Phát triển kinh tế biển trong liên kết vùng có những đặc điểm riêng, khác với phát triển kinh tế biển nói chung, đó là:
- Phát triển kinh tế biển khơng diễn ra một cách đơn lẻ mà phải đặt trong mối quan hệ liên kết kinh tế liên ngành với toàn vùng. Đây là đặc điểm quan trọng nhất của phát triển kinh tế biển trong liên kết vùng.
- Tận dụng tối đa nguồn lực của toàn vùng nhằm phát huy lợi thế so sánh nhằm gia tăng quy mô, thay đổi cơ cấu, chất lượng của các phân ngành kinh tế biển theo hướng hiện đại. Đồng thời là q trình thiết lập mơ hình sản xuất theo ‘chuỗi giá trị’ của các chủ thể sản xuất kinh doanh trong tồn vùng.
- Điều hịa và chia sẻ lợi ích hài hịa giữa các chủ thể, ngành, địa phương, tránh sự cạnh tranh khơng cần thiết gây lãng phí nguồn lực và sự dàn trải trong đầu tư trong phát triển kinh tế - xã hội của từng địa phương, vùng.
- Phát triển kinh tế biển trong liên kết vùng là quá trình phát triển tổng hợp, kết nối nhiều lĩnh vực, ngành nghề. Bởi trong cơ cấu các ngành kinh tế biển vốn chứa đựng rất nhiều ngành, lĩnh vực, do đó khi phát triển kinh tế biển trong liên kết vùng phải đặt trong mối quan hệ tạo thành chỉnh thể thống nhất mang tính tổng hợp cao.
- Đa dạng hóa các chủ thể chịu trách nhiệm và tham gia vào sự phát triển kinh tế biển trong liên kết vùng, các cấp chính quyền từ trung ương đến địa phương chịu trách nhiệm về quy hoạch, hoạch định chính sách phát triển, các doanh nghiệp trong và ngoài nước, cộng đồng dân cư tham gia vào quá trình phát triển. Những thành phần này tham gia vào nhiều nhiều lĩnh vực, hoạt động kinh tế khai thác, dịch vụ..., phạm vi liên kết vùng địa lý và các lĩnh vực ngành kinh tế.