- Hĩa chất điện d
4.1. Kết quả sản xuất gia đình và nuơi thương phẩm
Số lượng gia đình cho sinh sản thành cơng năm 2005 cho quần đàn G1-2001 là 162 gia đình, năm 2006 cho quần đàn G1-2002 là 208 gia đình và năm 2007 cho quần đàn G1-2003 là 183 gia đình.
Tỷ lệ sống cá nuơi thương phẩm tương ứng đạt 86,0%; 69,1%, 75,7%, 85,2%; và 92,8% cho các quần đàn G1-2001, G1-2002 (nuơi ở 3 mơi trường) và G1-2003. Tỷ lệ cá cịn dấu lúc thu hoạch đạt rất cao 95,2%, 89,5% và 90,2% tương ứng cho các quần đàn G1-2001, G1-2002 và G1-2003.
4.2. Biến dị kiểu hình tính trạng tỷ lệ philê và một số tính trạng khác
Trung bình kiểu hình tính trạng và biến dị kiểu hình (CV) tính trạng tỷ lệ philê và một số tính trạng khác được thể hiện trong Bảng 4.1. Trọng lượng đánh dấu (CV=48,6% và 60,5% cho quần đàn G1-2001 và G1-2003), tỷ lệ mỡ nội quan (44,5% cho quần đàn G1-2001) và tỷ lệ mỡ trong philê (40,0-61,1% quần đàn G1- 2002) cĩ hệ số biến dị kiểu hình cao nhất. Trọng lượng cơ thể và trọng lượng philê cĩ hệ số biến dị ở mức trung bình và cao là 16,5-40,0%. Những giá trị này phù hợp với kết quả nghiên cứu các tính trạng này trên cá hồi và cá rơ phi (Gjedrem, 2000 & Rutten et al., 2005). Tỷ lệ philê cĩ hệ số biến dị kiểu hình thấp nhất ở cả 3 quần đàn và 3 mơi trường nuơi 5,9-19,7%. Tỷ lệ philê cá chưa qua chọn lọc nuơi tại nơng hộ cĩ hệ số biến dị kiển hình thấp, dao động từ 6,27 đến 11,14 (Phụ lục 1).
4.3. Kết quả phân tích biến dị di truyền và tìm chỉ thị liên kết với tỷ lệ philê 4.3.1. Phần tối ưu để chọn các chỉ thị họat động tốt và cho kết quảđa hình 4.3.1. Phần tối ưu để chọn các chỉ thị họat động tốt và cho kết quảđa hình
Kết quả cho thấy cĩ 8 primers hoạt động tốt và cho kết quả đa hình cao là: DTLCB4, DTLCB12, DTLCB13, DTLCB14, DTLCB18, DTLCB19, phy3 và phy5.
4.3.2. Kết quả phân tích các locus trên các quần đàn 4.3.2.1. Quần đàn bố mẹ 2001 và đàn con G1-2001 4.3.2.1. Quần đàn bố mẹ 2001 và đàn con G1-2001
Bảng 4.1. Trung bình và hệ số biến dị (CV) trính trạng tỷ lệ philê và một số tính trạng khác theo các mơ hình nuơi khác nhau (G1 2001) (G1-2002) (G1-2003) Đăng quầng Ao ở cồn Ao tại tại trugn tâm nghiên cứu Tính trạng Trung bình (TB) Hệ s(CV) ố biến dị TB CV TB CV TB CV TB CV Trọng lượng đánh dấu (TLĐD, g) 45,9 48,6 26,8 32,4 26,5 32,4 28,1 33,1 44,5 60,5 Trọng lượng thân (TL, g) 925,8 40,0 932,5 18,9 973,3 16,5 823,5 29,9 1107,2 26,8
Chiều dài thân chuẩn (SL, cm) 39,8 10,6 36,6 5,6 38,4 5,2 36,4 9,1 37,1 8
Trọng lượng phi lê cĩ da (TLPLDA,g) 455,9 35,9 - - - - - - 495,1 30,4
Trọng lượng phi lê khơng da (TLPL,g) 322,3 35,5 329,7 28,4 345,7 18,4 278,2 33,4 441,8 30,9
Tỷ lệ phi lê cĩ da (TyLPLDA, %) 47,6 18,9 - - - - - - 44,3 7,9
Tỷ lệ phi lê khơng da (TYLPL, %) 35,6 19,7 34,6 13,9 35,4 5,9 33,7 12,9 39,5 8,3
Mỡ phi lê ước tính (PMO,%) 4,3 16,3 9,7 51,3 5,1 61,1 6,4 40 - -
Trong tất cả 8 cặp mồi microsatellite được thực hiện trên tất cả các mẫu chỉ cĩ 3 cặp mồi microsatellite DTLCB4, DTLCB12 và DTLCB18 cho sản phẩm PCR. Trong đĩ 3 cặp mồi microsatellite DTLCB4, DTLCB12 và DTLCB18 cho sản phẩm PCR trên 61, 75 và 90 mẫu.
