trypanosoma evansi gây ra ở trâu tại huyện chi lăng, tỉnh lạng sơn và biện pháp phòng trị

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM NGUYỄN LÊ KHÁNH NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ, ỨNG DỤNG KIT CATT CHẨN ĐOÁN BỆNH TIÊN MAO TRÙNG DO TRYPANOSOMA EVANSI GÂY RA Ở TRÂU TẠI HUYỆN CHI LĂNG - TỈNH LẠNG SƠN VÀ BIỆN PHÁP PHÒNG TRỊ LUẬN VĂN THẠC SĨ THÚ Y Thái Nguyên, năm 2015 Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM NGUYỄN LÊ KHÁNH NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ, ỨNG DỤNG KIT CATT CHẨN ĐOÁN BỆNH TIÊN MAO TRÙNG DO TRYPANOSOMA EVANSI GÂY RA Ở TRÂU TẠI HUYỆN CHI LĂNG - TỈNH LẠNG SƠN VÀ BIỆN PHÁP PHÒNG TRỊ Ngành : Thú y Mã số: 60.64.01.01 LUẬN VĂN THẠC SĨ THÚ Y Người hướng dẫn khoa học: 1.TS Sa Đình Chiến GS.TS Nguyễn Thị Kim Lan Thái Nguyên, năm 2015 Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu chúng tơi Các số liệu kết nghiên cứu luận án hồn tồn trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Mọi thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc Tôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực đề tài nghiên cứu hoàn thành Luận án cảm ơn Tác giả luận văn Nguyễn Lê Khánh Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn ii LỜI CẢM ƠN Để hồn thành Luận văn này, cho phép tơi bày tỏ lòng kính trọng biết ơn sâu sắc tới TS Sa Đình Chiến GS TS Nguyễn Thị Kim Lan - Trường Đại học Nông Lâm Thái Nguyên trực tiếp hướng dẫn, bảo tận tình suốt q trình nghiên cứu hồn thành Luận văn Tôi xin chân thành cảm ơn Ban Chủ nhiệm Khoa Chăn nuôi Thú y, thầy, cô giảng dạy nghiên cứu Khoa Chăn nuôi Thú y; Bộ môn Bệnh động vật, Khoa Chăn nuôi Thú y, Trường Đại học Nông Lâm Thái Nguyên tận tình giúp đỡ tơi suốt q trình thực luận văn Tôi xin trân trọng cảm ơn Chi cục Thú y Lạng Sơn, Trạm Thú y huyện Chi Lăng tỉnh Lạng Sơn hộ chăn nuôi trâu địa bàn nghiên cứu tạo điều kiện giúp đỡ tơi q trình thực đề tài Tơi vơ biết ơn thành viên gia đình, bạn bè đồng nghiệp bên tôi, giúp đỡ tơi suốt q trình nghiên cứu hoàn thành Luận văn Lạng Sơn , ngày tháng năm 2015 Tác giả luận văn Nguyễn Lê Khánh Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn iii MỤC LỤC MỞ ĐẦU 1 Tính cấp thiết đề tài Mục tiêu đề tài Ý nghĩa khoa học ý nghĩa thực tiễn đề tài .2 3.1 Ý nghĩa khoa học .2 3.2 Ý nghĩa thực tiễn Những đóng góp đề tài Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 CƠ SỞ KHOA HỌC CỦA ĐỀ TÀI 1.1.1 Đặc điểm, hình thái, cấu trúc phân loại tiên mao trùng 1.1.2 Dịch tễ học tiên mao trùng 1.1.3 Đặc điểm bệnh lý lâm sàng bệnh 12 1.1.4 Chẩn đoán bệnh tiên mao trùng 15 1.1.5 Phòng trị bệnh tiên mao trùng 19 1.2 TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU BỆNH TIÊN MAO TRÙNG 22 1.2.1 Tình hình nghiên cứu nước 22 1.2.2 Tình hình nghiên cứu giới 