Doanh thu của Vietnam Arlines tăng nhanh qua các năm từ 642 tỷ đồng năm 1991 tới 4006 tỷ đồng năm 1996, tốc độ tăng tởng bình quân một năm là 44,2%. Năm 1991, Vietnam Airlines nộp ngân sách 36 tỷ đồng thì năm 1996 đã nộp 238 tỷ đồng. Lợi nhuận sau thuế lợi tức tăng từ 123 tỷ đồng năm 1991
lên 162 tỷ đồng năm 1996. Nhờ vậy, lợi nhuận sau thuế lợi tức và nộp ngân sách đã tăng lên từ 160 tỷ (năm 1991) lên 400 tỷ (năm 1996).
Năm 1996 là năm đầu hoạt động của TCT HKVN. Tổng doanh thu của TCT đạt 5.232 tỷ đồng, trong đó vận tải hàng không chiếm tỷ trọng lớn nhất 73,1%. Tổng số nộp ngân sách 400,9 tỷ đồng trong đó lớn nhất là Vietnam Airlines (61,2%). Ngoài ra, Công ty xăng dầu hàng không, Công ty cung ứng dịch vụ sân bay Tân Sơn Nhất cũng có mức nộp ngân sách lớn. Một số đơn vị hoạt động gặp nhiều khó khăn, hiệu quả cha cao nh Công ty bay dịch vụ hàng không, Công ty vận tải ô tô hàng không. Lợi nhuận sau thuế lợi tức của toàn TCT năm 1996 đạt 204 tỷ đồng. Các đơn vị có mức lợi nhuận sau thuế lợi tức cao là Vietnam Airlines, SASCO, VINAPCO. Tỷ suất lợi nhuận trên tổng doanh thu đạt 11,56%.
Năm 1997, do ảnh hởng mạnh của khủng hoảng tài chính tiền tệ, các tác động tiêu cực của thị trờng bên ngoài, đầu t trong nớc giảm sút, tốc độ tăng tr- ởng GDP giảm... cùng với những lý do không thuận lợi xuất phát từ nội tại của TCT, tình hình sản xuất kinh doanh của TCT bị chững lại, doanh thu đạt mức 161 tỷ đồng nhng lợi nhuận sau thuế lợi tức chỉ còn 19 tỷ đồng, trong đó, Vietnam Airlines lỗ 39 tỷ đồng. Trong năm 1998, do ảnh hởng của cuộc khủng hoảng tài chính, tiền tệ và sự cạnh tranh khốc liệt giữa các hãng hàng không vẫn tiếp tục đã tác động mạnh đến hoạt động kinh doanh vận tải của TCT. Doanh thu của TCT còn nhỏ và lợi nhuận trớc thuế lợi tức vẫn ở con số âm 145,9 tỷ đồng.
Năm 1999 là một năm đầy thử thách đối với TCT HKVN. Bối cảnh cạnh tranh khốc liệt với tiềm lực tài chính và lao động còn yếu, chất lợng sản phẩm cha cao cộng với thiên tai lũ lụt xảy ra liên tiếp ở các tỉnh miền Trung đã ảnh hởng nhiều đến kế hoạch khai thác của Vietnam Airlines, đặc biệt là việc vận chuyển khách du lịch. Tuy nhiên sau hai năm kinh doanh trong điều kiện cực kỳ khó khăn, năm 1999 đánh dấu bớc khởi đầu trở lại của hoạt động kinh doanh có hiệu quả của Hãng. Vận chuyển hành khách đạt gần 2,6 triệu lợt khách (tăng 5,4% so với năm 1998 và vợt 3,5% so với kế hoạch). Vận chuyển hàng hóa đạt 38775 tấn (đạt 100% kế hoạch). Tình hình tài chính, đặc biệt là
khả năng thanh toán, cân đối tiền tệ đợc đảm bảo tốt. Tổng doanh thu của TCT đạt gần 6800 tỷ đồng, tăng 5% so với năm 1998, đặc biệt lợi nhuận trớc thuế - ớc vợt kế hoạch 162%, nộp ngân sách nhà nớc 1090 tỷ đồng.
