Phần 4 Kết quả và thảo luận
4.4. Đánh giá một số yếu tố nguy cơ đối với sự lưu hành của virus cúm gia
4.4.4. Tần suất nhập mới
Để đánh giá ảnh hưởng của chỉ tiêu thời gian nhập mới gia cầm đối với tỷ lệ lưu hành của virus cúm A, qua tính tốn các số liệu thu được:
Nếu nhập mới 2 ngày/lần:
Yếu tố nguy cơ Dương tính Âm tính Tổng hàng
Nhập mới 2 ngày/lần
Có 10 14 24
Không 96 184 280
Tổng cột 106 198 304
Tỷ suất chênh lệch OR (odds ratio) 1.4 (CI 95%: 0.6-3.2)
Chitest (Giá trị P-value) 0.5
Kết quả là chấp nhận H0 (do P > 0.05), chưa có sự liên hệ việc nhập mới gà 2 ngày/lần với mẫu dương tính virus cúm A.
Nếu nhập mỗi ngày 1 lần:
Yếu tố nguy cơ Dương tính Âm tính Tổng hàng
Nhập mới mỗi ngày
Có 70 146 216
Không 36 52 88
Tổng cột 106 198 304
Tỷ suất chênh lệch OR (odds ratio) 0.7 (CI 95%: 0.4-1.2)
Chitest (Giá trị P-value) 0.16
Kết quả là chấp nhận H0 (do P > 0.05), nghĩa là khơng có sự liên hệ việc nhập mới gà mỗi ngày với mẫu dương tính virus cúm A.
67
Nếu nhập mới 3 lần/tuần:
Yếu tố nguy cơ Dương tính Âm tính Tổng hàng
Nhập mới 3 lần/tuần
Có 26 38 64
Khơng 80 160 240
Tổng cột 106 198 304
Tỷ suất chênh lệch OR (odds ratio) 1.4 (CI 95%: 0.8-2.4)
Chitest (Giá trị P-value) 0.3
Kết quả là chấp nhận H0 (do P > 0.05), nghĩa là khơng có sự liên hệ việc nhập mới gà ba ngày/tuần với mẫu dương tính virus cúm A.
Có kết quả này, theo chúng tôi là do đặc tính của virus cúm, virus lưu hành thường xuyên trong môi trường và khả năng lây lan qua nhiều con đường khác nhau (trực tiếp hoặc gián tiếp thơng qua mơi trường). Vì vậy, tần suất nhập gia cầm không quyết định tỷ lệ lưu hành của virus mà quan trọng hơn là nguồn nhập gia cầm cũng như thời gian giao thương từ nguồn cung cho khi tới tay người tiêu dùng.
4.4.5. Tình trạng tiêm phịng
Kết quả phân tích yếu tố tình trạng miễn dịch cho thấy:
Yếu tố nguy cơ Dương tính Âm tính Tổng hàng
Tình trạng khơng tiêm phịng cúm
Có 54 126 124
Khơng 52 72 180
Tổng cột 106 198 304
Tỷ suất chênh lệch OR (odds ratio) 0.6 (CI 95%: 0.4-1.0)
Chitest (Giá trị P-value) 0.032
Kết quả là không chấp nhận H0 (do P < 0.05), tuy nhiên OR = 0.6 nhỏ hơn 1 nên chưa tìm thấy mối liên quan đến mẫu dương tính với virus cúm A với việc tiêm phịng.
Có được kết quả này, theo chúng tơi là do sự ảnh hưởng của nhiều yếu tố: - Thứ nhất: đây là câu hỏi phỏng vấn, theo chúng tơi, là có tỷ lệ “rủi ro” cao nhất vì: người bán thường có tâm lý “đề phịng” khi được hỏi về trạng thái tiêm phòng, do vậy thường đưa ra câu trả lời thiếu tính “trung thực”. Hoặc đơi khi, họ thực sự không biết con gà họ nhập bán đã được tiêm phòng vaccine cúm hay chưa theo như yếu tố tiếp sau đây.
- Thứ hai: tình trạng gà có được tiêm phịng hay chưa rất khó được xác định đặc biệt khi gà được nhập từ hộ chăn ni nhỏ lẻ (ngại tiêm phịng) hoặc thông qua nhiều người buôn trung gian.
- Thứ ba là tính hiệu lực của loại vaccine hiện hành. Khả năng biến chủng rất lớn của virus cúm là điều đã được giới khoa học nhận định. Do vậy, mặc dù gia cầm đã được tiêm phòng vaccine cúm nhưng điều đó khơng có nghĩa chúng được bảo hộ hoàn toàn trước virus cúm.
