Ngoài những kết quả đạt được, công tác GDĐĐ và QL việc GDĐĐ còn có một số hạn chế sau:
Ban Giám hiệu còn chưa quan tâm đúng mức đến công tác QL GDĐĐ cho HV. Điều này thể hiện ở việc chưa có kế hoạch chuyên đề về GDĐĐ hàng năm, hàng tháng. Nội dung GDĐĐ cho HV chưa thiết thực, chưa thật
phù hợp với tình hình cụ thể của Trung tâm. Hình thức GDĐĐ cho HV đề ra trong kế hoạch chung còn chưa phong phú, hấp dẫn.
Quy trình QL công tác GDĐĐ chưa rõ ràng, chưa xây dựng được cơ chế phối hợp đồng bộ giữa GV chủ nhiệm, GV bộ môn và các tổ chức khác trong nhà trường để thực hiện công tác GDĐĐ cho HV. Việc phối hợp với các lực lượng giáo dục ở ngoài nhà trường còn thiếu chủ động, chưa tập trung vào các mục tiêu GDĐĐ.
Chưa có các biện pháp chủ động phát hiện sớm, phân công QL các HV có biểu hiện cá biệt để có phương pháp giáo dục hiệu quả ngay từ khi những HV cá biệt này còn ở mức độ vi phạm chưa có hệ thống hoặc ở mức độ nhẹ… Chính vì đơn giản và quá thụ động nên dễ làm HV quá nhàm chán, nhất là đối tượng HV chưa tốt về đạo đức thì chưa tạo được tình cảm mãnh liệt giúp các em nhận thức và điều chỉnh hành vi.
Việc kiểm tra đánh giá chưa tập trung vào các hoạt động GDĐĐ của các tổ chức cá nhân trong nhà trường, chưa thường xuyên coi trọng đúng mức kiểm tra đánh giá chuyên sâu về các hoạt động GDĐĐ và chưa gắn chặt các hoạt động này với công tác khen thưởng, kỷ luật cán bộ, GV và HV. Chủ yếu sơ kết, tổng kết chỉ thông qua sinh hoạt động dưới cờ, bằng những khen, chê theo vụ việc. Ngoài ra, việc triển khai thực hiện kế hoạch của nhà trường cũng chưa hợp lý và chưa kịp thời đúng lúc.
Bên cạnh đó, vẫn còn một số bộ phận nhỏ cán bộ QL, GV chưa có nhận thức đúng và chưa thực sự quan tâm đến công tác GDĐĐ cho HV. Khi chưa có nhận thức đúng đắn thì hiển nhiên hành động sẽ bị sai lệch. GDĐĐ chủ yếu quan tâm đến mặt nhận thức mà chưa chú trọng đến việc rèn luyện ý chí, thái độ hành vi cho HV. Các hình thức tổ chức GD tuy có đa dạng, nhưng nội dung còn quá nghèo nàn, rập khuôn, không đổi mới; phương pháp chưa phù hợp nên chưa uốn nắn kịp thời những hành vi sai lệch của HV. Tuy lồng ghép GDĐĐ thông qua các môn học nhưng trên thực tế, công việc này chưa tiến
hành đồng bộ, chưa được đưa vào tiêu chí đánh giá giờ dạy. Môn Giáo dục công dân chưa được chú trọng, bị xem là môn phụ.
Công tác phối hợp giữa nhà trường, gia đình và xã hội trong quá trình GDĐĐ cho HV chưa đa dạng. Cơ sở vật chất, tài chính hỗ trợ cho các hoạt động của Đoàn còn nghèo nàn, quá eo hẹp. Điều này gây khó khăn trong việc thu hút đông đảo HV tham gia công tác GDĐĐ.
Trên cơ sở phân tích thực trạng hoạt động QL GDĐĐ cho HV Trung tâm GDTX Chu Văn An, chúng tôi thấy rằng: công tác GDĐĐ cho HV đã được mọi cấp, ban, ngành quan tâm. Nhà trường đã chú trọng và đạt được kết quả nhất định. Tuy nhiên, công tác GDĐĐ cho HV vẫn chưa đáp ứng được yêu cầu của xã hội, chưa đạt được mục tiêu giáo dục mà Trung tâm đề ra.