(khác từ 2 - 3 band) Phân lập năm 01, 02 C2 15 (14,7) Có thể có liên quan với C
(khác C từ 4 - 6 bands)
Phân lập năm 01, 02, 03, 04
D 4 (3,9) Có liên quan gần với nhau
(khác nhau 2 - 3 bands) Phân lập năm 01, 02, 03
Không xếp
loại (KXL) 6 (5,9)
Có kiểu PFGE riêng lẻ và không có mối liên quan về ADN với nhau và các kiểu trên.
Phân lập năm 01, 02
Tổng 102 (100%)
Chú thích: mỗi nhóm genotype (bảng 3.9) bao gồm một genotype (kiểu gen) chính
chiếm số lượng chủng lớn nhất (ký hiệu chữ cái hoa, như A, B… ) và một hay nhiều genotype phụ (ký hiệu A1, A2, B1, B2…)
Biểu đồ 3.5 : Phân bố tỷ lệ từng nhóm genotype của các chủng Hib phân lập được từ bệnh nhi VMN.
Kết quả biểu đồ 3.5 cho thấy 102 chủng Hib được phân lập từ 102 bệnh nhi VMN thuộc về 4 nhóm gen chủ yếu (A, B, C và D) và một số lượng ít (5,9%) chủng Hib thuộc genotype không xếp loại. Trong đó, những chủng
Hib trong cùng một nhóm genotype (kiểu gen) sẽ hoàn toàn giống nhau về
gen hoặc có liên quan với nhau về gen và không có mối liên quan về gen với những chủng thuộc nhóm genotype (kiểu gen) khác. Cụ thể ở bảng 3.9:
- Nhóm A phổ biến nhất, gồm 49 chủng chiếm 48,0% (49/102) có 01 kiểu chính là A (23,5%), các chủng kiểu A thuộc về những năm 2004- 2007; kiểu phụ A1 (18,6%) có liên quan gần với kiểu A bao gồm những chủng phõn lập năm 2001-2003; kiểu phụ A2 (5,9%) gồm những chủng phõn lập năm 2004-2007, có thể có liên quan với chủng thuộc kiểu A.
- Nhóm B gồm 21 chủng, chiếm 20,6%. Trong đó, có 01 kiểu chính B (3,9%) gồm 4 chủng giống nhau hoàn toàn, phõn lập năm 2005-2006; kiểu B1 (9,8%) liên quan gần với B, phõn lập năm 2005-2006; kiểu B2 (6,9%) có thể có liên quan (liên quan xa) với B, phõn lập năm 2006-2007.
- Nhóm C gồm 22 chủng, chiếm 21,6%. Trong đó, có 01 kiểu chính là C (2,9%) có 3 chủng giống nhau hoàn toàn, phõn lập năm 2001; kiểu phụ C1 (4,0%) liên quan gần với C, phõn lập năm 2001-2002; kiểu phụ C2 (14,7%) gồm 15 chủng có thể có liên quan với C, phõn lập ở các năm 2001, 2002, 2003, 2004.
- Nhóm D chỉ có một loại gồm 4 chủng có liên quan gần với nhau, phõn lập năm 2001, 2002 và 2003 chiếm 3,9%.
- Nhóm các chủng không xếp loại được gồm có 6 (5,9%) chủng, phõn lập năm 2001 và 2002. Những chủng này có kiểu gen khác hoàn toàn với 4 nhóm genotype trên.
Khả năng phân loại vi khuẩn Hib gõy VMN trong nghiên cứu này dựa trên kết quả phõn tích PFGE, được tớnh với công thức của Paul R. Hunter và
Micheal A. Gaston [49], [50]. Cho thấy chỉ số phõn biệt: DI = 1 - 0,127 =
0,873. Có nghĩa là nếu ta phân lập ngẫu nhiên được 2 chủng Hib thì xác suất chúng được xếp vào 2 genotype (kiểu gen) là 87,3%.
