Cơ chế chính sách cho hoạt động ĐTXDCB của nhà nƣớc nói riêng và cho ĐTXDCB nói chung trong thời kỳ đổi mới đã có những bƣớc phát triển đáng kể. Nó tạo điều kiện cho ĐTXDCB của nhà nƣớc hoạt động ngày càng thuận lợi, đúng hƣớng và có hiệu quả hơn. Tuy nhiên, nhìn chung cơ chế chính sách vẫn còn nhiều yếu kém, bất cập thể hiện trên các mặt sau :
+ Tƣ duy quan liêu bao cấp vẫn còn nặng nề
+ Vẫn coi ĐTXDCB của nhà nƣớc là chủ đạo và chiếm ƣu thế trong hoạt động ĐTXDCB nói chung.
+ Cơ chế chính sách thiếu đồng bộ, thiếu khoa học và chƣa nhất quán. Chính sách thiếu ổn định lâu dài mà thay đổi luôn luôn làm cho hoạt động ĐTXDCB khó khăn, lúng túng và thiếu ổn định.
+ Thiếu một chính sách tổng thể và các văn bản quy phạm pháp luật chuyên ngành tạo thành một hành làng pháp lý cho hoạt động ĐTXDCB
+ Chính sách khuyến khích, hỗ trợ ĐTXDCB cho khu vực vốn ngoài nhà nƣớc còn thiếu hấp dẫn, chƣa đủ độ tin cậy với các nhà đầu tƣ
+ Cơ chế chính sách còn thể hiện thiếu công bằng, phân biệt đối xử giữa đầu tƣ nhà nƣớc với các nhà đầu tƣ khác
+ Công tác kiểm tra chất lƣợng, nghiệm thu khối lƣợng về thanh quyết toán công trình còn mang nặng tính hình thức, hợp lý hoá.
+ Cơ chế chính sách đối với chủ đầu tƣ, chủ dự án và trách nhiệm cá nhân trong ĐTXDCB của nhà nƣớc không rõ ràng minh bạch và thiếu chế tài.
+ Cơ chế kiểm tra giám sát, xử phạt, khen thƣởng trong ĐTXDCB của nhà nƣớc không đủ mạnh và thiếu thuyết phục