Hiện tại, các vùng nông thôn Phú Thọ tuy bước đầu đã xây dựng các hệ thống cung cấp nước sinh hoạt cho nhân dân nhưng nhìn chung vẫn còn nhiều địa phương, đặc biệt là các xã tập trung các làng nghề vẫn chưa có hệ thống cung cấp nước sạch tập trung đảm bảo các tiêu chuẩn của Bộ y tế qui định. Các trạm cấp nước như giếng khoan, nước tự chảy, nước sông hoặc nước giếng khơi cho nhu cầu sinh hoạt hàng ngày được xây lắp nhưng không đảm bảo vệ sinh, thậm chí còn bị ô nhiễm và nhiễm các chất độc hại. Điều này ảnh hưởng rất lớn đến sức khỏe của nhân dân và đang đặt ra một nhiệm vụ hết sức cấp bách cho chính quyền các cấp và nhân dân trong tỉnh. Chính vì vậy, tỉnh cố gắng thực hiện chương trình mục tiêu tại quyết định số Số: 491/QĐ-UBND ngày 18/2/2011của UBND tỉnh Phú Thọ đề ra đến năm 2015: Đạt 95% dân nông thôn được sử dụng nước hợp vệ sinh cho sinh hoạt, trong đó 40% được sử dụng nước sạch đạt tiêu chuẩn Quốc gia từ công trình cấp nước tập trung.
Song song với việc cấp nước sinh hoạt cho đô thị thì việc đầu tư xây dựng hệ thống cấp nước sạch nông thôn cũng được Đảng và Nhà nước quan tâm thông qua các chương trình mục tiêu quốc gia về nước sạch và vệ sinh môi trường nông thôn. Khi các dự án hoàn thành đưa vào sử dụng cấp nước
sinh hoạt kịp thời cho nhân dân và chất lượng nước đảm bảo, không ngừng nâng cao đời sống, sức khoẻ cho nhân dân trong tỉnh và tránh được một số dịch bệnh do ô nhiễm nguồn nước gây ra như bệnh đau mắt hột, bệnh đường ruột, bệnh ngoài da, bệnh ung thư do trong nước chứa nhiều hàm lượng Asen, chì, sắt… vượt quá tiêu chuẩn cho phép. Trong những năm qua, công ty cấp nước tỉnh Phú Thọ đã tham mưu cho Sở Nông nghiệp và phát triển nông thôn, UBND tỉnh đầu tư xây dựng các công trình cấp nước tập trung, tạo cảnh quan môi trường nông thôn xanh - sạch - đẹp, ý thức của nhân dân về nước sạch và vệ sinh môi trường được nâng cao.