3.1.6. Đỏnh giá mối tương quan giữa đặc điểm phân loại biotype, genotype, khả năng sinh enzym β-lactamase và mức độ đề nhạy cảm với kháng sinh khả năng sinh enzym β-lactamase và mức độ đề nhạy cảm với kháng sinh của các chủng Hib gây VMN
3.1.6.1. Đỏnh giá mối tương quan giữa đặc điểm phân loại biotype và khả năng sinh enzym β-lactamase
Bảng 3.10:Mối liên quan giữa biotype và khả năng sinh β-lactamase β - lactamase
Biotype
+ - Tổng
Số lượng % Số lượng % Số lượng %
I 12 70,6 05 29,4 17 100
II 30 41,7 42 58,3 72 100
III 05 55,6 04 44,4 09 100
IV 03 100 0 0 03 100
V 01 100 0 0 01 100
p > 0,05 (Chi-square test, Fisher' s exact test)
Bảng 3.10 cho thấy những vi khuẩn có cùng một biotype (typ sinh học) có thể có khả năng sinh β-lactamase khác nhau. Cụ thể, biotype I có số chủng
Hib sinh β-lactamase là 70,6%; biotype II là 41,7% và các biotype khác có số
lượng rất nhỏ nên không thực hiện so sánh thống kê. Vì vậy, kết quả cho thấy đặc điểm phõn bố theo biotype và khả năng sinh enzym β-lactamase của các chủng Hib gõy VMN độc lập với nhau (p > 0,05).
3.1.6.2. Đỏnh giá mối tương quan giữa đặc điểm phân loại genotype và khả năng sinh enzym β-lactamase
Bảng 3.11: Phân loại kiểu gen của những chủng Hib gây VMN có β- lactamase (+)
Kiểu PFGE Số lượng
chủng (%) Mức độ liên quan
A 2 (3,9) Giống nhau hoàn toàn
A2 06 (11,8) Có thể có liên quan với A
B 04 (7,85) Giống nhau hoàn toàn
B1 10 (19,6) Liên quan gần với B
B2 07 (13,7) Có thể có liên quan với B
C 3 (5,9) Giống nhau hoàn toàn
C1 4 (7,85) Liên quan gần với C
C2 15 (29,4) Có thể có liên quan với C
Tổng 51 (100%)
Bảng 3.11 cho thấy những chủng Hib có enzym β- lactamase (+) thuộc 3 kiểu gen chính (A, B và C): kiểu A chỉ chiếm 3,9% (2 chủng); 6 chủng (11,8%) liên quan xa với A (A2); kiểu B chiếm 7,85% (4 chủng), 10 chủng (19,6%) liên quan gần B (B1), 7 chủng (13,7%) có thể có liên quan với B (B2); kiểu C chiếm 5,9% (3 chủng), 4 chủng (7,85%) liên quan gần với C (C1), 15 chủng (29,4%) có thể có liên quan với C (C2).
Bảng 3.12: Phân loại kiểu gen của những chủng Hib gõy VMN có β- lactamase (-)
Kiểu PFGE Số lượng chủng (%) Mức độ liên quan
A 22 (43,1) Giống nhau hoàn toàn
A1 19 (37,2) Liên quan gần với A
D 04 (7,9) Liên quan gần với nhau
KXL
(Không xếp loại) 06 (11,8)
Không có liên quan với nhau
và các genotype khác
Tổng 51 (100%)
Bảng 3.12 cho thấy: trong 51 chủng Hib có enzym β- lactamase (-) gồm 2 genotype (kiểu gen) chính, đó là genotype A và A1 (liên quan gần với
genotype A) chiếm đa số (43,1% và 37,2%); genotype D (gồm những chủng có liên quan gần với nhau) chiếm tỷ lệ thấp hơn (7,9%), những genotype riêng lẻ không xếp loại chiếm 11,8% (6 chủng).
3.1.6.3. Đỏnh giá mối tương quan giữa đặc điểm phân loại biotype và genotype của các chủng Hib gõy bệnh
Bảng 3.13: Mối liên quan giữa genotype và biotype
Biotype
(Typ sinh học)
Genotype (kiểu gen PFGE)
A B C D
I 0 5 0 0
II 24 0 3 3
Tổng 24 5 3 3
Bảng 3.13 so sánh mối liên quan giữa những genotype chớnh (genotype bao gồm toàn bộ những chủng giống hệt nhau về cấu trúc ADN theo phõn tích PFGE) về phõn bố biotype, cho thấy những chủng Hib được xếp vào cùng một genotype thì luôn cũng có chung biotype.
3.2. Kết quả phân tích các chủng Hib phân lập được từ trẻ khỏe mạnh
3.2.1. Đặc điểm của các chủng vi khuẩn Hib phân lập được từ trẻ khỏe mạnh dưới 5 tuổi mạnh dưới 5 tuổi
