Thực hiện lộ trình cải cách hành chắnh Nhà nước giai ựoạn 2001-2010, cơ chế chắnh sách của Nhà nước ựối với lĩnh vực sự nghiệp công ựã từng bước ựổi mớị Chắnh phủ ựã ban hành Nghị ựịnh số 43/2006/Nđ-CP ngày 25-4-2006 quy ựịnh về cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm ựối với các ựơn vị sự nghiệp công lập. Theo ựó, có chế tài chắnh ựối với các ựơn vị sự nghiệp giáo dục-ựào tạo công lập ựã thực hiện theo cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm về thực hiện nhiệm vụ, tổ chức bộ máy, biên chế và tài chắnh.
Cùng với ựổi mới cơ chế chắnh sách, Nhà nước ựã ưu tiên dành nguồn vốn cho phát triển cung cấp các dịch vụ sự nghiệp công trong lĩnh vực giáo dục-ựào tạo giai ựoạn 2001-2010 với tổng nguồn vốn dành cho giáo dục-ựào tạo là 603.870 tỷ ựồng, chiếm tỷ lệ trên 20% tổng chi NSNN từ năm 2008.
Theo tổng kết của Vụ Hành chắnh sự nghiệp (Bộ Tài chắnh), tắnh ựến cuối năm 2011 theo báo cáo chưa ựầy ựủ, cơ quan bộ, ngành trung ương và các ựịa phương (không tắnh lực lượng vũ trang) ựã có 20.226 ựơn vị sự nghiệp giáo dục- ựào tạo công lập ựược giao quyền tự chủ, tự chịu trách nhiệm về tài chắnh.
Trong ựó, có 117 ựơn vị tự ựảm bảo chi phắ hoạt ựộng thường xuyên (chiếm tỷ lệ 0,6%), 6.902 ựơn vị ựảm bảo một phần chi phắ hoạt ựộng thường xuyên (chiếm tỷ lệ 34,1%) và 13.207 ựơn vị do ngân sách nhà nước ựảm bảo toàn bộ chi phắ hoạt ựộng (chiếm tỷ lệ 65,3%).
Theo ựó, số ựơn vị giáo dục-ựào tạo tự ựảm bảo kinh phắ còn rất thấp, chủ yếu vẫn là các ựơn vị sự nghiệp do nhà nước ựảm bảo một phần hoặc toàn bộ kinh phắ. Cụ thể, ựối với cơ quan bộ, ngành trung ương, trong tổng số 238 ựơn vị sự nghiệp giáo dục-ựào tạo công lập ựược giao quyền tự chủ tự chịu trách nhiệm về tài chắnh, có 33 ựơn vị tự ựảm bảo chi phắ hoạt ựộng thường xuyên (chiếm tỷ lệ 11,7%), 238 ựơn vị ựảm bảo một phần chi phắ hoạt ựộng thường xuyên (chiếm tỷ lệ 84%) và 12 ựơn vị do NSNN ựảm bảo toàn bộ chi phắ hoạt ựộng (chiếm 4,3%).
đối với cơ quan ựịa phương, trong tổng số 19.943 ựơn vị sự nghiệp công lập ựược giao quyền tự chủ tự chịu trách nhiệm về tài chắnh, chỉ có 0,4% tương ựương với 84 ựơn vị tự ựảm bảo chi phắ hoạt ựộng thường xuyên. Còn lại, số ựơn vị do NSNN ựảm bảo toàn bộ chi phắ hoạt ựộng lên ựến 13.195, tương ựương 66,2%.