Nguyên vật liệu là một trong các yếu tố đầu vào vô cùng quan trọng của các DN sản xuất. Các DNSXDP với chức năng chủ yếu là sản xuất và trực tiếp tiêu thụ sản phẩm do DN sản xuất ra, vì vậy, vấn đề đảm bảo NVL về số lợng, chất lợng, tính đồng bộ là yếu tố quan trọng để tiến hành sản xuất kinh doanh. Để sản xuất một loại sản phẩm cần tới hàng chục, thậm chí hàng trăm loại NVL mà ở các DNSXDP sản xuất rất nhiều loại sản phẩm (sản phẩm thuộc về đông dợc, tân dợc, mỹ phẩm ), do… đó chủng loại NVL rất phong phú.
Một điều đặc biệt là 100% nguyên liệu đầu vào của các hàng tân dợc đều phải nhập khẩu nên phải phụ thuộc rất lớn vào các đối tác nhập hàng, do đó các DN dễ bị ép tăng giá, làm cho giá thành sản phẩm tăng theo. Mặt khác, do nhập khẩu hàng nên DN phải sử dụng ngoại tệ, vì vậy chịu ảnh hởng trực tiếp của tỷ giá hối đoái, có năm do tỷ giá ngoại tệ tăng, làm cho giá thành sản phẩm tăng cao, các DN phải giảm giá trị hàng sản xuất.
NVL sản xuất hàng đông dợc của các DN đa phần không đạt tiêu chuẩn chất lợng đầu vào nh nhân sâm nhập từ Triều Tiên, tam thất nhập từ Trung Quốc.
Hiện nay, nguồn cung cấp các loại dợc liệu của các DN rất đa dạng, tuy nhiên do lợng hàng nhập khẩu tơng đối lớn nh vậy nên để giảm sự thụ động khi mua các yếu tố đầu vào thì DN phải lựa chọn các nhà cung cấp cho phù hợp.
Bên cạnh đó, NVL sản xuất thuốc rất phức tạp về tính chất lý – hóa học. Giữa các loại dợc liệu có thể có những phản ứng hóa học với nhau, do vậy, nếu khâu bảo quản không đảm bảo sẽ ảnh hởng tới chất lợng của sản phẩm. Do đó, cũng nh việc bảo quản sản phẩm, việc bảo quản NVL là một công việc hết sức phức tạp.