25 Chương 2: ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .35 2.1 ĐỐI TƯỢNG VÀ VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU .35 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 35 2.1.2 Vật liệu nghiên cứu 35 2.2 ĐỊA ĐIỂM VÀ THỜI GIAN NGHIÊN CỨU…………………………… 36 2.3 NỘI DUNG NGHIÊN CỨU 36 2.3.1 Nghiên cứu số đặc điểm dịch tễ bệnh tiên mao trùng đàn trâu huyện Chi Lăng, tỉnh Lạng Sơn 36 2.3.2 Ứng dụng Kit CATT chẩn đoán bệnh tiên mao trùng huyện Chi Lăng 37 2.3.3 Xác định phác đồ điều trị bệnh tiên mao trùng đạt hiệu 37 2.4 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 37 2.4.1 Phương pháp thu thập mẫu 37 2.4.2 Phương pháp phát tiên mao trùng mẫu 38 Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn iv 2.4.3 Phương pháp định danh tiên mao trùng 39 2.4.4 Phương pháp ứng dụng Kit CATT chẩn đoán bệnh tiên mao trùng trâu 40 2.4.5 Phương pháp nghiên cứu khả mẫn cảm T evansi với số loại thuốc chuột bạch 41 2.4.6 Xây dựng phác đồ điều trị bệnh tiên mao trùng cho trâu 42 2.4.7 Một số quy định nghiên cứu đặc điểm dịch tễ bệnh tiên mao trùng 44 2.5 PHƯƠNG PHÁP XỬ LÝ SỐ LIỆU 44 Chương 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN .45 3.1 NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ BỆNH TIÊN MAO TRÙNG TRÊN ĐÀN TRÂU TẠI HUYỆN CHI LĂNG .45 3.1.1 Định danh loài tiên mao trùng phân lập từ đàn trâu huyện Chi Lăng 45 3.1.2 Tình hình nhiễm tiên mao trùng đàn trâu huyện Chi Lăng 46 3.1.3 Nghiên cứu ruồi, mòng hút máu truyền bệnh tiên mao trùng 55 3.2 ỨNG DỤNG KIT CATT TRONG CHẨN ĐOÁN BỆNH TIÊN MAO TRÙNG Ở HUYỆN CHI LĂNG 63 3.2.1 Kiểm tra độ nhạy, độ đặc hiệu Kit CATT 63 3.2.2 Kết chẩn đoán bệnh tiên mao trùng huyện Chi Lăng Kit CATT 65 3.3 XÁC ĐỊNH PHÁC ĐỒ ĐIỀU TRỊ BỆNH TIÊN MAO TRÙNG ĐẠT HIỆU QUẢ 67 3.3.1 Thử nghiệm thuốc điều trị bệnh tiên mao trùng diện hẹp 67 3.3.2 Thử nghiệm phác đồ điều trị bệnh tiên mao trùng diện rộng 68 3.3.3 Đề xuất biện pháp phòng chống bệnh T evansi đàn trâu huyện Chi Lăng 71 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ .72 Kết luận .72 Đề nghị 73 TÀI LIỆU THAM KHẢO 74 PHỤ LỤC Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn v DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU VIẾT TẮT CATT Card Agglutination Test for Trypanosomiasis EPC Kháng thể đối chứng dương ENC Kháng thể đối chứng âm T evansi Trypanosoma evansi T kiangsuensis Tabanus kiangsuensis TMT Tiên mao trùng T rubidus Tabanus rubidus SAT Slide Agglutination Test S calcitrans Stomoxys calcitrans SDS Sodium Dodecyl Sulfate spp species plural VSG Variant Surface Glycoprotein Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn vi DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 2.1 Cách xác định độ nhạy, độ đặc hiệu Kit 41 Bảng 2.2 Thuốc liều lượng dùng bố