Cùng với việc quản lý các hoạt động như đã nêu ở trên, Ban Tôn giáo, Sở Nội vụ tỉnh còn quan tâm quản lý một số hoạt động khác của tôn giáo. Đó là:
Cho phép các chức sắc, tu sỹ xuất cảnh sang các nước. Năm 2009, cho phép 03 chức sắc xuất cảnh sang các nước; cho phép các tôn giáo tổ chức các ngày lễ trọng như Lễ Phật đản, Lễ Nôel, Lễ Phục sinh, Lễ Chúa thành thần hiện xuống và các lễ hội tín ngưỡng dân gian…; cho phép Đại Đức Thích Đức Thiện - Trụ trì tại chùa Phật Tích trưng bày tượng Phật Ngọc Hoà bình thế giới và tổ chức Đại lễ cầu Quốc thái dân an; cho phép Ban Trị sự tổ chức toạ đàm: Phật giáo với văn hoá doanh nghiệp, doanh nhân trong thời kỳ hội nhập với hơn 200 doanh nhân tham dự; chấp thuận cho nhà thờ Chính toà Bắc Ninh tổ chức tuần lễ Đại Phúc ở giáo xứ Bắc Ninh và một số xứ, họ đạo lân cận: Cẩm Giang, Dũng Vi, Đồng Lạng, Nam Viên…
Ngoài ra, Ban tôn giáo tham mưu cho UBND tỉnh chỉ đạo UBND các huyện nắm việc tuyên truyền trái phép đạo Tin lành; việc giáo dân ra Hà Nội cầu nguyện tại 42 Nhà Chung và nhà thờ xứ Thái Hà để có hướng giải quyết; nắm tình hình tổ chức Lễ Phật đản, lễ Noel, lễ truyền chức linh mục; ra văn bản nhắc nhở Toà giám mục Bắc Ninh trong việc Tổng giám Mục Ngô Quang Kiệt ra quyết định thành lập xứ Phượng Giáo trái quy định của Pháp lệnh tín ngưỡng, tôn giáo và Nghị định số 22/2005/NĐ-Cp của Chính phủ; thống kê tình hình nhập tu trái phép, chưa đủ thủ tục, những cơ sở thờ tự xây dựng không xin phép và đưa ra phương hướng giải quyết…