Phòng tự doanh chịu sự quản lý của ban tổng giám đốc và hội đồng đầu tư. Phòng đầu tư nên chia làm 2 bộ phận hoạt động tách bạch nhau là bộ phận tự doanh cho ACBS và bộ phận đầu tư thay cho khách hàng, bộ phận đầu tư thay cho khách hàng quản lý bộ phận tư vấn đầu tưở kênh phân phối.
Về sản phẩm đầu tư, nên nghiên cứu và mở rộng đầu tư vào nhiều lĩnh vực, bên cạnh đầu tư cổ phiếu, trái phiếu, nên mở rộng đầu tư vào các loại chứng khoán tiềm năng chưa niêm yết, các sản phẩm cơ cấu, đầu tư ra thị trường chứng khoán nước ngoài, các hợp đồng phái sinh, đầu tư mạo hiểm, đầu tư tư nhân, đầu tư vào lĩnh vực nợ xấu, đầu tư hưởng chênh lệch các dự án môi giới đầu tư,...ngoài ra có thể đầu tư vào các doanh nghiệp tiềm năng từ giai đoạn sơ khai, rồi chi phối hoạt động, đẩy mạnh phát triển, sau đó bán lại.
Rủi ro ở phòng đầu tư là tương đối lớn, bài học kinh nghiệm trong thời kỳ khủng hoảng tài chính toàn cầu năm 2008 rút ra bài học là nếu không linh hoạt và nhanh nhạy trong việc xác định thời điểm đầu tư sẽ chịu hậu quả nặng nề từ các khoản lỗ do trích lập dự phòng tài chính và cuối cùng có thể dẫn đến phá sản. Do vậy, ACBS nên xác định được mục tiêu đầu tư, chiến thuật đầu tư và xây dựng các thang đo rủi ro cũng như các công cụ cảnh báo cần thiết đểđo lường mức độ rủi ro, khả năng sinh lời, thời hạn nắm giữ sản phẩm, kỹ luật đầu tư nhằm tránh các phát sinh mâu thuẫn quyền lợi cá nhân và công ty. ACBS cũng nên xây dựng hạn mức cho danh mục đầu tư, mức độ nào nhân viên sẽ có quyền tự quyết định, mức độ nào sẽ trình lên cấp trên phê duyệt để giảm các độ trễ trong đầu tư.
Bộ phận đầu tư ủy thác hiện nay chưa có, nhưng ở các nước phát triển thì hoạt động này rất phổ biến. Do vậy thành lập bộ phận đầu tư này để thực hiện đầu tư theo thỏa thuận mà NĐT ủy thác cho CTCK, tập hợp các dự án đầu tư có quy mô phục vụ cho các đối tượng có vốn nhưng không chuyên trong đầu tư tài chính.
Về nhân sự làm việc ở phòng đầu tư đòi hỏi phải có kinh nghiệm, đạo đức nghề nghiệp, có khả năng phân tích, nắm bắt thị trường cũng như những quan hệ
cần thiết cho công việc. Ngoài ra, phải thực hiện các cam kết không tiết lộ thông tin mật của phòng đầu tư, không trục lợi cá nhân,... Ngoài việc phân chia khu vực làm việc thì còn quy định mức chỉ tiêu lợi nhuận của mỗi phòng ban, nhân viên ở mỗi phòng ban đều chịu trách nhiệm và quyền lợi trên lợi nhuận của mình mang lại.