Hàng năm, phòng Tài chính - Kế hoạch huyện thực hiện công tác kiểm tra việc lập dự toán, chấp hành dự toán và quyết toán chi NSNN huyện kịp thời nắm bắt tình hình sử dụng ngân sách của các đơn vị. Việc kiểm tra đột xuất tại đơn vị cũng được phòng thực hiện trong trường hợp phát hiện những sai phạm cần thanh tra, kiểm tra trong năm để ngăn ngừa tình trạng chi sai, chi lãng phí ngân sách. Bên cạnh việc kiểm tra thường xuyên các đơn vị cấp dưới, phòng Tài chính - Kế hoạch huyện cũng coi trọng việc tự kiểm tra, giám sát việc thực hiện, chấp hành dự toán của huyện trong đó phòng là đơn vị chủ trì lập dự toán nhằm phát hiện sai phạm kịp thời đồng thời làm căn cứ điều chỉnh cho những năm sau.
Vào đầu năm Thanh tra huyện lập kế hoạch thanh tra định kỳ trình UBND huyện phê duyệt trong đó có nhiệm vụ thanh tra công tác quản lý tài chính. Bên cạnh đó, về khía cạnh thanh tra chuyên môn, thanh tra Sở Tài chính cũng thực hiện công tác thanh tra các đơn vị theo định kỳ theo kế hoạch được phê duyệt của giám đốc Sở Tài chính. Các cơ quan thanh tra hành chính và thanh tra chuyên môn có sự rà soát, chọn lọc các đơn vị thanh tra để tránh sự chồng chéo, tránh lãng phí ngân sách và thời gian. Việc thanh tra đột xuất được thực hiện khi có yêu cầu của cấp có thẩm quyền hoặc khi có phát sinh sai phạm cần làm rõ.
Qua đó cho thấy công tác thanh tra, kiếm tra quản lý chi NSNN tại huyện Lý Sơn về cơ bản là chặt chẽ và được chú trọng. Việc kiểm tra trước khi chi ngân sách từ khâu lập dự toán chi được phòng Tài chính - Kế hoạch và KBNN huyện kiểm tra, xét duyệt nghiêm ngặt theo chế độ, tiêu chuẩn, định mức do Nhà nước quy định. Tính hợp lệ, họp pháp của chứng từ, thủ tục quyết toán được kiểm soát kỹ càng. Các số liệu về chi ngân sách được cơ quan tài chính nắm và cập nhật thường xuyên phục vụ cho công tác điều hành
2.3. Đánh giá công tác quản lý chi ngân sách nhà nƣớc tại huyện Lý Sơn, tỉnh Quảng Ngãi