- Về xây dựng chủ trương.
Tỉnh uỷ Đồng Nai luôn chấp hành nghiêm quan điểm, đường lối của Đảng và pháp luật của Nhà nước trong việc xây dựng chủ trương, chính sách phát triển tại địa phương. Thực hiện nghị quyết của Bộ Chính trị, Ban Chấp hành Trung ương Đảng, trong từng thời kỳ, Đảng bộ tỉnh luôn kịp thời ban hành chương trình hành động và xây dựng nghị quyết để cụ thể hóa chủ trương của Đảng tại địa phương. Tuy nhiên trong lãnh đạo, chỉ đạo tại
địa phương còn thiếu sâu sát, thậm chí từng nơi, từng lúc còn buông lỏng kiểm tra, giám sát để xảy ra những sai phạm trong quản lý nhà nước làm ảnh hưởng uy tín của Đảng bộ và chính quyền địa phương. Có một vài vụ việc nghiêm trọng liên quan đến các cơ quan quản lý nhà nước ở Trung ương, trong đó có trách nhiệm lãnh đạo, quản lý ở địa phương, đã gây hậu quả nặng nề, phá vỡ cảnh quan, môi trường sống chung quanh (vụ vi phạm nghiêm trọng về môi trường của công ty bột ngọt Vedan gây ô nhiễm sông Thị Vải; vụ một công ty nhận xử lý nước thải cho các doanh nghiệp trong khu công nghiệp ở Biên Hòa bằng cách dùng xe chở nước thải đổ ra môi trường xung quanh tại địa phương,…); nhiều dự án đã thu hồi đất xong nhưng không sử dụng, đất để hoang hoá kéo dài nhiều năm, quy mô thu hồi đất vượt quá nhu cầu sử dụng, trong khi nông dân không có đất sản xuất, nhiều lao động không kiếm được việc làm, thu nhập giảm, điều kiện sống gặp khó khăn… tạo nên những bất ổn về trật tự, an toàn ở nông thôn.
Chức năng lãnh đạo của tỉnh uỷ là hướng vào việc cụ thể hóa những chủ trương chỉ đạo của Trung ương, tổng kết sự thực hiện được và chưa được, phát hiện những tình huống, dự báo xu thế phát triển để có quyết sách, nhưng trong thực tế, có một số vụ việc, cơ quan nhà nước lại dựa dẫm vào sự chỉ đạo của cấp uỷ. Cấp uỷ không ban hành văn bản chỉ đạo thì công việc không tiến triển tốt, nhưng việc ban hành văn bản lại bộc lộ nhiều hạn chế, thiếu sót. Việc ban hành một văn bản của Tỉnh ủy, Ban Thường vụ Tỉnh ủy nhiều khi mất rất nhiều thời gian do trình độ, năng lực của cán bộ soạn thảo, phải lấy ý kiến tham khảo của nhiều ban, ngành liên quan.
Những nội dung thiếu sót trên còn thể hiện trong phương thức, phong cách lãnh đạo.