Nếu như ở phần trên đã trình bày, khi căn cứ vào chức năng, nhiệm vụ và lĩnh vực hoạt động của từng ngành, từng đơn vị cho phép chúng ta phân định thẩm quyền điều tra giữa CQCSĐT trong CAND với thẩm quyền điều tra của các CQĐT khác, các cơ quan khác được giao nhiệm vụ tiến hành một số hoạt động điều tra và giữa CQCSĐT và CQANĐT thì ở phần này, căn cứ vào thẩm quyền xét xử của TAND các cấp để chúng ta phân định thẩm quyền điều tra giữa CQCSĐT các cấp trong CAND.
Theo quy định tại khoản 4, khoản 5 Điều 163 của BLTTHS năm 2015 và Điều 19, 20, 21 Luật TCCQĐTHS năm 2015 thì CQCSĐT cấp huyện có thẩm quyền điều tra những vụ án hình sự về những tội phạm thuộc thẩm quyền xét xử của TAND cấp huyện. CQCSĐT cấp tỉnh có thẩm quyền điều tra các vụ án hình sự về những tội phạm thuộc thẩm quyền xét xử của TAND cấp tỉnh hoặc những vụ án thuộc thẩm quyền điều tra của CQCSĐT cấp huyện xảy ra trên địa bàn nhiều huyện, quận, thị xã, thành phố thuộc tỉnh, thành phố thuộc thành phố trực thuộc trung ương, phạm tội có tổ chức hoặc có yếu tố nước ngồi nếu xét thấy cần trực tiếp điều tra. CQCSĐT Bộ Cơng an điều tra vụ án hình sự về tội phạm đặc biệt nghiêm trọng do Hội đồng thẩm
phán TAND tối cao hủy để điều tra lại; vụ án hình sự về tội phạm đặc biệt nghiêm trọng, phức tạp liên quan đến nhiều tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương, vụ án hình sự về tội phạm đặc biệt nghiêm trọng, phức tạp liên quan đến nhiều quốc gia nếu xét thấy cần trực đitếp̀u tra.Quy định như trên là cần thiết nhằm giải quyết tình trạng trùng dẫm hoặc né tránh, ỷ lại trong điều tra qua đó nâng cao chất lượng hoạt động điều tra, chất lượng hoạt động thực hành quyền công tố và kiểm sát hoạt động tư pháp trong hoạt động điều tra và xét xử hình sự, góp phần khắc phục tình trạng oan, sai do vi phạm thẩm quyền gây ra [46].
Cụ thể hơn, theo quy định tại Điều 268 BLTTHS năm 2015, TAND cấp huyện xét xử sơ thẩm những vụ án hình sự về tội phạm ít nghiêm trọng, tội phạm nghiêm trọng và tội phạm rất nghiêm trọng, trừ những tội phạm: các tội xâm phạm an ninh quốc gia; các tội phá hoại hồ bình, chống lồi người và tội phạm chiến tranh; các tội quy định tại các điều 123, 125, 126, 227, 277, 278, 279, 280, 282, 283, 284, 286, 287, 288, 337, 368, 369, 370, 371, 399 và 400 của BLHS 2015; các tội phạm được thực hiện ở ngồi lãnh thổ nước Cộng hịa xã hội chủ nghĩa Việt Nam [44].
TAND cấp tỉnh xét xử sơ thẩm những vụ án hình sự về các tội phạm không thuộc thẩm quyền của TAND cấp huyện; vụ án hình sự có bị cáo, bị hại, đương sự ở nước ngồi hoặc tài sản có liên quan đến vụ án ở nước ngồi; vụ án hình sự thuộc thẩm quyền xét xử của TAND cấp huyện nhưng có nhiều tình tiết phức tạp khó đánh giá, thống nhất về tính chất vụ án hoặc liên quan đến nhiều cấp, nhiều ngành; vụ án mà bị cáo là Thẩm phán, Kiểm sát viên, ĐTV, cán bộ lãnh đạo chủ chốt ở huyện, quận, thị xã, thành phố thuộc tỉnh, thành phố thuộc thành phố trực thuộc trung ương, người có chức sắc trong tơn giáo hoặc có uy tín cao trong dân tộc ít người [44].
Như vậy, tương ứng với thẩm quyền xét xử của TAND cấp huyện, CQCSĐT Cơng an cấp huyện có thẩm quyền điều tra các vụ án hình sự về những tội phạm có mức cao nhất của khung hình phạt quy định đối với tội ấy đến 15 năm tù, trừ những tội phạm được loại trừ nêu tại khoản 1 Điều 268 BLTTHS năm 2015. CQCSĐT Cơng an cấp tỉnh có thẩm quyền điều tra các vụ án hình sự về những tội phạm có mức cao nhất của khung hình phạt quy định đối với tội ấy trên 15 năm tù, tù chung thân, tử hình; những tội phạm khơng thuộc thẩm quyền xét xử của TAND cấp huyện nêu tại khoản 1 Điều 268 BLTTHS. Ngồi ra, CQĐT Cơng an cấp tỉnh cịn có thẩm quyền điều tra những vụ án có yếu tố nước ngồi; vụ án hình sự thuộc thẩm quyền xét xử của TAND cấp huyện nhưng có nhiều tình tiết phức tạp khó đánh giá, thống nhất về tính chất vụ án hoặc liên quan đến nhiều cấp, nhiều ngành; vụ án mà bị cáo là Thẩm phán, Kiểm sát viên, ĐTV, cán bộ lãnh đạo chủ chốt ở huyện, quận, thị xã, thành phố thuộc tỉnh, thành phốthànhthuộcphố trực thuộc trung
ương, người có chức sắc trong tơn giáo hoặc có uy tín cao trong dân tộc ít người. CQCSĐT ở Bộ Cơng an điều tra các vụ án hình sự về những tội phạm có mức cao nhất của khung hình phạt quy định đối với tội ấy là trên 15 năm
tù, tù chung thân, tử hình nhưng xét thấy cần trực tiếp điều tra; các vụ án đặc biệt nghiêm trọng thuộc thẩm quyền điều tra của CQCSĐT do Hội đồng Thẩm phán TAND tối cao hủy để điều tra lại.