69
PHẦN 5. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
5.1. KẾT LUẬN
- Tổng đàn gia cầm tại Hà Nội và Bắc Ninh khá cao, phát triển ổn định, hình thức chăn ni vừa có cả chăn ni tập trung quy mô vừa, lớn và chăn nuôi nhỏ lẻ, mang tính chất nơng hộ.
- Hà Nội và Bắc Ninh là các địa phương thực hiện tốt công tác tiêm phòng vaccine cho đàn gia cầm với tỷ lệ tiêm phịng ln đạt cao trên 93%.
- Trong giai đoạn 2015 - 2018 dịch cúm gia cầm tại Bắc Ninh và Hà Nội được kiểm soát khá tốt, chỉ xuất hiện một vài ổ dịch cúm gia cầm nhỏ lẻ được phát hiện và xử lý triệt để.
- Tất cả các chợ lấy mẫu đều phát hiện lưu hành virus cúm type A, các chợ bán lẻ có tỷ lệ nhiễm virus cao hơn hẳn các chợ bán buôn. Tỷ lệ lưu hành của virus cúm A trong mẫu từ gà chiếm 34.87%, trong mẫu môi trường là 44.76%. Tỷ lệ lưu hành của virus cúm A/H9N2 trên mẫu từ gà là 20.9%; trong các mẫu dương tính với cúm A, virus cúm A/H9N2 chiếm tới 58.49%.
- Trong tổng số 9 yếu tố nguy cơ được phân tích, các yếu tố nguy cơ ảnh hưởng đến sự lưu hành của virus cúm A (P-value < 0.05) bao gồm 4 yếu tố như: Đối tượng tiêu thụ, nguồn từ các chợ gia cầm khác, nguồn từ các người buôn trung gian và nơi lưu giữ gia cầm không được bán hết.
- Các yếu tố không thể hiện sự tương quan với tỷ lệ lưu hành của virus cúm A (P-value > 0.05) bao gồm 5 yếu tố khác như: nguồn gà từ hộ chăn nuôi gia đình, từ các trang trại nhỏ, từ các trang trại lớn, tần suất nhập mới và tình trạng tiêm phòng vaccine cúm gia cầm.
- Virus cúm A/H9N2 của các chủng phân lập được nằm trong phân nhánh Y280 (HA) và F98 like (NA) với tỷ lệ tương đồng rất cao với các chủng cúm A/H9N2 đã được công bố.
5.2. KIẾN NGHỊ
- Tiếp tục tiến hành chương trình giám sát sự lưu hành của virus cúm gia cầm type A/H9N2 nói riêng và các type khác trên đàn gia cầm tại các chợ, các tỉnh nằm trên tuyến đường vận chuyển gia cầm nhập lậu với số lượng mẫu lớn hơn và thời gian liên tục trong năm.
- Cần tiếp tục có thêm các nghiên cứu xác định subtype H và N khác của virus cúm gia cầm tại nước ta nói chung và tại các tỉnh giám sát nói riêng.
- Tiếp tục thực hiện giải trình tự tồn bộ hệ gen của virus cúm A/H9N2 để xác định các đặc tính sinh học phân tử của các gen, xác định sự biến đổi, đột biến. Trên cơ sở đó có các biện pháp phịng, chống dịch có hiệu quả cao.
Bên cạnh đó cần có hướng chuyển đổi, xây dựng các chợ bn bán, các lị giết mổ tập trung có sự quản lý, giám sát chặt chẽ của cơ quan thú y với đầy đủ trang thiết bị kỹ thuật nhằm nhanh chóng phát hiện và xử lý gia cầm có nguy cơ mắc cúm./.
71
TÀI LIỆU THAM KHẢO
I. Tài liệu tiếng Việt:
1. Bùi Quang Anh (2005). Báo cáo về dịch cúm gia cầm, Hội nghị kiểm soát dịch cúm gia cầm khu vực châu Á do FAO, OIE tổ chức, từ 23 - 25 tháng 2 năm 2005, thành phố Hồ Chí Minh.
2. Lê Thanh Hịa (2004). Họ Orthomyxoviridae và nhóm virus cúm A gây bệnh trên người và gà, Viện Khoa học công nghệ.
3. Lê Thanh Hồ, Đinh Duy Kháng và Lê Trần Bình (2006). Sinh học phân tử virus cúm A/H5N1 và quan hệ lây nhiễm trong tự nhiên. Y - Sinh học phân tử, quyển I (chủ biên: Lê Thanh Hòa). NXB Y học, Hà Nội. tr. 29-48
4. Lê Văn Năm (2004). Bệnh cúm gia cầm. Tạp chí Khoa học kỹ thuật Thú y. XI, (01). tr. 81-86.
5. Nguyễn Bá Hiên, Phạm Sĩ Lăng, Nguyễn Thị Lan, Nguyễn Tùng, Đỗ Ngọc Thúy, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Trịnh Đình Thâu, Trần Quang Vui, Lê Văn Phan, Phạm Đức Phúc, Phạm Thị Mỹ Dung (2014). Bệnh cúm ở người và động vật. Nhà xuất bản Nông nghiệp, Hà Nội.