trí thí nghiệm 41 Bảng 2.3 Phác đồ điều trị bệnh tiên mao trùng cho trâu 43 Bảng 3.1 Kết định danh loài tiên mao trùng huyện Chi Lăng 45 Bảng 3.3 Tỷ lệ nhiễm tiên mao trùng trâu theo lứa tuổi 48 Bảng 3.4 Tỷ lệ nhiễm tiên mao trùng trâu theo mùa vụ 50 Bảng 3.5 Tỷ lệ phát bệnh tiên mao trùng trâu theo mùa vụ 52 Bảng 3.6 Tỷ lệ nhiễm tiên mao trùng trâu theo tính biệt 54 Bảng 3.7 Kết định danh, phân bố tần suất xuất lồi ruồi, mòng hút máu 55 Bảng 3.8 Tỷ lệ lồi ruồi, mòng số mẫu thu thập địa phương nghiên cứu 58 Bảng 3.9 Quy luật hoạt động theo tháng lồi ruồi, mòng hút máu 61 Bảng 3.10.Quy luật hoạt động ngày loài ruồi, mòng hút máu 62 Bảng 3.11 Xác định số trâu nhiễm không nhiễm TMT Chi Lăng 64 Bảng 3.12 Kết đánh giá độ nhạy, độ đặc hiệu Kit CATT 64 Bảng 3.13 Tỷ lệ trâu nhiễm tiên mao trùng huyện Chi Lăng qua ứng dụng kit CATT chẩn đoán 66 Bảng 3.14 Thử nghiệm phác đồ điều trị bệnh tiên mao trùng cho trâu diện hẹp 67 Bảng 3.15 Thử nghiệm phác đồ điều trị bệnh tiên mao trùng diện rộng 69 Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn vii DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 3.1 Biểu đồ tỷ lệ nhiễm tiên mao trùng trâu huyện Chi Lăng .48 Hình 3.2 Đồ thị tỷ lệ nhiễm tiên mao trùng theo lứa tuổi 49 Hình 3.3 Biểu đồ tỷ lệ nhiễm tiên mao trùng trâu theo mùa vụ 51 Hình 3.4 Biểu đồ tỷ lệ phát bệnh tiên mao trùng trâu theo mùa vụ 52 Hình 3.5 Biểu đồ tỷ lệ nhiễm tiên mao trùng trâu theo tính biệt 54 Hình 3.6 Biểu đồ tỷ lệ lồi ruồi, mòng địa phương nghiên cứu 59 Hình 3.7 Biểu đồ điều trị bệnh tiên mao trùng diện rộng 70 Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn MỞ ĐẦU Tính cấp thiết đề tài Lồi tiên mao trùng Trypanosoma evansi ký sinh trùng đơn bào đường máu (Protozoa) thuộc lớp trùng roi (Flagellata) có tầm quan trọng lớn ngành Thú y Bệnh Trypanosoma evansi thấy phổ biến loài gia súc như: trâu, bò, dê, ngựa, hươu, lạc đà…, bệnh gây nhiều thiệt hại kinh tế nước châu Phi, Nam Mỹ châu Á vùng có số lượng gia súc chết hàng năm lớn Trypanosoma evansi gây nên (Brun R cs., 1998 [31]) Theo Phan Văn Chinh (2006) [1]: Bệnh tiên mao trùng xuất nhiều vùng nước, với tỷ lệ mắc cao: trâu 13 – 30 %, bò – 14 %, tỷ lệ gia súc chết số gia súc mắc bệnh lên tới 6,3 – 20 % Trong năm gần đây, với phát triển kinh tế quốc dân, ngành chăn ni nói chung chăn ni trâu nói riêng có nh ững bước phát triển vượt bậc, trở thành ngành sản xuất quan trọng, bước góp phần cung cấp thực phẩm cho xã hội có đóng góp tích cực vào mục tiêu xóa đói giảm nghèo Chăn ni trâu nguồn cung cấp thực phẩm thịt, sữa cho người, sức kéo nguồn phân bón lớn cho sản xuất nông nghiệp Hiện nay, nhiều bệnh vi trùng vi rút gây có vắc xin phòng bệnh Song hầu hết bệnh ký sinh trùng chưa có vắc xin phòng bệnh nên bệnh xảy phổ biến gây thiệt hại