Kiểm tra việc kê khai, tính thuế phải nộp là bộ phận thứ ba trong quy trình quản lý thu thuế theo cách tự tính, tự kê khai và tự nộp thuế. Công tác kiểm tra việc kê khai, tính thuế của DN đã được thực hiện thường xuyên, nghiêm túc. Qua kiểm tra đã rà soát, xác định đúng đối tượng chịu thuế, thuế suất đối với từng mặt hàng sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp, từ đó đã hạn chế việc bỏ sót nguồn thu.
Việc kiểm tra Quyết toán thuế được tiến hành theo 2 bước: + Bước 1 kiểm tra hồ sơ khai thuế tại cơ quan thuế:
Căn cứ báo cáo quyết toán thuế và báo cáo Tài chính của đơn vị gửi cơ quan thuế theo quy định là sau 90 ngày kể từ khi kết thúc năm tài chính đơn vị phải nộp hồ sơ quyết toán thuế và báo cáo tài chính đến cơ quan thuế. Trên cơ sở đó cơ quan thuế (Đội Kiểm tra) thực hiện kiểm tra, phân tích trên hệ thống phần mềm ứng dụng (TTR; TPR, BCTC, iHTKK, QLAC, TMS) để phân tích báo cáo tài chính, báo cáo quyết toán là cơ sở để xác định, đánh giá độ chính xác, độ tin cậy và chất lượng của báo cáo. Đồng thời xác định mức độ tuân thủ Pháp Luật thuế của đơn vị. Từ đó tiến hành thu nhập thông tin
49
trong và ngoài ngành để phân loại mức độ vi phạm làm cơ sở để lập kế hoạch kiểm tra.
+ Bước 2 tiến hành kiểm tra tại trụ sở của người nộp thuế:
Căn cứ các quy định của luật thuế, chế độ kế toán và các văn bản hướng dẫn để kiểm tra, đối chiếu xác định hành vi mức độ vi phạm từ đó lập biên bản kiểm tra thuế làm căn cứ tiến hành xử lý các vi phạm qua công tác kiểm tra theo quy định.