Trong qúa trình phát sinh páht triển của bệnh cây chủ luôn luôn phải đấu tranh với vật gây bệnh. Dựa vào thời kỳ phát sinh ngời ta chia ra mấy loại: chống tiếp xúc, chống xâm nhập, chống khuếch tán, chống tổn thất. Mỗi giai đoạn đèu thể hiện phơng thức khác nhau. Dựa vào cơ chế kháng bệnh có thể chia ra tính kháng bệnh kết cấu ( hay tính kháng bệnh vật lý hoặc cơ giới) và tính kháng bệnh sinh hóa.
Thực vật nói chung có 2 hoạt động tự bảo vệ đề kháng với vật gây bệnh, một là tác dụng cản trở, thông qua đặc diểm mô và kết cấu mà ngăn cản sự tiếp xúc của vật gây bệnh, cản trở sự lây lan vật gây bệnh, đó là tính kháng bệnh kết cấu; hai là trong tế bào hoặc trong mô phát sinh một loạt phản ứng
sinh lý sinh hoá, sản sinh ra các chất có tác dụng gây độc đối với vật gây bệnh, đó là tính kháng bệnh sinh hoá.
Thực vật dựa vào đặc điểm kết cấu mô sẵn có mà chống lại sự tiếp xúc và xâm nhập của vật gây bệnh, phát huy tác dụng chống sự xâm nhập. Kết cấu phòng gự đó là do thiên nhiên tự tạo ví dụ lông tơ dày ra, tầng cutin dày ra, hình thành tầng cách ly chống chịu nớc hoặc chống chịu sâu. Chúng có mật độ khí khổng tha hoặc lỗ khí khổng rất nhỏ, vật gây bệnh rất khó xâm nhập. Mặt khác sau khi vật gây bệnh xâm nhập kết cấu mô cây chủ biến đổi hoặc gây phản ứng chết tế bào để ức chế sự phát triển vật gây bệnh. Những biến đổi đó không thể tách rời với sự trao đổi chất sinh hoá của cây chủ.
Một vật gây bệnh khi tiếp xúc và xâm nhập vào cây chủ, cũng bị sức đề kháng rất mạnh thông qua phản ứng sinh hoá. Một vật gây bệnh chỉ xâm nhập 1 loài cây chủ mà không xâm nhiễm đến các cây chủ khác phần lớn trong các cây chủ đó có phản ứng sinh hoá rất mạnh để đề kháng làm cho chúng không thể lập quan hệ ký sinh đợc. Cúng giống nh tính đề kháng của mô cây chủ, phản ứng sinh hoá này là do thiên nhiên tạo ra và cũng đợc chia ra hai loại: tính đề kháng sinh hoá sẵn có và tính đề kháng do biến đổi chất.
Tính đề kháng thiên nhiên bao gồm các chất ức chế Nấm vi khuẩn tiết ra ngoài cơ thể cây chủ nh loại hành tỏi, thông, bách. Nhiều vi sinh vật bị chất tiết của thực vật gồm các chất hoá học nh phenol, terpene, naphthalene.Một số loài cây khong thể trở thành cây chủ của vật gây bệnh bởi vì trong cơ thể cây thiếu chất nào đó mà vật gây bệnh có thể nhận biết nên không thể lập quan hệ ký sinh đợc.
Sau khi vật gây bệnh xâm nhập, cây chủ cũng có phản ứng quyết liệt, thẻ hiện rõ nhất là chúng hình thành các mô chết mà vật gây bệnh không thể hút dinh dỡng đợc. Cũng có loại cây chủ xung quanh vật gây bệnh hình thành các chất diệt khuẩn lẫn vào trong tế bào, ngời ta gọi là chất bảo vệ thực vật (phytoalexin).
Một số chất thông qua biến đổi hoá học để đề kháng bệnh nh sự hoạt hoá chất phosphovalerose, từ đó sản sinh nhiều chất chống khuẩn; sự sao chép ARN và phiên dịch protein tăng nhanh phá hoại hệ enzym của vật gây bệnh. Đặc tính biến đổi này biểu hiện cơ sở di truyền tính kháng bệnh.