Chi nhánh Thành Đô được thành lập và chính thức đi vào hoạt động theo quyết định số 222/QĐ HĐQT ngày 14/8/2006 của Hội đồng quản trị Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam. Chi nhánh Thành đô ra đời trên cơ sở nâng cấp chi nhánh cấp 2 Ngân hàng đầu tư và phát triển khu vực Long Biên trực thuộc chi nhánh Bắc Hà Nội, mô hình tổ chức của Chi nhánh theo phê duyệt của Ngân hàng ĐT&PT Việt Nam như sau:
Hội sở chính bao gồm 04 phòng và 02 tổ:
Phòng Tín dụng, Phòng Dịch vụ Khách hàng, Phòng Tài chính Kế toán, Phòng Tổng hợp.
Tổ Quản lý và Dịch vụ Kho quỹ, Tổ Hành chính Quản trị và các đơn vị trực thuộc Chi nhánh.
Mô hình của chi nhánh sau khi chuyển đổi theo mô hình TA2: Theo Quyết định số 827/QĐ-HĐQT ngày 23/9/2008 của Hội đồng Quản trị Ngân hàng ĐT&PT Việt Nam mô hình tổ chức tại Chi nhánh như sau:
+ Khối Quan hệ Khách hàng: Phòng Quan hệ Khách hàng. + Khối Quản lý Rủi ro: Phòng Quản lý Rủi ro.
+ Khối tác nghiệp: Phòng Dịch vụ Khách hàng, Phòng Quản trị Tín dụng, Tổ Quản lý và dịch vụ Kho qu , Phòng Thanh toán Quốc tế.
+ Khối Quản lý nội bộ: Kế hoạch Tổng hợp; Phòng Tài chính Kế toán; Phòng Tổ chức Hành chính.
+ Khối các đơn vị trực thuộc: Các Phòng giao dịch, quỹ tiết kiệm.
Trụ sở hoạt động: Trụ sở của nhánh đặt tại địa chỉ số 463 Nguyễn Văn Linh - Long Biên - Hà Nội, toàn bộ diện tích Chi nhánh đang thuê của Công ty CP Cầu 12. Cơ sở vật chất về cơ bản như hiện nay đáp ứng đủ điều kiện làm việc. Tuy nhiên, căn cứ tốc độ phát triển của Chi nhánh, diện tích như
hiện nay không đáp ứng đủ, qua đó ảnh hưởng đến hoạt động kinh doanh của Chi nhánh trong thời gian tới.
Hiện nay, mạng lưới kinh doanh của Chi nhánh có 3 phòng giao dịch: Đức Giang, Trâu Quỳ, Việt Hưng và 1 Quỹ tiết kiệm Yên Viên.Các phòng/điểm giao dịch của Chi nhánh đa phần mới thành lập: Chỉ có PGD Đức Giang thành lập trên 3 năm (nhận bàn giao từ Chi nhánh Bắc Hà Nội), PGD Trâu Quỳ thời gian hoạt động 2 năm và PGD Việt Hưng,Quỹ tiết kiệm Yên Viên mới được thành lập trong năm 2007. Chính vì thế vị thế, hình ảnh của các Phòng giao dịch và Quỹ tiết kiệm chưa được đậm n t.