lớn cho chăn ni Trâu, bò mắc bệnh tiên mao trùng thường gầy yếu, chậm sinh trưởng, phát triển Có nhiều trâu, bò mang mầm bệnh khơng phát bệnh, sức đề kháng giảm lúc bệnh tiên mao trùng phát gây chết nhiều gia súc suy nhược, thiếu máu, khả lao tác, giảm phẩm chất thịt, đồng thời hội để bệnh truyền nhiễm kế phát, gây thiệt hại lớn cho chăn nuôi Chi Lăng huyện có địa hình đồi núi chiếm 80%, khí hậu nhiệt đới gió mùa, thời tiết nóng ẩm, mưa nhiều điều kiện thuận lợi cho ruồi, mòng (vật mơi giới trung gian truyền bệnh tiên mao trùng) phát triển Sự lây lan bệnh phụ Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn ORIGIN tagaacagtt agacgagctg 61 gacttttctg ccaaggcgct 121 cgttggcgta atgtagctct 181 taaaggcaac acgggccaag 241 ccacggcacg ctaagttaaa 301 actaaagctc gcgcagcaag 361 agggttagca cgaaagacaa 421 aagcagggta cgatttcatc 481 ggcgctaaaa gcaaagccga 541 cggcacaaat aagccaacta 601 tgacacctcg atggcttcac 661 aaaactaaca gcggggtgtt 721 taaagcaata ccagcaacat 781 caaggtgcac cagaacgagc 841 agaattttcc taggccgaac 901 acacgcagca aactcacaga 961 agaaaccctt acgttgagga 1021 atgcgcacga cgcccataac 1081 cgaaaaatat atttaaaaaa 1141 agaggagata aaaccgtcaa 1201 ctcgatcgac cttacacaat 1261 agaaaagtta aaaacaaagc 1321 aagcacaaaa gagctgaatg 1381 caaagatggt tggatccgga 1441 ttttgtcaaa caaccacaaa 1501 caccacagga cggttttgct 1561 tttttaagtt aaaactttct 1621 gatatatttt EVEGVKAENDGKTTTNTTGSNSLLIKASPLFLAVLLF" tctgtactat attgattacc cctgttttca gcgcttctag cgtctgtgcg acataacgca aaccacagga aacatgcaaa ctcttatttg tactgtatcg gagcacaacg gatgccgcca gtctggaagc cattgtgcga actcgcggca gcgaccagga gcgcacttcg cagcgatcga aaatagcgtc gaaacgtaca ttgatttacg cggcggccaa aggcagcacc accgaagcaa gcggccgcag atagacacat acgagcagcg gccaccacgg attctgcccg cagttgccta tggcggcgaa gtcgcagggg tttctaaagc acgcggttgg caacagcaag ttttgtgtgg gccgacggta acaacgaaat cgacgcgcta gggtgcggcg gccccaggag acagctacct agagggcgac ataagcgccg gccgttgcag cgggcaatgg acatgtagga agcaacacct accggcaacg acggcgaggc cggcgggatc aaaatcgcga ctcgcacacg gcctaatcga aggcaaagtt gacgaccagc aataatttcg gacaaggaaa agcacaccac actgattatt ctaatcaatc tgaagaggtt ggaaatggag aaggtaccgg aagactttag cagacgaccc ggccgcaacg gcaaccctaa acaagcaaca agaagataac aacaacagaa ccaccgaaac tttggcaagg acaagtctaa aatcaaggag ttgtggaaca gaaggaacag aagatgacac aacaaagaaa gtagcgctag aagttgcaac aggcattgga gttttacaca gcgcgagccg aaaaaagaag tagataagtt gcaagcagaa tcagatgcaa gttactgaaa cagatgaaac ttgcgaaaaa aaaggaacag tgtaaattga ccggcgttgt cgacaataaa aagtgcgtag aaggaagtag agggagttaa agcggaaaat gatggaaaaa agcaattctc ttctcatcaa agcttcccct ctttttcttg tttcccctct ttttcttcct ttaaaattct tgctacttga aacacct Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn Trypanosoma evansi variable surface glycoprotein (VSG) mRNA, partial cds GenBank: EF495337.