Xây dựng phương án tổ chức lực lượng, phân công rõ trách nhiệm quản lý cho từng địa bàn; bảo đảm liên thông trong khâu phối hợp thực hiện. Chủ động tổ chức các đoàn thanh tra, kiểm tra liên ngành nhằm tập trung triệt phá tận gốc các đường dây buôn lậu, vận chuyển trái phép hàng hóa qua biên giới, cửa khẩu quốc tế đang tồn tại trên địa bàn.
Chủ động nắm bắt và cung cấp thông tin, xây dựng mối quan hệ phối hợp giữa các đơn vị nhằm phát hiện, xử lý những hành vi kinh doanh hàng nhập lậu.
Tăng cường công tác hợp tác quốc tế với các tổ chức có liên quan để phối hợp điều tra, xử lý đối với các tên miền, các website, mạng xã hội đối tượng ở
nước ngoài và đối tượng sử dụng các dịch vụ trên không gian mạng do nước ngoài cung cấp xuyên biên giới để hoạt động thương mại điện tử vi phạm pháp luật nước Việt Nam.
Phối hợp với cơ quan Thuế: Lực lượng quản lý thị trường phối hợp với các cơ quan thuế trong truy xuất nguồn gốc hóa đơn, chứng từ, kiểm tra, kiểm soát sổ sách kế toán. Phát hiện và thu giữ hàng hóa vi phạm khi vi phạm liên quan đến lĩnh vực thuế, chuyển qua cơ quan thuế giải quyết theo thẩm quyền, giúp cơ quan thuế truy thu số tiền trốn lậu thuế.
Phối hợp với Hải quan: Dựa trên chức năng, nhiệm vụ, phạm vi địa bàn hoạt động của mình, lực lượng QLTT chủ trì hoặc phối hợp với cơ quan Hải quan trong công tác tham mưu, chỉ đạo; phối hợp trong việc cung cấp, chuyển giao thông tin, tài liệu vi phạm để phục vụ công tác kiểm tra, xử lý; phối hợp trong kiểm tra, phát hiện và xử lý vi phạm pháp luật; Phối hợp kiểm tra theo chuyên đề; Phối hợp trong công tác tuyên truyền phổ biến giáo dục pháp luật; Phối hợp trong công tác xây dựng, bảo vệ lực lượng.
Phối hợp với Bộ Nông nghiệp và phát triển nông thôn: phối hợp chặt chẽ và hiệu quả trong công tác QLTT trong một số lĩnh vực chung như: hoá chất, kiểm soát vật tư và thuốc bảo vệ thực vật, thức ăn thú y. Phát hiện, xử lý các vụ vi phạm về tiêu chuẩn, đo lường, chất lượng sản phẩm, hàng hóa; an toàn thực phẩm, bảo vệ quyền lợi của người tiêu dùng.
Phối hợp với Công an các cấp: Phối hợp với lực lượng công an địa phương khi truy xét các đường dây buôn lậu, ổ, nhóm kinh doanh, chứa hàng nhập lậu, ngăn chặn tình trạng hàng nhập lậu tràn vào địa bàn. Phối hợp với lực lượng công an giao
thông thực hiện dừng phương tiện khi phát hiện trên xe vận chuyển hàng lậu, ngược lại lực lượng công an khi dừng phương tiện do vi phạm Luật giao thông nếu phát hiện hàng hóa không hợp pháp thì chuyển giao cho Quản lý thị trường.
Phối hợp với các cơ quan truyền thông: như VOV, Đài truyền hình sản xuất các tin bài đưa tin về xử phạt các vụ vi phạm điển hình, giáo dục pháp luật trong kinh doanh hàng hóa nhập khẩu.