6. Nguyễn Ngọc Tiến (2013). Tình hình dịch cúm gia cầm giai đoạn 2008-2012 và các biện pháp phịng chống. Tạp chí Khoa học kỹ thuật Thú y. XX. 01. tr. 82-90. 7. Nguyễn Tiến Dũng (2004). Bệnh cúm gia cầm, hội thảo một số biện pháp khôi
phục đàn gia cầm sau dập dịch. Hà Nội.tr. 5-9.
8. Phạm Thành Long (2016). Kết quả giám sát lưu hành virus cúm gia cầm tại chợ giai đoạn 2015 - 2016. Tập huấn giám sát và lấy mẫu cúm gia cầm, cúm lợn, Thành phố Hải Phòng.
9. Phạm Thành Long (2016). Tình hình dịch cúm gia cầm tại Việt Nam. Tập huấn giám sát và lấy mẫu cúm gia cầm, cúm lợn, Thành phố Hải Phòng.
10. Phạm Sỹ Lăng (2004). Diễn biến của bệnh cúm gà trên thế giới. Hội thảo một số biện pháp khôi phục đàn gia cầm sau dập dịch, Hà Nội. tr. 33-38”.
11. Tô Long Thành (2004). Thông tin cập nhật về tái xuất hiện bệnh cúm gia cầm tại các nước Châu Á. Tạp chí Khoa học kỹ thuật Thú y. XI. 04. tr. 87-93.
12. Nguyễn Như Thanh (2015). Giáo trình Dịch tễ học thú y. NXB Đại học Nông nghiệp, Hà Nội.
II. Tài liệu tiếng Anh:
13. Alexander D.J. (1993). Orthomyxovirus Infections. In Viral Inffections of Vertebrates, Volume 3: Viral Infections of Birds. McFerran J.B. & McNulty M.S., eds. Horzinek M.C., Series editor. Elserviers, Amsterdam, the Netherlands. pp. 287 - 316.
14. Aoki F. Y., G. Boivin and N. Roberts (2007). Influenza virus susceptibility and resistance to oseltamivir. Antivir. Ther. Vol 12(4B). pp. 603-16.
15. Baigent S. J. and J. W. Mc. Cauley (2001). Glycosylation of haemagglutinin and stalk-length of neuraminidase combine to regulate the growth of avian influenza viruses in tissue culture. Virus Res. Vol 79. (1-2). pp. 177-185.
16. Basler CF (2007). Influenza viruses: basic biology and potential drug targets. Infect Disord Drug Targets. Vol 7(4). pp. 282-293. Review.
17. Beard C. W. (1998). Avian Influenza. In Foreign Animal Disease, United States Animal Health Association. pp. 71-80.
18. Bender C., H. Hall, J. Huang, A. Klimov, N. Cox, A. Hay, V. Gregory, K. Cameron, W. Lim and K. Subbarao (1999). Characterization of the surface proteins of influenza A (H5N1) viruses isolated from humans in1997- 1998. Vol 254. pp. 115-123.
19. Bosch F.X., W. Garten, H.D. Klenk and R. Rott (1981) Proteolytic cleavage of influenza virus hemagglutininss; primary structure of the connecting peptide between HA1 and HA2 determines proteolytic cleavability and pathogenicity of avian influenza viruses. Vol 113. pp. 725-735.
20. Chen H., G. J. D. Smith, K. S. Li, J. Wang, X. H. Fan, J. M. Rayner, D. Vijaykrishna, J. X. Zhang, L. J. Zhang, C. T. Guo, C. L. Cheung, K. M. Xu, L. Duan, K. Huang, K. Qin, Y. H. C. Leung, W. L. Wu, H. R. Lu, Y. Chen, S. Xia, T. S. P. Naipospos, K. Y. Yuen, S. S. Hassan, S. Bahri, T. D. Nguyen, R. G. Webster, J. S. M.Peiris and Y. Guan (2006). Establishment of multiple sublineages of H5N1 influenza virus in Asia: Implications for pandemic control. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol 103(8). pp. 2845-2850.
