Bào tử vi khuẩn cĩ khả năng chịu nhiệt tốt nhất ở tất cả các sinh vật sống, lần đầu tiên được mơ tả bởi Robert Koch và Ferdinand Cohn vào năm 1876. Vào năm 1933, Bayne-Jones và Petrilli lần đầu tiên đưa ra các hình ảnh minh họa về quá trình phát sinh tạo bào tử trong đĩ cĩ một loạt ảnh liên quan đến sự thay đổi hình thái của tế bào chuyển từ dạng tế bào sinh dưỡng đến lúc hình thành bào tử. Vào những năm 1960 và 1970, nhờ vào sự phát triển của các phương pháp nuơi
cấy và sử dụng các kính hiển vi điện tử hiện đại đưa đến những hiểu biết chi tiết về bào tử vi khuẩn cũng như quá trình phát sinh tạo bào tử ở vi khuẩn [17].
Dễ dàng nhận ra rằng do các điều kiện bất lợi mà rõ ràng nhất là tình trạng cạn kiệt dinh dưỡng đã khởi đầu cho sự hình thành nội bào tử. Một ngoại lệ là ở Clostridium acetobutylicum khi sự tích lũy của các sản phẩm cuối acid là nguyên nhân ức chế tế bào phân chia và khởi đầu cho quá trình sinh dung mơi dẫn tới sự thay đổi hình thái tế bào [31].
Hình 2.2: Sự hình thành bào tử ở C. acetobutylicum trong lên men ABE [31] Thơng thường, sự hình thành bào tử xảy ra khi chất dinh dưỡng bắt đầu cạn kiệt, nguồn nitrogen cũng cĩ thể là yếu tố cần thiết cho sự hình thành bào
tử. Những yếu tố khác cũng cĩ khả năng ảnh hưởng đến sự hình thành bào tử như: pH, oxy và nhiệt độ. Sự tăng khả năng tiêu thụ cơ chất thường thấy trong giai đoạn đầu của quá trình hình thành bào tử trong khi ở một vài giống của C. botulinum, nguồn carbon dự trữ nội sinh được sử dụng trong suốt quá trình hình thành bào tử [17].