Ứng dụng CLIL vào dạy học cần thể hiện được nét đặc trưng của phương pháp này, nói một cách khác là cần đảm bảo bản chất của CLIL. Theo Mehisto (2008), phương pháp này có một số những đặc tính quan trọng như sau:
• Nhiều trọng tâm: việc học ngôn ngữ được “nuôi dưỡng” trong nội dung kiến thức môn học và ngược lại, nội dung kiến thức môn học được dạy học bằng ngôn ngữ; tích hợp với nhiều môn học khác; có thể tổ chức thông qua các chủđềngoại khóa hoặc dự án học tập; khuyến khích việc phản ánh lại quá trình học tập.
• Môi trường học tập an toàn và phong phú:các hoạt động học tập và ngôn từ được sử dụng như thông thường; ngôn ngữ và nội dung kiến thức môn học được thể hiện xuyên suốt tiết học; tạo sự tựtin cho người học để thỏa sức trải nghiệm với ngôn ngữ và môn học; chấp nhận sai sót và xem đó như là một phần của quá trình học tập; hướng dẫn để đi đến tài liệu học tập và môi trường học tập xác thực; nâng cao nhận thức ngôn ngữ của HS.
• Tính xác thực: cho phép người học yêu cầu hỗ trợ về ngôn ngữ khi cần; tối đa hóa việc điều chỉnh sao cho phù hợp với nhu cầu, hứng thú của người học; thường xuyên kết nối giữa học tập và thực tế cuộc sống; sử dụng tài liệu phổ biến hiện hành từ các phương tiện truyền thông và các phương tiện khác.
• Học tập tích cực:lấy người học làm trung tâm, người dạy đóng vai trò là người hỗ trợ; khuyến khích sựtrình bày, giao tiếp của người học nhiều hơn người dạy; người học góp phần tạo nên kết quả học tập chung và giám sát quá trình học tập của chính họ; khuyến khích hợp tác ngang hàng.
• Kỹ thuật giàn giáo (scaffolding):xây dựng bài học dựa trên kiến thức, kĩ năng, thái độ, hứng thú, nhu cầu và kinh nghiệm có sẵn của người học; tóm gọn thông tin sao cho dễ hiểu đối với người học; đáp ứng nhiều phương thức, chiến lược học tập khác nhau; thúc đẩy sự sáng tạo và tư duy phản biện của người học; thửthách người học với nhiệm vụngày càng khó hơn.
• Hợp tác: hợp tác giữa GV CLIL và GV bình thường trong việc lập kếhoạch khóa học/ bài học/ chủđề; đòi hỏi sự hợp tác của phụhuynh trong việc tìm hiểu về CLIL và cách hỗ trợngười học; đòi hỏi sự hợp tác của địa phương, chính quyền và nhà tuyển dụng.