21. Chu D. H., M. Okamatsu, K. Matsuno, T. Hiono, K. Ogasawara, L. T. Nguyen, L. Van Nguyen, T. N. Nguyen, T. T. Nguyen, D. Van Pham, D. H. Nguyen, T. D. Nguyen, T. L. To, H. Van Nguyen, H. Kida and Y. Sakoda, (2016). Genetic and antigenic characterization of H5, H6 and H9 avian influenza viruses circulating in live bird markets with intervention in the center part of Vietnam. Vet Microbiol. 192 194-203.
73
22. David A. Steinhauer. (1999). Role of Hemagglutinin Cleavage for the Pathogenicity of Influenza Virus, Virology 258, 1-20.
23. De Wit E. and R.A. Foichier (2008) Emerging influenza. J Clin Virol. Vol 41 (1). pp. 1-6.
24. Cohen Miriam, Xing-Quan Zhang, Hooman P Senaati, Hui-Wen Chen, Nissi M Varki, Robert T Schooleyand Pascal Gagneux. (2013). Influenza A penetrates host mucus by cleaving sialic acids with neuraminidase. 10:321.
25. Conenello G.M., D. Zamazin, L.A. Perrone, T. Tumpey and P. Palese (2007). A single mutation in the PB1-F2 of H5N1 (HK/97) and 1918 influenza A viruses contributes to increased virulence. PloS Pathog. Vol 3(10): 1414-1421.
26. Gambotto A., S.M. Barratt-Boyes, M.D. Jong, G. Neumann and Y. Kawaoka (2008). Human infection with highly pathogenic H5N1 influenza virus. Lancet. Vol 731 (9622). pp. 1464-1475. Review.
27. Indriani Risa, Gina Samaan, Anita Gultom, Leo Loth, Sri Indryani, Rma Adjid, Ni Luh Putu Indi Dharmayanti, John Weaver, Elizabeth Mumford, Kamalini Lokuge, Paul M. Kelly, and Darminto. (2010). Environmental sampling for avian influenza virus A (H5N1) in live-bird markets, Indonesia. Emerg Infect Dis. 16(12): 1889-1895.
28. Ito T., J.N. Couceiro, S. Kelm, L.G. Baum, S. Krauss, M.R. Castrucci, I. Donatelli, H. Kida, J.C. Paulson, R.G. Wobster and Y. Kawaoka (1998) Molecular basis for the generation in pigs of influaenza A viruses with pandemic potential. 72. pp. 7367-7373.
29. Keawcharoen J., A. Amonsin, K. Oraveerakul, S. Wattanodorn, T. Papravasit, S. Karnda, K. Lekakul, R. Pattanarangsan, S. Noppornpanth, R.A. Fouchier, A.D. Osterhaus, S. Payungporn, A. Theamboonlers and Y. Poovorawan (2005). Characterization of the hemagglutinin and neuraminidase genes of recent influenza virusisolates from different avian species in Thailand. Vol 49(4).
30. Katoh Kazutaka, John Rozewicki and Kazunori D. Yamada, (2017). MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization. Briefings in Bioinformatics.
31. Kumar S., G. Stecher and K. Tamura (2016). MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets. Mol Biol Evol. 33 (7). pp.1870-1874.
32. Liu Yu-Fu, Han-Zhang Lai, Lin Li, Yu-Peng Liu, Wen-Yan Zhang, Ren Gao, Wen-Ke Huang, Qin-Fang Luo, Yan Gao, Qiong Luo, Xiao-Yu Xie, Jia-Hua Xu and Rui-Ai Chen, (2016). Endemic Variation of H5N6 Avian Influenza Virus in China. Avian Diseases. 60. (4). pp. 817-825, 819.
33. Luong G. and P. Palese (1992) Genetic analysis of influenza virus. Curr Opinion Gen Develop. Vol 2. pp. 77-81.
34. Murphy B.R and Webster (1996). Orthomyxoviruses, In Fields B.N., Knipe D.M., Howley P.M, (eds.). Fields Virology, 3rd ed, Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia. pp. 1397-1445.
35. Suarez D.L. and S. Schultz-Cherry (2000) Immunology of avianinfluenza virus: a review. Dev Comp Immunol. 24 (2-3). pp. 269-283.
36. Subbarao K., A. Klimov, J. Katz, H. Regnery, W. Lim and H. Hall (1998). Charavterization of an avian influenza A (H5N1) viruses isolatedfrom a child with a fatal respiratory illness. Vol 279. pp. 393-396
37. Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, and Kumar S (2013) MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0. Molecular Biology and Evolution. 30.pp.2725-2729.
38. Taubenberger J.K. (1997). Initial genetic characterization of the 1918 "Spanish" influenza virus. Science. Vol 275. pp. 1793-6.