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS EF495337 1432 bp mRNA linear INV 28- JUN-2010 DEFINITION Trypanosoma evansi variable surface glycoprotein (VSG) mRNA, partial cds ACCESSION EF495337 VERSION EF495337.1 KEYWORDS SOURCE Trypanosoma evansi ORGANISM GI:144601471 Trypanosoma evansi Eukaryota; Euglenozoa; Kinetoplastida; Trypanosomatidae; Trypanosoma REFERENCE AUTHORS (bases to 1432) Sengupta,P.P., Balumahendiran,M., Suryanaryana,V.V., Raghavendra,A.G., Shome,B.R., Gajendragad,M.R and Prabhudas,K TITLE PCR-based diagnosis of surra-targeting VSG gene: experimental studies in small laboratory rodents and buffalo JOURNAL PUBMED REFERENCE AUTHORS Vet Parasitol 171 (1-2), 22-31 (2010) 20388585 (bases to 1432) Sengupta,P.P., Balumahendiran,M., Raghavendra,A.G., Suryanarayana,V.V.S., Gajendragad,M.R and Prabhudas,K TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (16-MAR-2007)Parasitology,PDADMAS,IVRI FEATURES source gene CDS Campus,Hebbal, Bangalore, Karnataka 560 024, India Location/Qualifiers 1432 /organism="Trypanosoma evansi" /mol_type="mRNA" /host="buffalo" /db_xref="taxon:5697" /country="India" >1432 /gene="VSG" >1432 /gene="VSG" /note="RoTat 1.2" Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn /codon_start=1 /product="variable surface glycoprotein" /protein_id="ABP01683.1" /db_xref="GI:144601472" /translation="MQTKALVGVLLFVLYRSTTDAANVALKGNVWKPLCELAAATRNG PSHGTAHFAAIENSVETYTKLKLKLLIYAAAKGSTTEASAARGLAAAADRHIRAAATT AKDKSRVILPAVAYGGEVAGAISSALKFLKHAVGNSKFCVGKADGTNADGNNEIDALG CGEANYDTSAPGDSYLEGDISADGFTKLTAVAAGNGHVGSNTCGVFKAITGNDGEAGG IKIATSNIKVHLAHGLIEGKVDDQPERAEFSNNFGQGKAHHTDYLGRTHAALINLKRL EMEKVPELTEETLKTLADDPAATATLNVEECARTSNKKITTTEPPKPPITEKYFGKDK SKIKELWNNLKKEEIEGTEDDTTKKVALETVNSIDKLQQALEFYTARAAYTIEKLKKE VDKLQAESDAKNKASTKVTETDETCEKKEVDKCEKPCKVVEANGAKKCTLDKDEAKKL EEKTDGKTNTTGSNSLLIKASPLFLAV" ORIGIN catgcaaacc aaggcgctcg ttggcgtact cttatttgta ctgtatcgga gcacaacgga 61 tgccgccaat gtagctctta aaggcaacgt ctggaagcca ttgtgcgaac tcgcggcagc 121 gaccaggaac gggccaagcc acggcacggc gcacttcgca gcgatcgaaa atagcgtcga 181 aacgtacact aagttaaaac taaagctctt gatttacgcg gcggccaaag gcagcaccac 241 cgaagcaagc gcagcaagag ggttagcagc ggccgcagat agacacatac gagcagcggc 301 caccacggcg aaagacaaaa gcagggtaat tctgcccgca gttgcctatg gcggcgaagt 361 cgcaggggcg atttcatcgg cgctaaaatt tctaaagcac gcggttggca acagcaagtt 421 ttgtgtgggc aaagccgacg gcacaaatgc cgacggtaac aacgaaatcg acgcgctagg 481 gtgcggcgaa gccaactatg acacctcggc cccaggagac agctacctag agggcgacat 541 aagcgccgat ggcttcacaa aactaacagc cgttgcagcg ggcaatggac atgtaggaag 601 caacacctgc ggggtgttta aagcaataac cggcaacgac ggcgaggccg gcgggatcaa 661 aatcgcgacc agcaacatca aggtgcacct cgcacacggc ctaatcgaag gcaaagttga 721 cgaccagcca gaacgagcag aattttccaa taatttcgga caaggaaaag cacaccacac 781 tgattattta