Đối với locus DTLCB4, cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 1 và đàn con sinh sản đợt 3 cĩ cấu trúc allele tương tự nhau và đàn cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 2 và 3 và đàn con sinh sản đợt 2 cĩ cấu trúc allele tương tự nhau. Tỷ lệ allele A ở cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 1 và đàn con sinh sản đợt 3 rất cao chiếm tới 0,45 và 0,17, trong khi đĩ tỷ lệ allele A ở các quần đàn cịn lại <0,1. Tỷ lệ allele C ở các đàn cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 2 và 3 và đàn con sinh sản đợt 2 chiếm 0,3; 0,3 và 0,25 (Phụ lục 2).
Đối với locus DTLCB12, tính đa hình rất thấp, chỉ cĩ 2 allele. Cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 2 và đàn con sinh sản đợt 2&3 cĩ thêm allele A. Cịn lại hầu hết là allele B (Phụ lục 3).
Đối với locus DTLCB18, tính đa hình cao hơn so với hai locus kia. Cả đàn bố mẹ và đàn con đều cĩ tỷ lệ cao nhất ở các allele khác nhau: Tỷ lệ allele A chiếm 0,5 ở cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 2; tỷ lệ allele D chiếm 0,33 ở cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 1 và đàn con sinh sản đợt 2, tỷ lệ allele C chiếm 0,32 ở đàn con sinh sản đợt 3 và tỷ lệ allele B và E chiếm 0,25 ở cá bố mẹ cĩ nguồn gốc trại giống 3 (Phụ lục 4).
Nhìn chung, cấu trúc allele của cá bố mẹ hình thành quần đàn chọn giống và đàn con 2001 giống nhau. Tính đa hình ở hai locus DTLCB12 và DTLCB4 là tương đối thấp. Các quần đàn đều cĩ cấu trúc tỷ lệ allele gần như nhau. Tính đa hình ở locus DTLCB18 tương đối cao, do các tỷ lệ allele cao nhất rất khác nhau ở từng quần đàn một.
4.3.2.2. Phân tích tìm chỉ thị liên kết với tỷ lệ philê
104 mẫu vây cá tra của ba dịng cá tra cĩ tỷ lệ phi lê khác nhau đều cho sản phẩm PCR với ba cặp mồi microsatellite DTLCB4, DTLCB12 và DTLCB18 cĩ kích thước khoảng 200-250 bp.
Locus DTLCB4 cĩ tính đa hình thấp, chỉ cĩ 2 allele. Tần số allele 1 và 2 chiếm 0,5 ở dịng cá cĩ tỷ lệ phi lê trung bình và thấp (Bảng 4.2). Dịng cá phi lê cao cĩ allele 1 chiếm tỷ lê cao hơn so với allele 2. Với PIC = 0,388, locus DTLCB4 cĩ tính đa hình trung bình. Dựa vào tần số allele cĩ thể phân biệt được dịng cá phi lê cao với hai dịng cá phi lê thấp và trung bình do sự xuất hiện của allele 1 nhiều hơn allele 2.
