Dụng cụ: Phải được vô trùng tuyệt đối (hấp ướt 120°C trong 20 phút)

Một phần của tài liệu xác định đột biến mất đoạn gen dystrophin gây bệnh loạn dưỡng cơ duchenne ở mức độ mrna và phát hiện (1) (Trang 39)

- Nhóm nghiên cứu:

2.2.1. Dụng cụ: Phải được vô trùng tuyệt đối (hấp ướt 120°C trong 20 phút)

- Máy Gene Amp PCR System 9700 (USA), - Tủ lạnh sâu: -30°C; -80°C (SANYO), - Máy điện di: Mupid (Nhật Bản),

- Máy soi gel và chụp ảnh tự động thạch đã điện di: (Dolphin Chemi Wealtec, USA),

- Máy quang phổ kế Thermo Electron Corporation của hãng Biomate, - Máy điện di mao quản Agilent 2100 Bioanalyzer,

- Máy ly tâm lạnh Beckman (USA) và ly tâm để bàn Eppendorf (Đức), - Lò vi sóng (Samsung),

- Tủ nuôi cấy có chế độ lắc,

- Máy đọc trình tự gen 3100-Avant Genetic Analyzer của hãng ABI-PRISM - Tủ ấm,

- Pipet, đầu cụn cỏc loại,

- Eppendorf 1,5 ml, ống phalcol. - Cóng đo sạch.

- Chai nuôi cấy tế bào: diện tích mặt đáy 25 cm2, nhãn hiệu Nunc.

2.2.2. Hóa chất

* Hoá chất dùng để tách chiết DNA:

- Dung dịch lysis buffer, - Dung dịch K,

- Dung dịch SDS 10%, - Proteinase K (10 mg/l),

- Dung dịch phenol : chloroform : isoamyl với tỷ lệ 25:24:1, - Dung dịch chloroform : isoamyl với tỷ lệ 24:1,

- Ethanol 100% và ethanol 70%, - Sodium acetate 3M, pH=5,2,

- Dung dịch hòa tan DNA sau khi tách.

Dung dịch Lysis buffer

Hoá chất Nồng độ working Lượng hút

(tổng 500ml)

Saccarose 0,3M 51,3 g

Trisbase HCl (pH= 7,5) 0,01M 0,785 g

MgCl2 0,005M 0,2375 g

Trixton X-100 1% (v/v) 5ml (cho sau)

Chỉnh pH =7,5 bằng HCl, dẫn nước đến 500ml

Dung dịch K

Hoá chất Nồng độ working Lượng hút

(tổng 200ml)

NaCl 0,075M 0,8775g

EDTA 0,024M 1,7868g

* Hóa chất tách chiết RNA tổng số (Wako):

+ Isogen, Isopropanol, + Ethanol 70%,

+ DEPC - water.

* Hóa chất tổng hợp cDNA (Invitrogen):

+ Random primer, + dNTP 10mM, + PCR buffer 5X,

+ DTT 0,1M (proteinase inhibitor), + HPRI (RNAase inhibitor),

+ MMLV-RT (enzym tổng hợp ngược).

* Hóa chất chạy PCR (Invitrogen):

+ 10 X buffer, + dNTP mix, + Taq polymerase,

+ Các cặp mồi (xuôi và ngược).

* Hoá chất nhân dòng gen:

+ Vector tạo dòng,

+ Môi trường nuôi cấy khuẩn lạc, + X-gal, ITPG,

+ Kháng sinh.

* Hoá chất để đọc trình tự:

+ Big dye, cột lọc.

* Hóa chất nuôi cấy tế bào ối:

+ Môi trường nuôi cấy AmnioMax của hóng Gibco, + Huyết thanh bê, trypsin 2,5%,

Một phần của tài liệu xác định đột biến mất đoạn gen dystrophin gây bệnh loạn dưỡng cơ duchenne ở mức độ mrna và phát hiện (1) (Trang 39)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(115 trang)