Bệnh viện Giao thông vận tải Huế tiền thân là Bệnh viện đường sắt Huế được thành lập từ ngày 1/9/1975. Sau khi miền Nam được hoàn toàn giải phóng, đất nước thống nhất, Bệnh viện được thành lập với nhiệm vụ bảo vệ sức khỏe cho cán bộ, công nhân viên ngành đường sắt tỉnh Bình Trị Thiên trong công cuộc tái thiết đất nước, khôi phục lại hệ thống đường sắt thống nhất Bắc Nam. Đến tháng 1/ 2006, Bệnh viện được đổi chuyển thành Bệnh viện Giao thông vận tải Huế.
Bệnh viện Giao thông vận tải Huế là Bệnh viện đa khoa hạng III, là đơn vị sự nghiệp y tế công lập trực thuộc Cục Y tế giao thông vận tải - Bộ Giao thông vận tải, có trụ sở đóng tại 17 Bùi Thị Xuân, Phường Đúc, Thành phố Huế.
Bệnh viện Giao thông vận tải với đặc thù là một Bệnh viện ngành trên địa bàn, chịu sự quản lý trực tiếp của Cục Y tế Giao thông vận tải, có chức năng khám chữa bệnh, phục hồi chức năng cho công chức, viên chức, người lao động của các cơ quan, đơn vị thuộc ngành Giao thông vận tải và nhân dân trên địa phương. Trong những năm gần đây, Bệnh viện đã có sự phát triển mạnh, có uy tín trên địa bàn tỉnh trong việc khám chữa bệnh và phòng bệnh. Hàng năm, Bệnh viện tiếp nhận khám gần 110.000 lượt bệnh nhân ngoại trú, điều trị cho gần 5.400 bệnh nhân nội trú. Bệnh viện luôn hoàn thành mọi nhiệm vụ được giao của Bộ giao thông vận tải và Cục Y tế Giao thông vận tải giao phó, là lá cờ đầu của ngành y tế giao thông vận tải.[2][3]