Hoạt động kiểm tra, thanh tra hoạt động du lịch trong thành phố được quan tâm thực hiện, kịp thời phát hiện và xử lý nghiêm các hành vi vi phạm pháp luật, vi phạm các quy định trong lĩnh vực du lịch. Năm 2017, Sở VH- TT&DL tỉnh Quảng Bình cùng Phòng VHTT thành phố, UBND các xã, phường đã tổ chức các đợt kiểm tra, thanh tra về lĩnh vực du lịch trên địa bàn; đặc biệt chú trọng những địa phương có điểm du lịch, tài nguyên về du lịch.
Từ năm 2011 đến nay, Phòng VH-TT thành phố đã phối hợp với Công an thành phố Đồng Hới, Đội kiểm tra liên ngành 814 tiến hành 21 lượt kiểm tra, thanh tra các cơ sở hoạt động kinh doanh du lịch, kiểm tra công tác bảo vệ di tích lịch sử - văn hóa, các địa điểm tổ chức lễ hội truyền thống trên địa bàn toàn thành phố; xử lý hành chính 12 cơ sở, nhắc nhở đối với các cơ sở còn lại,... Thông qua công tác kiểm tra, thanh tra, đã góp phần nâng cao ý thức chấp hành pháp luật của các đơn vị kinh doanh du lịch, giải quyết những khiếu nại của du khách về an ninh, trật tự, vệ sinh môi trường, an toàn thực phẩm, an toàn tính mạng và tài sản cho khách du lịch, tạo được niềm tin đối với du khách, xây dựng môi trường du lịch an toàn, thân thiện.
Mặc dù hoạt động kiểm tra, thanh tra được quan tâm nhưng vẫn còn một số tồn tại hạn chế như: Thẩm quyền thanh tra, kiểm tra cấp thành phố hạn chế, do vậy nhiều trường hợp không thể xử lý kịp thời mà phải báo cáo, chờ cấp trên giải quyết. Trong một số đợt kiểm tra, thanh tra; thành phần đoàn kiểm tra, thanh tra vẫn còn thiếu một số ngành liên quan và chính quyền địa phương nơi diễn ra hoạt động thanh tra, kiểm tra nên hiệu quả thanh tra, kiểm tra chưa cao; việc thực hiện niêm yết giá và bán đúng giá niêm yết chưa hiệu quả, vẫn còn mang tính chất đối phó với các cơ quan chức năng chứ chưa tự giác thực hiện; tình trạng nâng giá, ép giá, “chặt chém” du khách, nhất là vào mùa cao điểm du lịch chưa được khắc phục triệt để làm ảnh hưởng đến hình ảnh du lịch Đồng Hới. Môi trường du lịch trên địa bàn thành phố vẫn còn nhiều vấn đề chưa theo kịp yêu cầu phát triển. Việc xử lý rác thải, nước thải tại một số vùng trọng điểm như các bãi biển và chợ chưa triệt để; tình trạng lấn chiếm vỉa hè, họp chợ, giữ xe, bán hàng rong… mặc dù đã được tích cực xử lý nhưng vẫn chưa triệt để, đã gây ảnh hưởng đến vệ sinh môi trường, văn minh đô thị, an ninh, an toàn và tâm lý của du khách.