Khối vận hành được thành lập từ tháng 4 năm 2008 trên cơ sở tái cơ cấu tổ chức của công ty với chức năng tổ chức, hướng dẫn, quản lý hoạt động vận hành của các kênh phân phối. Mô hình tổ chức mới này thực sự mang lại hiệu quả tốt cho hoạt động vận hành toàn hệ thống trên cơ sở quản lý tập trung, xuyên suốt, kiểm soát được rủi ro, hỗ trợ tích cực cho hoạt động kinh doanh của toàn công ty. Năm 2008, khối vận hành tập trung ban hành quy trình, quy định, đề xuất thay đổi, chỉnh sữa, bổ sung một số chương trình quản lý hiện hành để phù hợp với sản phẩm hiện có, đồng thời tăng cường tính kiểm soát, giảm thiểu rủi ro trong vận hành. Hoạt động giao dịch chứng khoán niêm yết trên toàn hệ thống đã được phòng giao dịch chứng khoán điều phối và vận hành tốt. Các chính sách, quy trình, hướng dẫn công
việc liên quan đến hoạt động giao dịch cổ phiếu niêm yết đã được ban hành, tăng cường tính giám sát và tuân thủ các quy định giao dịch chứng khoán tại HOSE và HNX. Hệ thống giao dịch chứng khoán niêm yết luôn trong trạng thái ổn định, vận hành thông suốt, tất cả lệnh của NĐT mở tài khoản giao dịch tại ACBS, đã được truyền trực tiếp vào hệ thống của HOSE, HNX và nâng cao khả năng khớp lệnh của NĐT. Giao dịch không sàn là một tín hiệu tích cực cho NĐT, đồng thời là thách thức lớn đối với vận hành hệ thống trong việc đảm bảo đường truyền thông suốt, cũng như các phương án dự phòng khi có sự cố đường truyền, và các biện pháp kiểm soát rủi ro trên toàn hệ thống khi giao dịch trực tuyến.