Phân tích locus DTLCB12
Locus DTLCB12 cĩ 5 allele, trong đĩ allele 2 chiếm tỷ lệ cao nhất trong cả ba dịng cá phi lê cao, thấp và trung bình. Allele 4, allele 5 chỉ xuất hiện ở dịng cá tra tỷ lệ philê cao với tỷ lệ thấp khơng đáng kể (Bảng 4.2). Với PIC = 0.46, locus
DTLCB12 cĩ tính đa hình trung bình.
Bảng 4.2. Kết quả phân tích locus DTLCB04
Locus Allele Philê
Đồng hợp tử Dị hợp tử p He Ho Pic Cao Trung bình Thấp 1 57 27 27 7 97 0.52 0.72 46.2 DTLCB04 2 43 27 27 0 97 0.48 0.78 46.2 0.388 1 14 19 2 13 9 0.167 0.97 4.28 2 68 27 45 56 28 0.66 0.56 13.3 3 16 8 7 5 21 0.147 0.98 10 4 1 0 0 0 1 0.005 0.99 0.47 DTLCB12 5 1 0 0 0 1 0.0047 0.99 0.48 0.460 Phân tích locus DTLCB18
Locus DTLCB18 chỉ cĩ 1 allele duy nhất ở cả 3 dịng cá phi lê cao, phi lê thấp và phi lê trung bình. Allele cĩ kích thước khoảng 200-250 bp. Như vậy với locus
Phân tích locus Phy03
Bảng 4.3. Tổng kết các thơng sốđa hình locus Phy03 các quần đàn
Nhĩm cá N Na Ne Ho He
Philê cao 45 5.0 3.506 0.622 0.715
Philê thấp 33 6.0 3.869 0.848 0.742
Philê trung bình 16 4.0 3.483 0.750 0.713 (N: Số lượng cá thể, Na: Số lượng allele, Ne: Số lượng allele hiệu quả;
Ho: Độ dị hợp tử quan sát, He: Độ dị hợp tử theo tính tốn lý thuyết)
Locus microsatellite DTLCB4 (104 cá thể) cĩ 2 allele, tần số allele 1, allele 2
chiếm tỷ lệ như nhau (0,5) ở dịng cá phi lê thấp và trung bình. Allele 1 chiếm tỷ lệ cao hơn allele 2 ở dịng cá phi lê cao. Locus DTLCB12 (104 cá thể) cĩ 5 allele, trong đĩ tần số allele 2 chiếm tỷ lệ cao nhất. Allele 4, allele 5 chỉ xuất hiện ở dịng cá tra tỷ lệ philê cao. Locus DTLCB18 (105 cá thể) cĩ 1 allele duy nhất ở tất cả các mẫu. Locus DTLCB12 cĩ thể phân biệt được dịng cá phi lê cao với các dịng cá phi lê thấp, trung bình do sự xuất hiện của allele 4, allele 5 và tần số allele 3 cao nhất so với hai dịng cá cĩ tỷ lệ phi lê thấp và trung bình. Locus DTLCB4 cĩ thể phân biệt được dịng cá cĩ tỷ lệ phi lê cao với hai dịng cá cĩ tỷ lệ phi lê trung bình và thấp do tần số allele 1 chiếm tỷ lê cao hơn allele 2.
