Ngày nay, với sự phát triển của các kỹ thuật sinh học phân tử hiện đại việc phân loại nấm men và nấm mốc càng cải tiến hơn, sự chuyển định danh nấm men và nấm mốc từ các đặc điểm hình thái, sinh lý, sinh hĩa sang phương pháp định danh dựa trên vật liệu di truyền, hai vùng trình tự được sử dụng phổ biến ngày nay là vùng trình tự D1/D2 của rRNA tiểu đơn vị lớn (LSU-rRNA; 25/26/28S) và/hay vùng trình tự ITS-5.8S rRNA-ITS [16], [21], [22], [33], [34], [42], [44], [59].
Sự phân tích vùng trình tự D1/D2 của rRNA tiểu đơn vị lớn (LSU-rRNA; 25/26/28S) và/hay vùng trình tự ITS-5.8S rRNA-ITS cĩ thể định danh những lồi cĩ mối quan hệ gần gũi với nhau. Do đĩ, việc giải trình tựđoạn gene đặc trưng này
đã được áp dụng trong phân loại nấm tới mức lồi [16], [37], [43], [60], [87], [91], [98].
Hình 1.9: Cấu trúc của trình tự mã hố cho rRNA ở Eukaryote [91]
Phương pháp giải trình tự vùng D1/D2 của rRNA tiểu đơn vị lớn (LSU- rRNA; 25/26/28S) và/hay vùng trình tự ITS-5.8S rRNA-ITS kết hợp với việc xây dựng cây phát sinh chủng lồi hiện nay trở nên khá phổ biến để định danh nhanh các chủng nấm men và nấm mốc, được xây dựng dựa trên sự kết hợp giữa sinh học phân tử với phân tích trên máy tính. Những trình tự mới này sẽ được so sánh với những trình tự trong ngân hàng dữ liệu gene bằng cách sử dụng cơng cụ BLAST. Máy sẽ cho kết quả những lồi cĩ số trình tự tương đồng cao nhất với chủng ta đang khảo sát. Sau đĩ sử dụng chương trình xây dựng cây phát sinh chủng lồi (như
MEGA, TreeView, …) để tập hợp những thơng tin cĩ liên quan đến tiến hĩa được thu nhận từ những thơng tin trên [9], [10], [11], [18], [24], [57], [58], [92].
CHƯƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP