Thực trạng chung trong hoạt động kinh doanh ngành vận tải biển và PVTrans nói riêng còn tồn tại rất nhiều khó khăn khi đòi hỏi phải có vốn lưu động khá lớn, trên 80% vốn phát triển đội tàu trong nước hiện nay là vốn vay của các ngân hàng thương mại với mức lãi suất cao, nhưng lại kinh doanh không có hiệu quả khi nguồn hàng vận tải khan hiếm, giá cước vận tải thấp, doanh nghiệp thiếu nguồn vốn để tái đầu tư và nâng cấp đội tàu,... Chính vì vậy, để từng bước nâng cao thị phần vận tải hàng hóa trong nước, cơ quan quản lý nhà nước cần đẩy mạnh hơn nữa nhưng phương hướng, biện pháp để hỗ trợ đưa vận tải biển Việt Nam thoát khỏi tình trạng bế tắc như hiện nay.
Chính phủ cần tiếp tục rà soát, sửa đổi, bổ sung hoàn thiện lại hệ thống phát luật của Việt Nam về ngành hàng hải, tạo ra một hành lang pháp lý ổn định, thuận lợi để hỗ trợ doanh nghiệp hoạt động hiệu quả. Trước mắt, bổ sung, sửa đổi các văn bản quy phạm pháp luật nhằm hỗ trợ cho doanh nghiệp vận tải biển vượt qua giai đoạn khó khăn duy trì sản xuất, từng bước nâng cao năng lực thị phần vận chuyển hàng hoá xuất, nhập khẩu của doanh nghiệp vận tải biển Việt Nam, cụ thể đối với hàng hóa là tài nguyên quốc gia, doanh nghiệp vận tải biển Việt Nam được dành quyền ưu tiên vận tải, trừ trường hợp Điều ước quốc tế mà Việt Nam là thành viên có quy định khác.
105
Chi phí nhiên liệu chiếm trên 40% chi phí vận tải biển, do đó kiến nghị Chính phủ hỗ trợ doanh nghiệp được ưu tiên mua nhiên liệu phục vụ nhu cầu vận tải nội địa với mức giá ưu đãi.
Ngoài ra, giảm thuế đối với hàng hóa là vật tư, thiết bị tàu biển phục vụ cho việc sửa chữa, bão dưỡng tàu biển. Đối với hoạt động vận tải nội địa của tàu mang cờ quốc tịch Việt Nam áp dụng mức thuế suất thuế giá trị gia tăng ưu đãi hơn.
Đầu tư hệ thống cảng biển phải được quy hoạch và đầu tư xây dựng đồng bộ có thể kết nối trực tiếp vớ vận tả đường biển, đường sông, đường bộ sẽ giúp giảm bớt chi phí về vận tải do có sự kết hợp tốt giữa các phương thức vận tải khác nhau và lập kế hoạch di dời các cảng biển nằm sâu trong sông để giảm chi phí hoa tiêu và luồng lạch.
Để giảm chi phí kho bãi, tiến hành đầu tư xây dựng hệ thống cảng mở để giảm bớt các chi phí về thủ tục hải quan, thuế xuất nhập khẩu; Xây dựng trung tâm logistics tại các khu vực trọng điểm, ban hành chính sách ưu đãi và hỗ trợ đầu tư các trung tâm logistics cho các tổ chức, cá nhân trong nước và nước ngoài có các dự án tại khu kinh tế trọng điểm.
Ban hành các chính sách nhằm triển khai áp dụng thủ tục điện tử tại cảng biển nhằm cải cách hành chính và minh bạch trong dịch vụ công nhằm tiết kiệm thời gian và chi phí cho doanh nghiệp vận tải.