ggccgaacac acgcagcact aatcaatctg aagaggttgg aaatggagaa 841 ggtaccggaa ctcacagaag aaacccttaa gactttagca gacgacccgg ccgcaacggc 901 aaccctaaac gttgaggaat gcgcacgaac aagcaacaag aagataacaa caacagaacc 961 accgaaaccg cccataaccg aaaaatattt tggcaaggac aagtctaaaa tcaaggagtt 1021 gtggaacaat ttaaaaaaag aggagataga aggaacagaa gatgacacaa caaagaaagt 1081 agcgctagaa accgtcaact cgatcgacaa gttgcaacag gcattggagt tttacacagc 1141 gcgagccgct tacacaatag aaaagttaaa aaaagaagta gataagttgc aagcagaatc 1201 agatgcaaaa aacaaagcaa gcacaaaagt tactgaaaca gatgaaactt gcgaaaaaaa Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn 1261 agaggtagat aaatgcgaga agccatgcaa ggttgtcgaa gcgaatggtg ctaaaaagtg 1321 cacattggac aaggatgagg ccaaaaaatt agaagaaaag acagatggta aaacaaacac 1381 cacaggaagc aattctcttc tcatcaaagc ttcccctctt tttcttgcgg tt Trypanosoma evansi variable surface glycoprotein (VSG) mRNA, partial cds GenBank: EF495337.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS EF495337 1432 bp mRNA linear INV 28- JUN-2010 DEFINITION Trypanosoma evansi variable surface glycoprotein (VSG) mRNA, partial cds ACCESSION EF495337 VERSION EF495337.1 KEYWORDS SOURCE Trypanosoma evansi ORGANISM GI:144601471 Trypanosoma evansi Eukaryota; Euglenozoa; Kinetoplastida; Trypanosomatidae; Trypanosoma REFERENCE AUTHORS (bases to 1432) Sengupta,P.P., Balumahendiran,M., Suryanaryana,V.V., Raghavendra,A.G., Shome,B.R., Gajendragad,M.R and Prabhudas,K TITLE PCR-based diagnosis of surra-targeting VSG gene: experimental studies in small laboratory rodents and buffalo JOURNAL PUBMED REFERENCE AUTHORS Vet Parasitol 171 (1-2), 22-31 (2010) 20388585 (bases to 1432) Sengupta,P.P., Balumahendiran,M., Raghavendra,A.G., Suryanarayana,V.V.S., Gajendragad,M.R and Prabhudas,K TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (16-MAR-2007)Parasitology,PDADMAS,IVRI FEATURES source Campus,Hebbal, Bangalore, Karnataka 560 024, India Location/Qualifiers 1432 /organism="Trypanosoma evansi" /mol_type="mRNA" /host="buffalo" /db_xref="taxon:5697" /country="India" Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn gene CDS >1432 /gene="VSG" >1432 /gene="VSG" /note="RoTat 1.2" /codon_start=1 /product="variable surface glycoprotein" /protein_id="ABP01683.1" /db_xref="GI:144601472" /translation="MQTKALVGVLLFVLYRSTTDAANVALKGNVWKPLCELAAATRNG PSHGTAHFAAIENSVETYTKLKLKLLIYAAAKGSTTEASAARGLAAAADRHIRAAATT AKDKSRVILPAVAYGGEVAGAISSALKFLKHAVGNSKFCVGKADGTNADGNNEIDALG CGEANYDTSAPGDSYLEGDISADGFTKLTAVAAGNGHVGSNTCGVFKAITGNDGEAGG IKIATSNIKVHLAHGLIEGKVDDQPERAEFSNNFGQGKAHHTDYLGRTHAALINLKRL EMEKVPELTEETLKTLADDPAATATLNVEECARTSNKKITTTEPPKPPITEKYFGKDK SKIKELWNNLKKEEIEGTEDDTTKKVALETVNSIDKLQQALEFYTARAAYTIEKLKKE VDKLQAESDAKNKASTKVTETDETCEKKEVDKCEKPCKVVEANGAKKCTLDKDEAKKL EEKTDGKTNTTGSNSLLIKASPLFLAV" ORIGIN catgcaaacc