Để đảm bảo cân đối về vốn và sử dụng vốn chi nhánh đã linh hoạt tiếp nhận vay vốn từ NHNo&PTNT tỉnh Hậu Giang trên cơ sở tính đầu ra chắc chắn, đảm bảo tính kịp thời nhu cầu vay vốn của khách hàng và khả năng thanh toán của chi nhánh. Vốn vay là nguồn vốn chủ yếu đảm bảo cho hoạt động kinh doanh của ngân hàng được liên tục. Tình hình vốn vay của ngân hàng qua 3 năm như sau:
Từ năm 2005 - 2007, vốn vay từ ngân hàng cấp trên điều tăng. Năm 2005 là 100.543 triệu đồng, sang năm 2006 là 112.151 triệu đồng tăng 11,55% hay 11.608 triệu đồng so với năm 2005. Nguồn vốn vay này tiếp tục tăng vào năm 2007 với tốc độ nhanh hơn tăng 30,7% hay 34.431 triệu đồng so với năm 2006, tức là ở mức vốn 146.582 triệu đồng. Nguyên nhân là do nhu cầu nguồn vốn ngày càng tăng trong khi đó việc huy động vốn của ngân hàng gặp khó khăn (do yếu tố thị trường) nên chi nhánh phải vay từ ngân hàng cấp trên làm nguồn vốn vay liên tục tăng. Điều nay gây bất lợi cho chi nhánh vì lãi suất tiếp nhận vốn vay thường cao hơn lãi suất huy động nên điều này sẽảnh hưởng đến lợi nhuận của chi nhánh.
Tóm lại: Nguồn vốn tại Ngân hàng Nông Nghiệp và Phát Triển Nông Thôn Châu Thành A qua 3 năm đều tăng nhưng vẫn còn phụ thuộc nhiều vào vốn vay của ngân hàng cấp trên (trên 80%), vốn huy động còn hạn chế (dưới 20%). Vì vậy, đòi hỏi chi nhánh cần phải bám sát mục tiêu, phương hướng, nhiệm vụ của tỉnh giao trong công tác huy động vốn của mình cũng như mục tiêu phát triển kinh tế xã hội của tỉnh, luôn đổi mới phương pháp huy động vốn nhằm gây hấp dẫn đối với người gửi tiền để nguồn vốn huy động của ngân hàng ngày càng tăng và chiếm tỷ trọng cao trong tổng nguồn vốn, có thế thì hiệu quả hoạt động của ngân hàng sẽ cao hơn.