Hầu hết các phytase thực vật và vi sinh vật bắt đầu mất dần hoạt tính ở nhiệt độ xung quanh 55-60o
63,3oC, sự biến tính đi kèm với sự thay đổi cấu trúc không phục hồi và mất 70-80% hoạt tính. Như vậy, những hạn chế về khả năng chịu nhiệt một yếu tố quyết định đến việc ứng dụng phytase trong quá trình sản xuất thức ăn chăn nuôi cũng như thực phẩm do hầu hết các thức ăn chăn nuôi đều được đóng viên ở nhiệt độ khoảng 80-90oC (để tránh sự nhiễm khuẩn Salmonella) và các thực phẩm của người cũng qua các quá trình chế biến như đun sôi hay nướng. Chính vì thế mà những nghiên cứu mở rộng và phát triển được hướng trực tiếp đến việc sàng lọc các chủng ưa nhiệt và siêu ưa nhiệt sinh các enzyme chịu nhiệt, gây đột biến các enzyme ưa nhiệt trung bình để làm tăng tính bền nhiệt của chúng và thiết kế các cấu trúc vỏ hóa học bảo vệ enzyme khỏi sự biến tính của nhiệt độ. Thành công đầu tiên của Lehmann và cộng sự năm 2000 đã tạo ra một loại phytase với nhiệt độ biến tính Tm=89,3oC từ một loại phytase gốc của A. fumigates là một loại phytase có nhiệt độ Tm chỉ là 62,5oC nhưng không có khả năng gấp nếp trở lại cấu trúc có hoạt tính cao ban đầu sau khi làm lạnh. Có khoảng 12 yếu tố bên ngoài có ảnh hưởng đến tính bền nhiệt của phytase trong suốt quá trình đóng viên. Tuy nhiên cũng có một số các thành phần bên trong hạt có thể bảo vệ hoạt tính phytase. Skoglund và cộng sự (1997) đã chỉ ra rằng phytase có sẵn trong lúa mỳ- đậu Hà Lan- dầu hạt cải trong chế độ ăn của lợn không bị ảnh hưởng sau quá trình đóng viên ở 81oC. Ở gạo chuyển gen biểu hiện phytase của A. fumigates được đun sôi trong 20 phút, chỉ 8% hoạt tính enzyme ban đầu được giữ lại, hoạt tính này thấp hơn hẳn so với hoạt tính còn giữ lại của các chế phẩm enzyme thương mại của phytase từ nấm sợi sau khi được xử lý đun sôi cùng một khoảng thời gian. Điều này chứng tỏ rằng ở thực vật, sự biểu hiện ở thực vật có thể ảnh hưởng đến quá trình gấp nếp lại của enzyme hoặc tạo ra một môi trường không thuận lợi cho quá trình gấp nếp lại của enzyme [149].