39. Mai Thuy Duong, Thomas Peacock, Bich Vu Thi Ngoc, Thomas Fabrizio, Dang Nguyen Hoang, Nguyen Dang Tho, Diep Nguyen, Minh Nguyen, Hoa Nguyen Minh Le, Trang Hau Thi Thu, Marc Choisy, Ken Inui, Scott Newman, Nguyen vu Trung, H. Rogier van Doorn, To Long Thanh, Munir Iqbal and Juliet Bryant, 2016: Prevalence and diversity of H9N2 avian influenza in chickens of Northern Vietnam, 2014.
40. Tumpey TM1, Suarez DL, Perkins LE, Senne DA, Lee JG, Lee YJ, Mo IP, Sung HW, Swayne DE.(2002). Characterization of a highly pathogenic H5N1 avian influenza A virus isolated from duck meat. J Virol. 76 (12).pp.6344-55.
41. Suxiang Tong, Xueyong Zhu, Yan Li et al,. (2013). New world bats harbor
biverse influenza A virus. PLoS Pathog. 9(10). doi: 10.1371/journal.ppat.1003657 42. Uiprasertkul M., R. Kitphati, P. Puthavathana, R. Kriwong, A. Kongchanagul, K.
Ungchusak, S. Angkasekwinai, K. Chokephaibulkit, K. Srisook, N. Vanprapar and P. Auewarakul (2007). Apoptosis and pathogensis of avian influenza A (H5N1) viruses in humans. Emerg Infect Dis. Vol 13(5).pp. 708-712
75
43. Wangner R., M. Matrosovich and H. Klenk (2002) Functional balance between haemagglutinin and neuraminidase in fluenza virus infections. Vol 12(3). pp. 159-166. 44. Wasilenko J.L., C.W. Lee, L. Sarmento, E. Spackman, D.R. Kapczynski, D.L.
Suarez and M.J. Pantin-Jackwood (2008). NP, PB1 and PB2 viral genes contribute to altered replication of H5N1 avian influenza viruses in chickens. Vol 82(9). pp. 4544-4553.
45. Webster R. G., Y. Guan, M. Peiris, D. Walker, S. Krauss, N. N. Zhou, E. A. Govorkova, T. M. Ellis, K. C. Dyrting, T. Sit, D. R. Perez and K. F. Shortridge (2002). Characterization of H5N1 influenza viruses that continue to circulate in geese in southeastern China. Vol 76(1). pp. 118-126.
46. Wolfgang Garten and Hans-Dieter Klenk. (2008). Cleavage Activation of the Influenza Virus Hemagglutinin and Its Role in Pathogenesis. Avian Influenza. 27, pp 156-167.
47. Wu W. L., Y. Chen, P. Wang, W. Song, S. Y. Lau, J. M. Rayner, G. J. Smith, R. G. Webster,J. S. Peiris, T. Lin, N. Xia, Y. Guan and H. Chen (2008). Antigenic profile of avian H5N1 viruses in Asia from 2002 to 2007. 82(4). pp. 1798-17807. 48. Zhao Z.M., K.F. Shortridge, M. Garci, Y. Guan and X.F. Wan (2008). Genotypic
diversity of H5N1 highly pathogenic avian influenza viruses. Vol 89(9). pp. 2182-2193.
III. Tài liệu Internet:
49. http://www.cucthuy.gov.vn 50. http://www.vncdc.gov.vn 51. http://www.wpro.who.int/emerging_diseases 52. http://www.oie.int/en/animal-health-in-the-world/update-on-avian-influenza/2016/ 53. http://www.micro.magnet.fsu.edu/cells/viruses/influenzavirus.html 54. http://www.fao.org/docs/eims/upload/200354/hpai_manual.pdf 55. http://www.fao.org/indonesia/news/detail-events/en/c/1145340/ 56. http://www.fao.org/myanmar/programmes-and-projects/success-stories/poultry- production-yangon/en/ 57. http://www.who.int
PHỤ LỤC
BẢNG CÂU HỎI ĐIỀU TRA
Chương trình giám sát sự lưu hành của virus cúm A/H9N2 tại các chợ bán gia cầm sống thuộc Thành phố Hà Nội và tỉnh Bắc Ninh
Ngày /tháng/năm:
Thời gian phỏng vấn và lấy mẫu: Tỉnh, huyện và tên chợ:
Mã câu hỏi (giống với mã của mẫu):
Thông tin thêm (dùng để cung cấp cho người bán gia cầm)
- Đây là cuộc khảo sát thí nghiệm về tình hình lưu hành virus cúm gia cầm tại các chợ