Để có thể đề xuất các giải pháp nhằm nâng cao hiệu quả hoạt động ĐTXDCB của nhà nƣớc, cần phải xác định đƣợc nguyên nhân làm giảm
hiệu quả, gây thất thoát, lãng phí. Có nhiều nguyên nhân dẫn đến làm giảm hiệu quả đầu tƣ, nhƣng trƣớc hết phải kể đến các nguyên nhân chính sau:
2.3.3.1. Quy hoạch
ĐTXDCB mà không có quy hoạch có cơ sở khoa học sẽ dễ xảy ra tình trạng đầu tƣ sai, lãng phí thất thoát lớn, kiến trúc tổng thể vỡ vụn, manh mún, khó có khả năng hiệu quả xét trong cả nền kinh tế. ĐTXDCB mà quy hoạch sai cũng dẫn đến kết quả tồi tệ không kém. Báo cáo của Chính phủ về thực hiện quy hoạch, kế hoạch đầu tƣ theo ngành và vùng lãnh thổ trong cả nƣớc, kết quả khắc phục tình trạng đầu tƣ dàn trải, tình hình nợ đọng vốn ĐTXDCB, hiệu quả thấp và chống thất thoát trong XDCB năm 2005, thừa nhận 5 yếu kém trong việc xây dựng và thực hiện quy hoạch, bao gồm: Chất lƣợng quy hoạch chƣa cao, chƣa có tầm nhìn xa (tiêu biểu là ngành điện, xi măng, hệ thống cảng, quy hoạch đô thị); Quy hoạch chƣa phù hợp với cơ chế thị trƣờng, xuất phát từ ý muốn chủ quan, chƣa chú ý thu hút sự tham gia của các thành phần kinh tế; Việc lồng ghép các quy hoạch ngành chƣa gắn với quy hoạch vùng, quy hoạch vùng chƣa gắn với quy hoạch chung của cả nƣớc; Tính cục bộ, khép kín trong các quy hoạch gây lãng phí nguồn lực do phát triển chồng chéo; Quy hoạch chƣa đƣợc thƣờng xuyên cập nhật, bị lạc hậu và không thể làm căn cứ để xây dựng kế hoạch.
Báo cáo số 03-BKH/TĐ&GSĐT ngày 3/1/2005 của Bộ Kế hoạch & đầu tƣ qua tổng hợp từ 1.505 dự án công trình trong thời gian qua cho thấy các cơ quan chức năng đã phát hiện nhiều sai phạm trong việc lập dự án ( lập dự án chƣa có chủ trƣơng đầu tƣ và lập dự án không có quy hoạch tổng thể, không lập báo cáo đầu tƣ hoặc báo cáo nghiên cứu tiền khả thi ; đầu tƣ không dựa trên kế hoạch tông thể, vi phạm quy định về thẩm quyền phê duyệt vốn đầu tƣ). Có 176 dự án vi phạm, chiếm tỷ lệ 11,6%. Một số địa phƣơng phát hiện tỷ lệ vi phạm quy định về thẩm định dự án khá cao nhƣ Hải Dƣơng 66,7%, Kiên Giang 100%.
Nguyên nhân chủ yếu để xảy ra tình trạng này là : Thiếu các văn bản pháp lý để quản lý nhà nƣớc về công tác quy hoạch ; nhận thức về quy hoạch trong điều kiện kinh tế thị trƣờng và hội nhập quốc tế còn nhiều điểm chƣa đƣợc làm rõ ; tính liên kết giữa quy hoạch và kế hoạch chƣa cao và đồng bộ, có tình trạng quy hoạch treo ; kinh phí dành cho công tác điều tra cơ bản, công tác dự báo phục vụ nghiên cứu và xây dựng quy hoạch thiếu ; khâu thẩm định và ra quyết định phê duyệt , quản lý, kiểm tra, giám sát và thực hiện quy hoạch còn nhiều hạn chế.