Trung tâm lƣu ký chứng khoán đóng vai trò khá quan trọng trong quá trình triển khai các thủ tục phát hành thêm cổ phiếu. Đây là nơi trực tiếp diễn ra quá trình phân phối các chứng khoán mới phát hành. Chỉ khi việc phân phối này đƣợc diễn ra chính xác, đầy đủ, đảm bảo đƣợc các điều kiện của phƣơng án phát hành đã đƣợc thông qua thì đợt phát hành mới có thể xem là hoàn tất.
Hiện nay, quy mô thị trƣờng chứng khoán ngày càng mở rộng, các CTNY có mức vốn cổ phần ngày càng lớn với danh sách cổ đông đôi khi lên đến hàng nghìn ngƣời, hơn nữa nhiều đối tƣợng có điều kiện chuyển nhƣợng phức tạp. Vì vậy, để việc xử lý và tổng hợp phân bổ quyền, xác định danh sách cổ đông mới chính xác
và nhanh chóng đòi hỏi Trung tâm cần có sự đầu tƣ mạnh mẽ về công nghệ, học hỏi các giải pháp công nghệ, kỹ thuật từ hoạt động lƣu ký tại các thị trƣờng chứng khoán tiên tiến hoặc có quá trình phát triển, điều kiện thị trƣờng tƣơng đồng với thị trƣờng chứng khoán Việt Nam.
Bên cạnh đó, TTLKCK cũng cần nghiên cứu đổi mới quy trình thủ tục chốt danh sách cổ đông, đăng ký, lƣu ký, thanh toán bù trừ để rút ngắn thời gian, tạo thuận lợi cho các doanh nghiệp hoàn tất quá trình chốt danh sách cổ đông phát hành thêm và đăng ký lƣu ký chứng khoán mới phát hành. Đặc biệt các vấn đề về việc đẩy room cho nhà đầu tƣ nƣớc ngoài cần đƣợc quan tâm thực hiện đúng tỷ lệ quy định và kịp thời phục vụ cho sự ổn định hoạt động giao dịch trên thị trƣờng chứng khoán sau đợt phát hành.