Bên cạnh những mặt tích cực kể trên, nguồn nhân lực của Công ty vẫn còn tồn tại những mặt hạn chế cần phải khắc phục và giải quyết:
- Chưa xây dựng chiến lược phát triển NNL CLC. - Việc đánh giá sau đào tạo chưa thật sự hiệu quả.
- Hàng năm trong hệ thống ngành xăng dầu nói chung và Công ty nói riêng vẫn có sự chảy chất xám. Tuyển dụng được người tài đã khó, nhưng giữ chân được họ thì càng khó hơn, vấn đề đó liên quan đến một phần lương thưởng, ưu đãi nhân viên và quan trọng và môi trường làm việc. Một cuộc điều tra những nhân viên giỏi xin chuyển từ ngành sang lĩnh vực khác ngoài ngành thì được biết rằng lương thưởng với họ và sự ưu đãi của ngành là điều cũng khá quan trọng, song không phải vì lí do đó mà họ quyết định chuyển đi mà là do môi trường làm việc. Họ cần một môi trường làm việc chuyên nghiệp năng động sáng tạo giúp họ có thể vận động bộ não của mình và thấy không nhàm chán. Chính vấn đề đó đặt ra cho Công ty một câu hỏi: làm sao để có môi trường làm việc tốt để giữ nhân viên của mình và không biến Công ty của mình thành một trung tâm đào tạo hộ cho các công ty khác. Công ty cũng lo lắng bởi hàng năm vẫn có nhân viên chuyển sang các lĩnh vực khác, cứ đào tạo được nhân viên thành thạo chuyên môn giàu kinh nghiệm là họ có khả năng xin chuyển, vấn đề này thật sự là đáng lo ngại cho Công ty vì quá trình đào tạo được một nhân viên giỏi giàu kinh nghiệm là vô vùng khó khăn và tốn nhiều công sức tiền bạc.
- Do đặc thù của công ty là ngành kinh doanh đặc biệt nên cần những con người nhạy bén nắm bắt công nghệ, thị trường, tính toán theo khoa học chứ không dựa vào ý chí chủ quan của con người, do đó vấn đề đào tạo nhân lực trong ngành xăng
dầu là vấn đề cần đặt lên hàng đầu. Hiện nay, Công ty đã chú trọng tới việc gửi nhân viên của mình ra nước ngoài học tập kinh nghiệm, tuy nhiên một số nhân viên còn chưa thực sự nhạy bén với công việc, hoạt động công việc buồn chán tẻ nhạt.