Đồ thị 4.1. Tần số phân bố các allele theo từng quần đàn
0.0002.000 2.000 4.000 6.000 8.000
Pop1 Pop2 Pop3
Quần đàn S ố l ượ n g a ll ele 0.690 0.700 0.710 0.720 0.730 0.740 0.750 Độ d ị h ợ p t ử
(Pop1: Quần đàn philê cao; Pop 2: Quần đàn philê thấp; Pop3: Quần đàn philê trung bình)
Đồ thị tần số phân bố các allele và độ dị hợp tử lý thuyết tính theo quần đàn
: Số lượng allele : Số lượng allele >5% : Số lượng allele >5% : Số lượng allele hiệu quả
4.4. Hệ số di truyền
Hệ số di truyền tính trạng tỷ lệ philê và một số tính trạng khác được thể hiện trong bảng 4.4.Hệ số di truyền trọng lượng lúc đánh dấu thấp và sai số lớn (h2=0,24 và SE=0,35) do ảnh hưởng của mơi trường nuơi riêng rẽ lên đánh dấu lớn (c2=0,49). Hệ số di truyền thấp và sai số lớn được tìm thấy ở hầu hết các tính trạng trên quần đàn G1-2002 nuơi thử nghiệm trong mơi trường đăng quầng. Khả năng là do số lượng cá thể cân đo thấp hơn so với 2 mơi trường cịn lại, tỷ lệ sống thấp ở mơi trường nuơi này so với 2 mơi trường nuơi kia, một số gien qui định tính trạng trọng lượng cơ thể chưa thể hiện hồn tồn ở độ tuổi nhỏ hơn như thời gian nuơi trong mơi trường đăng quầng, cá mới bắt đầu ở giai đọan tăng trưởng theo hàm số mũ trên đường cong tăng trưởng.
Hệ số di truyền từ trung bình đến cao được tìm thấy trên tính trạng tăng trưởng như trọng lượng và chiều dài cơ thểở cả 3 quần đàn và mơi trường nuơi khác nhau (0,29-0,56). Với hệ số di truyền này cho phép chúng ta dựđốn hiệu quả chọn lọc sẽ tương đối cao nếu cá được chọn lọc theo các tính trạng tăng trưởng. Hệ số di truyền này bằng và cao hơn trên các lồi cá khác như tăng trưởng trên cá nước lạnh (h2=0,20-0,30; Gjedrem, 2000), TL & SL trên cá chép (h2=0,00-0,55; Vandeputte, 2003), TL trên cá rơ phi (h2=0,20, Gall & Baka, 2002; h2=0,55-0,56, Bolivar & Newkirk, 2002; h2=0,16-0,26, Rutten et al., 2004), TL trên cá hồi vân rainbow trout (h2=0,20, Kause et al., 2002), TL&SL trên cá hồi Coho (h2=0,09-0,30), và TL trên cá hồi Đại Tây Dương (h2=0,10-0,21, Quinton et al., 2005; h2=0,50, Powell et al., 2008).
Hệ số di truyền trọng lượng philê chưa bỏ da và bỏ da cao ở các quần đàn và các mơi trường nuơi cao, tương ứng là 0,48-0,66 và 0,40-0,67. Kết quả này tương tự trên cá hồi Đại Tây Dương (0,50; Powell et al., 2008) nhưng cao hơn nhiều trên cá rơ phi (0,22; Rutten et al., 2004) và và cá hồi Coho (0,18; Neira et al., 2004). Hệ số di truyền tỷ lệ philê cịn da và bỏ da đều thấp tương ứng từ 0,05-0,06 và 0,05-0,12. Hệ số di truyền thấp cũng được tìm thấy cho tính trạng này trên cá cá hồi Coho (0,11; Neira et al., 2004), cá rơ phi (0,12; Rutten et al., 2004) và cá hồi Đại Tây Dương (0,03; Powell et al., 2008). Với hệ số di truyền này, hiệu quả chọn lọc cao cho trọng lượng philê và thấp cho tỷ lệ philê được dự đốn cho cá tra nếu chọn lọc
21
Bảng 4.4. Hệ số di truyền (h2) ± standard error (se) và ảnh hưởng mơi trường ương riêng rẽ (c2±se) tính trạng tỷ lệ philê và một số
tính trạng khảo sát khác G1-2001 G1-2002 G1 - 2003 Đăng quầng Ao ở cồn Ao tại trung tâm nghiên cứu Tính trạng