Trước năm 2011, Ngân hàng MHB - Sở giao dịch thành phố Hồ Chí Minh thực hiện chức năng là trung tâm thanh toán của Hội sở chính. Khi tách ra hoạt động kinh doanh độc lập, nhiều vị trí lãnh đạo chủ chốt, trưởng phó phòng của Sở giao dịch được giữ lại để tiếp tục hoạt động kinh doanh. Tuy nhiên, do mô hình cơ cấu tổ chức chưa chuyển đổi phù hợp, không kịp thời thích ứng, hơn nữa tư tưởng làm việc theo hướng quản lý dẫn đến tình trạng khi giao dịch khách hàng vẫn còn mang tâm lý của bộ phận quản lý chứ không phải bộ phận trực tiếp giao dịch khách hàng. Nghĩa là, phong cách phục vụ khách hàng vẫn còn mang tính bị động, chưa chủ động tìm kiếm và tiếp xúc khách hàng, còn mang nặng tâm lý khách hàng đến giao dịch với ngân hàng là khách hàng cần ngân hàng theo phong cách quản lý ngày xưa. Chính vì vậy, trong giai đoạn này, việc chủ động tìm kiếm khách hàng hầu như là không diễn ra, phần lớn khách hàng tự tìm đến ngân hàng để giao dịch, dẫn đến hạn chế là doanh số huy động không cao.
Ngoài ra, do chuyển đổi mô hình kinh doanh, nên một số phòng ban chưa kịp bổ sung nhân sự để hoạt động. Điển hình là bộ phận kinh doanh của ngân hàng, đến cuối năm 2011 vẫn chưa có trưởng bộ phận quản lý. Đến giữa năm 2012, bộ phận này mới đầy đủ nhân sự làm việc chuyên môn và nhân sự quản lý. Cán bộ nhân viên tại Sở giao dịch là lực lượng cán bộ trẻ, mới ra trường. Các cán bộ nhân viên này có tinh thần làm việc năng động, tích cực, trình độ chuyên môn được đào tạo bài bản, chính quy nhưng kinh nghiệm làm việc không nhiều, chưa tiếp xúc trực tiếp với khách hàng nhiều, mối quan hệ chưa có nhiều nên hoạt động tìm kiếm khách hàng huy động, khách hàng vay