Để khắc phục khả năng ứng dụng chưa cao của mô hình APT nêu trên, bên cạnh việc chọn biến nghiên cứu phù hợp, tác giả đề xuất dữ liệu đưa vào mô hình cũng nên được lựa chọn sử dụng phù hợp hơn. Dữ liệu dùng cho mô hình nên được lược bỏ các tác động của sự kiện đặc biệt không liên quan và không phản ánh biến động thực kinh tế vĩ mô, các yếu tố gây nhiễu như tin đồn, tin giả, hành vi gian lận lũng đoạn thị trường. Dữ liệu không được “lọc” sạch nhiễu dẫn tới không đáp ứng được các giả định cơ bản của mô hình, từ đó dĩ nhiên là ước lượng kết quả của mô hình cũng sẽ không chính xác.
Các yếu tố này trên thị trường tài chính thế giới nói chung vẫn còn tồn tại và đặc biệt ở Việt Nam, nơi mà thị trường vẫn đang phát triển ở mức độ chỉ trên “sơ khai” một chút, vẫn còn rất lỏng lẻo, thiếu tính chuyên nghiệp, đồng bộ, khách quan, thiếu cơ sở và hành lang pháp lỹ vững chắc để quản lý và điều chỉnh, thì lại càng nhiều và đáng quan ngại hơn. Các cơ quan cung cấp thông tin cũng không thực hiện việc xử lý dữ liệu này. Duy chỉ có giá các cổ phiếu niêm yết và chỉ số VN- Index có công bố giá điều chỉnh nhưng cũng chỉ điều chỉnh các sự kiện phát hành thêm, trả cổ tức, … Trên thế giới đã có những tổ chức và cá nhân nghiên cứu thực hiện nhưng ở Việt Nam, việc xử lý các dữ liệu loại bỏ yếu tố gây nhiễu là một công việc khổng lồ và khó thực hiện đối với cả các cá nhân và tổ chức do khó thể xác
định các thông tin nhiễu và lượng hóa tác động của chúng một cách đúng đắn và hợp lý do năng lực và điều kiện thị trường không cho phép.
Việc không có được dữ liệu được xử lý loại bỏ nhiễu dẫn tới tác giả buộc phải sử dụng các dữ liệu “thô” được công bố - điều này cũng ảnh hưởng lớn tới chất lượng của ước lượng kết quả mô hình. Tác giả kiến nghị các cá nhân, tổ chức nghiên cứu mô hình APT nói riêng hay bất cứ mô hình kinh tế nào nói chung, nếu có điều kiện và năng lực, nên cân nhắc việc xử lý loại bỏ các tác động của sự kiện đặc biệt không liên quan và không phản ánh biến động thực kinh tế vĩ mô, các yếu tố gây nhiễu như tin đồn, tin giả, hành vi gian lận lũng đoạn thị trường, … làm đầu vào để đảm bảo thỏa mãn các giả định mô hình, từ đó ra kết quả chính xác.