Năm 2000, thị trờng vận tải hàng không đã có sự phục hồi mạnh mẽ sau giai đoạn khủng hoảng từ năm 1997, đặc biệt là thị trờng quốc tế. Thị trờng nội địa tăng nhẹ, chủ yếu trên các đờng bay trục Bắc -Nam. Tuy nhiên đây là mức tăng trởng bị giới hạn bởi năng lực cung ứng trên các đờng bay lẻ địa ph- ơng có nhiều hạn chế. Tổng kết năm 2000, Vietnam Airlines chuyên chở đợc 2.861.667 lợt khách, tăng 12,1 % so với cùng kỳ năm 1999, vận chuyển 45.886 tấn hàng hoá, tăng 11,37% so với cùng kỳ năm 1999, trong đó hàng hoá quốc tế đạt 23054 tấn (tăng 14,81%). Tổng doanh thu của TCT đạt 8.100 tỷ đồng, trong đó đóng góp của vận tải hàng không là 4.973 tỷ đồng.
Năm 2001 là một năm đầy thử thách đối với ngành hàng không quốc tế nói chung và HKVN nói riêng. Do ảnh hởng của sự kiện 11/9, thị trờng vận chuyển hàng không Việt Nam trong 3 tháng cuối năm giảm sút khoảng 20% so với 9 tháng đầu năm 2001. Mặc dù vậy tổng thị trờng hàng không Việt Nam tính đến cuối năm 2001 vẫn đạt 3.395.729 khách, tăng so với năm 2000 là 11.8%, trong đó khách quốc tế là 26,18%, nội địa là 13,43%. Vận chuyển hàng hoá và bu kiện đạt 51.396 tấn, trong đó vận chuyển hàng hoá và bu kiện quốc tê đạt 23.399 tấn, chiếm 54,47% tổng khối lợng hàng hoá vận chuyển. Tổng doanh thu của TCT năm 2001 đạt khoảng 9.256,2 tỷ đồng, trong đó đóng góp của vận tải hàng không là 9.090 tỷ đồng; nộp ngân sách Nhà nớc 5.326 tỷ đồng, vợt 37% so với kế hoạch; lợi nhuận trớc thuế đạt 371 tỷ đồng.
Trong năm 2002, TCT HKVN đã hoàn thành kế hoạch mua 03 chiếc máy bay ATR-72, hiện đang thực hiện dự án mua 05 máy bay tầm trung A-321 và 04 máy bay tầm trung xa. Năm 2002, toàn ngành đã hoàn thành vợt mức chỉ tiêu kế hoạc đề ra, thực hiện 38.000 chuyến bay trong nớc và quốc tế; vận chuyển đợc 04 triệu lợt hành khách, tăng 18% và 65.000 tấn hàng hoá, tăng 26% so với năm 2001; doanh thu đạt trên 11.000 tỷ đồng, nộp ngân sách trên 6.000 tỷ; lợi nhuận trớc thuế đạt 370 tỷ đồng, tăng 15% so với năm 2001.
Các con số thống kê trong quý I/ 2003 cho phép có một cái nhìn lạc quan về một năm hoàn thành kế hoạch với tốc độ tăng trởng từ 15 - 17%. Tuy nhiên, dịch viêm đờng hô hấp cấp (SARS) đã làm đảo lộn mọi dự báo của các chuyên gia và khiến mọi kỳ vọng về một thị trờng tăng trởng mạnh trong năm 2003 trở nên xa vời. Dịch SARS nh một cơn cuồng phong với tâm bão nằm trong những khu vực nhạy cảm nhất của thị trờng vận tải hàng không Việt Nam nói riêng và khu vực nói chung (Đông Bắc á, Đông Nam á) đã khiến toàn bộ thị trờng sụt giảm và kéo theo đó là tình trạng khó khăn của các hãng hàng không, các cảng hàng không cũng nh các công ty quản lý không lu.
Sáu tháng đầu năm 2003, trên các đờng bay quốc tế ra vào Việt Nam, các hãng hàng không đã vận chuyển 1,69 triệu khách, giảm 16,1% so cùng kỳ năm 2002. Thị trờng hàng hoá vẫn giữ đợc mức tăng trởng với hơn 67 nghìn tấn, tăng 36,6% so cùng kỳ 2002 với thị phần áp đảo về các hãng hàng không nớc ngoài. 6 tháng đầu năm, Vietnam Airlines đã thực hiện đợc 20810 chuyến bay, chuyên chở đợc 1.793.153 lợt hành khách, đạt 40% kế hoạch năm, nhng vẫn giảm 8% so với cùng kỳ năm trớc; vận chuyển trên 38.580 tấn hàng hoá, trong đó hàng hoá quốc tế đạt 14.335 tấn, tăng 10,6% so cùng kỳ năm 2002. Doanh thu của TCT vẫn đạt trên 5400 tỷ đồng, chiếm 42% kế hoạch năm và tăng 6,2% so với cùng kỳ năm trớc, nộp Ngân sách Nhà nớc 276,5 tỷ đồng.