Thứ nhất, Một số cấp ủy Đảng chưa nghiờm tỳc thực hiện Chỉ thị 09- CT/TW, chưa coi trọng cụng tỏc lónh đạo, chỉ đạo việc giải quyết khiếu nại, tố cỏo; cũn cho việc giải quyết khiếu nại, tố cỏo là nhiệm vụ của chớnh quyền. Chỉ thị 09-CT/TW xỏc định rừ trỏch nhiệm của Ban thường vụ cấp ủy mà trước hết là đồng chớ Bớ thư phải trực tiếp lónh đạo, chỉ đạo cụng tỏc giải quyết khiếu nại, tố cỏo.
Thứ hai, trỏch nhiệm của một số cơ quan cú thẩm quyền tiếp dõn, giải quyết khiếu nại, tố cỏo chưa cao, chưa thực hiện đầy đủ chức năng theo quy định. Luật khiếu nại, tố cỏo quy định nhiệm vụ giải quyết khiếu nại, tố cỏo là của thủ trưởng cỏc cơ quan nhà nước nhưng nhiều nơi lại ủy nhiệm cho cơ quan thanh tra tiếp dõn, giải quyết khiếu nại, tố cỏo. Việc chấp hành kỷ cương, kỷ luật hành chớnh trong cụng tỏc quản lý nhà nước, trong giải quyết khiếu nại, tố cỏo chưa được coi trọng, mang tớnh hỡnh thức.
Thứ ba, một số nơi tổ chức Đảng, chớnh quyền đoàn thể ở cơ sở yếu kộm, nội bộ mất đoàn kết, cỏn bộ, đảng viờn thoỏi húa biến chất, cú sai phạm nhưng giấu giếm, khụng xử lý kịp thời và nghiờm minh.
Thứ tư, đội ngũ cỏn bộ tiếp dõn cú nhiệm vụ tham mưu giải quyết khiếu nại, tố cỏo vừa thiếu về số lượng, vừa yếu về năng lực chuyờn mụn, cỏ biệt cú nơi yếu cả về phẩm chất đạo đức. Cú cỏn bộ thiếu tinh thần trỏch nhiệm, hoặc tiờu cực, tham nhũng nờn thẩm tra, xỏc minh khụng chớnh xỏc...Trong khi đú, cụng tỏc đào tạo bồi dưỡng, bố trớ cỏn bộ làm nhiệm vụ
này cũn hạn chế.
Thứ năm, hệ thống phỏp luật tố cỏo hành chớnh và giải quyết tố cỏo hành chớnh chưa hoàn thiện. Cỏc quy định về tố cỏo hành chớnh và giải quyết tố cỏo hành chớnh tỏ ra mờ nhạt trong cỏc văn bản phỏp luật và rất ớt khi được “đụng” đến trong những lần sửa đổi phỏp luật về khiếu nại, tố cỏo. Những quy định về thẩm quyền giải quyết tố cỏo, thủ tục giải quyết tố cỏo, quyền và nghĩa vụ của người bị tố cỏo, người tố cỏo, biện phỏp bảo vệ người tố cỏo, thời hạn giải uyết tố cỏo...cũn cú những vướng mắc làm giảm kết quả giải quyết tố cỏo.
Thứ sỏu, việc tổ chức phổ biến, giỏo dục phỏp luật về tố cỏo và giải quyết tố cỏo đó được cỏc cấp, cỏc ngành quan tõm, song chưa đỏp ứng được yờu cầu đặt ra, chưa sõu, chưa tiến hành thường xuyờn, hỡnh thức cũn đơn điệu, chưa cú biện phỏp và hỡnh thức cụ thể phự hợp với thực tiễn.
2.2 Thực trạng phỏp luật về tố cỏo hành chớnh và giải quyết tố cỏo hành chớnh ở nƣớc ta hiện nay.