- Theo nguyên nhân thất thu thuế + Thất thu do nguyên nhân chủ quan:
Thất thu thuế nhập khẩu phát sinh do đối tượng nộp thuế cố tình trốn tránh nghĩa vụ thuế như: khai sai chủng loại hàng hóa để được hưởng thuế suất thấp; khai trị giá hải quan thấp hơn giá trị thực thanh toán; gian lận định mức đối với hàng hóa nhập khẩu để gia cơng hàng hóa cho nước ngồi và sản xuất hàng xuất khẩu, phần nguyên vật liệu dư thừa bán vào thị trường nội địa; lợi dụng chính sách ân hạn nộp thuế nhập khẩu, sau khi nhập khẩu hàng hóa thì tiêu thụ nhanh chóng rồi đã bỏ trốn...
+ Thất thu do nguyên nhân khách quan:
Do Nhà nước ban hành chính sách quản lý thuế chưa rõ ràng; Biểu thuế xuất khẩu, nhập khẩu có nhiều dịng hàng có tên hàng hóa tương tự nhưng mức thuế suất lại khác nhau nên doanh nghiệp thường lựa chọn các dịng hàng có mã số, thuế suất thấp hoặc 0% để áp mã hàng hóa dẫn tới tranh chấp về mã số thuế, trị giá hải quan giữa đối tượng nộp thuế với cơ quan hải quan; đặc biệt đối với những mặt hàng chưa được định danh cụ thể trong Biểu thuế hoặc thành phần, cấu tạo hàng hóa khơng được doanh nghiệp khai cụ thể nên cơ quan hải quan tiến hành phân tích, phân loại hàng hóa để xác định mã số, thuế suất nhập khẩu…Vì vậy, dẫn đến phát sinh số thuế phải nộp bổ sung sau khi hàng hóa được thơng quan. Văn bản chính sách về thuế của Nhà nước ổn định chưa cao, có những thời điểm thay đổi thuế suất tăng đối với một số hàng hóa này và giảm hoặc miễn thuế đối với một số hàng hóa
khác làm cho các doanh nghiệp gặp khó khăn trong việc sản xuất, tính giá thành sản phẩm và đặc biệt làm cho doanh nghiệp dễ bị nợ thuế…
- Tính chất của thất thu thuế:
Căn cứ vào tính chất của tiền thuế bị thất thu, có thể phân loại thất thu thuế thành hai loại:
Số tiền thất thu thuế nhập khẩu có khả năng thu hồi: Là các khoản nợ thuế như chờ xác định lại trị giá tính thuế; hoặc có kết quả phân tích, phân loại, giám định hàng hóa; kiểm tra sau thơng quan, bảo lãnh quá thời hạn… nhưng doanh nghiệp vẫn cịn hoạt động bình thường. Trường hợp này cơ quan hải quan đôn đốc, nhắc nhỡ thì doanh nghiệp sẽ nộp, vì nếu doanh nghiệp khơng nộp thuế bổ sung thì sẽ khơng nhận được hàng hóa nhập khẩu.
Số tiền thất thu thuế nhập khẩu khơng có khả năng thu hồi: Là các khoản thuế phải truy thu, ấn định thuế mà đối tượng nộp thuế khơng có khả năng nộp thuế do các doanh nghiệp nợ thuế khơng cịn nguồn vốn để nộp, doanh nghiệp giải thể, phá sản hoặc làm ăn thua lỗ, bỏ trốn...
Cách thức phân loại thất thu thuế nhập khẩu cho chúng ta thấy mỗi loại thất thu và nguyên nhân dẫn đến thất thu thuế nhập khẩu là rất khác nhau. Việc phân loại thất thu thuế có ý nghĩa quan trọng trong việc xử lý và đề ra các biện pháp quản lý, thu hồi thuế nhập khẩu cho phù hợp.