aaggcgctcg ttggcgtact cttatttgta ctgtatcgga gcacaacgga 61 tgccgccaat gtagctctta aaggcaacgt ctggaagcca ttgtgcgaac tcgcggcagc 121 gaccaggaac gggccaagcc acggcacggc gcacttcgca gcgatcgaaa atagcgtcga 181 aacgtacact aagttaaaac taaagctctt gatttacgcg gcggccaaag gcagcaccac 241 cgaagcaagc gcagcaagag ggttagcagc ggccgcagat agacacatac gagcagcggc 301 caccacggcg aaagacaaaa gcagggtaat tctgcccgca gttgcctatg gcggcgaagt 361 cgcaggggcg atttcatcgg cgctaaaatt tctaaagcac gcggttggca acagcaagtt 421 ttgtgtgggc aaagccgacg gcacaaatgc cgacggtaac aacgaaatcg acgcgctagg 481 gtgcggcgaa gccaactatg acacctcggc cccaggagac agctacctag agggcgacat 541 aagcgccgat ggcttcacaa aactaacagc cgttgcagcg ggcaatggac atgtaggaag 601 caacacctgc ggggtgttta aagcaataac cggcaacgac ggcgaggccg gcgggatcaa 661 aatcgcgacc agcaacatca aggtgcacct cgcacacggc ctaatcgaag gcaaagttga 721 cgaccagcca gaacgagcag aattttccaa taatttcgga caaggaaaag cacaccacac 781 tgattattta ggccgaacac acgcagcact aatcaatctg aagaggttgg aaatggagaa 841 ggtaccggaa ctcacagaag aaacccttaa gactttagca gacgacccgg ccgcaacggc 901 aaccctaaac gttgaggaat gcgcacgaac aagcaacaag aagataacaa caacagaacc 961 accgaaaccg cccataaccg aaaaatattt tggcaaggac aagtctaaaa tcaaggagtt 1021 gtggaacaat ttaaaaaaag aggagataga aggaacagaa gatgacacaa caaagaaagt 1081 agcgctagaa accgtcaact cgatcgacaa gttgcaacag gcattggagt tttacacagc Số hóa Trung tâm Học liệu – ĐHTN http://www.lrc.tnu.edu.vn 1141 gcgagccgct aagcagaatc 1201 agatgcaaaa gcgaaaaaaa 1261 agaggtagat ctaaaaagtg 1321 cacattggac aaacaaacac 1381 cacaggaagc tacacaatag aaaagttaaa aaaagaagta gataagttgc aacaaagcaa gcacaaaagt tactgaaaca gatgaaactt aaatgcgaga agccatgcaa ggttgtcgaa gcgaatggtg aaggatgagg ccaaaaaatt agaagaaaag acagatggta aattctcttc tcatcaaagc ttcccctctt tttcttgcgg tt Trypanosoma evansi clone RoTat1.2 variable surface glycoprotein (VSG) mRNA, complete cds GenBank: AF317914.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS AF317914 1637 bp mRNA linear INV 02MAY-2001 DEFINITION Trypanosoma evansi clone RoTat1.2 variable surface glycoprotein (VSG) mRNA, complete cds ACCESSION AF317914 VERSION AF317914.1 GI:13925897 KEYWORDS SOURCE Trypanosoma evansi ORGANISM Trypanosoma evansi Eukaryota; Euglenozoa; Kinetoplastida; Trypanosomatidae; Trypanosoma REFERENCE (bases to 1637) AUTHORS Urakawa,T., Verloo,D., Buscher,P and Majiwa,P TITLE Cloning and expression in insect cells of the T.evansi RoTat1.2 VSG JOURNAL Unpublished REFERENCE (bases to 1637) AUTHORS Urakawa,T., Verloo,D., Buscher,P and Majiwa,P TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted(02-NOV-2000)Lab 2,ILRI,Naivasha Road,P.O.Box 30709, Nairobi, Kenya FEATURES Location/Qualifiers source 1637 /organism="Trypanosoma evansi" /mol_type="mRNA" /db_xref="taxon:5697" /clone="RoTat1.2" gene 1637 /gene="VSG" misc_RNA