Các chương trình ban đầu của UNESCO về khoa học cơng nghệ nhằm hai mục tiêu gắn bĩ với nhau. Đĩ là phát triển khoa học vì lợi ích của các dân tộc và làm chủ khoa học vì sự phát triển nhịp nhàng của mọi xã hội. Khác với các cơ quan chuyên mơn khác của LHQ chỉ giải quyết từng m t, UNESCO cĩ chương trình khoa học kỹ thuật, khoa học cơ bản và khoa học ứng dụng trên nhiều lĩnh vực. Tùy theo từng giai đoạn mà UNESCO đ t ra những trọng tâm khác nhau. Trong giai đoạn hiện nay UNESCO tập trung vào 3 lĩnh vực tin học, vi sinh học ứng dụng và kỹ nghệ sinh học và năng lượng mới và năng lượng tái sinh.
Ngồi các hoạt động về chính sách, nghiên cứu và đào tạo, UNESCO tổ chức việc thực hiện những chương trình hợp tác quốc tế lớn trên nhiều vấn đề khoa học - kỹ thuật quan trọng như Chương trình con người và sinh quyển (MAB), Chương trình thủy văn quốc tế (PHI), Chương trình quốc tế liên địa chất (PICG)…
Việt Nam tích cực hưởng ứng và tham gia tất cả các chương trình khoa học lớn của UNESCO. Việt Nam tranh thủ tối đa sự giúp đỡ nhiều m t như tài trợ tài chính, kỹ thuật, cung ứng thiết bị, học bổng nâng cao ngu n nhân lực. Bên cạnh đĩ Việt Nam đã cử chuyên gia đầu ngành của mình tham gia vào cơ cấu điều hành một số cơ quan, chương trình khoa học của UNESCO.
Chương trình con người và sinh quyển (MAB)
Chương trình này ra đời nhằm mục tiêu phục vụ sự phát triển bền vững thơng qua mối quan hệ hài h a giữa con người và thiên nhiên mà nội dung chính là sự cân bằng bền vững giữa yêu cầu bảo vệ tính đa dạng sinh học với phát triển kinh tế và giữ gìn các giá trị văn hĩa. Từ năm 1974, MAB đã đề xuất việc lập các khu dự trữ sinh quyển (DTSQ) nhằm giúp các nước bảo t n sự đa dạng sinh học, kết hợp phát triển kinh tế và duy trì văn hĩa trong các khu dự trữ ấy. Các khu này cũng là nơi để tiến hành các hoạt động nghiên cứu, quan trắc và giáo dục đào tạo… Việt Nam cĩ 9 khu DTSQ được UNESCO cơng nhận là khu DTSQ thế giới: Rừng ngập m n Cần Giờ (2000), Rừng Quốc gia Cát Tiên (2001), Quần đảo Cát Bà và Vùng đất ngập nước Châu Thổ sơng H ng (2004), khu DTSQ Kiên Giang (2006), khu DTSQ Tây Nghệ An (9/2007). Ngày 26/5 /2009 Cù Lao Chàm (Quảng Nam) và Mũi Cà Mau được cơng nhận khu DTSQ thế giới. Gần đây nhất, tại Kỳ họp lần thứ 27, ngày 9/6/2015, Hội đ ng Điều phối Quốc tế Chương trình Con người và Sinh quyển của UNESCO, đã cơng nhận là Lang Biang là Khu DTSQ tại Việt Nam, đưa tổng số Khu DTSQ Thế giới tại Việt Nam lên con số 9 khu. Đây cịn là Khu DTSQ Thế giới đầu tiên tại miền đất Tây Nguyên hùng vĩ.
Việc thiết lập và cơng nhận các khu DTSQ nhằm bảo t n các hệ sinh thái động thực vật cĩ giá trị. Ngồi ra các khu DTSQ ở Việt Nam đang nhận được sự quan tâm của các TCQT, của các nhà lãnh đạo các cấp và nhân dân địa phương.
Chương trình Hải dương học quốc tế (IOC)
Chương trình này nhằm xây dựng hệ thống quan sát đại dương trên tồn cầu phục vụ dự báo thời tiết, và đưa ra những cảnh báo về các biến đổi khí hậu tồn cầu. UNESCO đã thiết lập Hệ thống quan sát Đại dương quốc tế (GOOS). Việt Nam tham gia Ban biên tập bản đ độ sâu Tây Thái Bình Dương. Đây là vấn đề nhạy cảm nên tại các phiên họp của ban, Việt Nam luơn kiên quyết bảo vệ lập trường về chủ quyền lãnh hải. Năm 2005, Ủy ban IOC của Việt Nam đã đăng cai tổ chức Phiên họp thứ 6, Phân ban Tây Thái Bình Dương của Ủy ban liên chính phủ về Hải dương học. Ngồi ra Việt Nam đang vận động UNESCO giúp Việt Nam phục chế và bảo quản tài liệu cổ về Hải dương học.
Chương trình Thủy văn Quốc tế (IHP)
Chương trình này ra đời nhằm bảo vệ, khơi phục ngu n nước gắn liền với chiến lược phát triển nhằm ngăn ch n xung đột về nước giữa các quốc gia. UNESCO đã thực hiện "Dự án Tầm nhìn Thế giới về nước năm 2015". Việt Nam hiện được UNESCO hỗ trợ các dự án về quản lý bền vững các ngu n nước tại các bộ phận dân cư thiệt th i vùng sâu vùng xa; tăng cường ngu n nước ngầm bằng phương pháp bơm nhân tạo cho những khu vực hạn hán ở 2 tỉnh Ninh Thuận và Phan Thiết; xử lý và tái sử dụng ngu n nước thải...
Chương trình khoa học địa chất Quốc tế (IGCP)
Chương trình này ra đời nhằm bảo vệ và sử dụng hữu hiệu ngu n khống sản và năng lượng nhằm giảm thiểu rủi ro, tai nạn thiên nhiên tại các nước đang phát triển. Đối với Việt Nam, các chuyên gia địa chất hàng đầu của Việt Nam cũng đã tham gia ho c làm chủ các đề tài nghiên cứu địa chất do Hội đ ng khoa học của IGCP xét duyệt như lập bản đ địa hĩa thế giới, sự tiến hĩa của bờ biển Đệ Tứ; các đá cổ nhất trên trái đất, các tầng chứa nước trong Karst và tài nguyên nước; địa từ trường vùng xích đạo…
Tháng 9/2004, Viện nghiên cứu địa chất và khống sản Việt Nam đã đăng cai tổ chức Hội nghị quốc tế liên ngành về phát triển và bảo t n vùng
núi đá vơi. Những kinh nghiệm trong Hội nghị này đã giúp Việt Nam nâng cao nhận thức các nguy cơ ở vùng núi đá vơi, mối liên quan giữa điều kiện tự nhiên và tập quán kinh tế qua đĩ cĩ thể giảm nguy cơ và giải quyết mâu thuẫn giữa bảo t n và phát triển bền vững. Đĩ là sự khẳng định vai tr và đĩng gĩp của Việt Nam về lĩnh vực này ở khu vực và quốc tế. Việt Nam cũng đang tích cực triển khai đề án "Cơng viên địa chất" theo sáng kiến của UNESCO nhằm tiến hành đánh giá tác động mơi trường địa chất nhằm bảo vệ và bảo t n tốt hơn các di sản văn hĩa thế giới tại Việt Nam