Lãi suất là một yếu tố quan trọng mà không chỉ ngân hàng mà SMEs cũng rất quan tâm. Chính vì vậy, Chi nhánh cần phải đưa ra những mức lãi suất đa dạng, linh hoạt cho từng đối tượng khách hàng, từng đặc điểm của khoản vay. Muốn làm được như vậy, Chi nhánh cần phải tiến hành phân loại SMEs để làm căn cứ đưa ra các mức lãi suất cho vay khác nhau.
- Với SMEs tiềm năng, SMEs truyền thống có uy tín cao, Chi nhánh nên xem xét và áp dụng mức lãi suất ưu đãi thấp hơn nhằm giữ chân và tạo quan hệ tín dụng lâu dài, giúp cho SMEs làm ăn có hiệu quả, trả nợ gốc lãi đúng thời hạn, từ đó tiếp tục nâng cao uy tín và duy trì mối quan hệ lâu dài với ngân hàng.
- Với SMEs mới cần lôi kéo từ ngân hàng khác thì cán bộ tín dụng cũng nên đánh giá khách quan mức độ rủi ro của phương án, tùy từng trường hợp mà Chi nhánh có thể giảm lãi suất và có nhiều ưu đãi khác về thời hạn vay hoặc số tiền cho vay.
- Với SMEs mà Chi nhánh đánh giá là rủi ro cao hơn các khách hàng khác nhưng có TSĐB chắc chắn thì có thể thoả thuận để áp dụng mức lãi suất cao hơn.
Ngoài ra, tùy từng ngành nghề hay từng lĩnh vực kinh doanh mà Chi nhánh có thể đưa ra các mức lãi suất đa dạng, đặc biệt là với nhiều ngành nghề có nhiều triển vọng phát triển, được Nhà nước khuyến khích hỗ trợ để kích thích khách hàng hoạt động trong lĩnh vực đó phát triển như doanh nghiệp sản xuất kinh doanh.