Thực chất của HQKT là vấn đề nâng cao hiệu quả sử dụng các nguồn lực sản xuất kinh doanh và tiết kiệm chi phí các nguồn lực. Đĩ là 2 mặt của vấn đề đánh giá hiệu quả. Nĩi cách khác, bản chất của HQKT là nâng cao năng suất lao động xã hội và tiết kiệm lao động xã hội, 2 mặt này cĩ mối liên hệ mật thiết, gắn liền với 2 quy luật tương ứng của nền sản xuất xã hội là quy luật tăng năng suất lao động và quy luật tiết kiệm tài nguyên.
Việc làm rõ bản chất của phạm trù HQKT cần phải phân định rõ sự khác nhau nhưng cĩ mối quan hệ giữa kết quả và hiệu quả.
Kết quả phản ánh về mặt định lượng mục tiêu đạt được bằng hệ thống các chỉ tiêu kế hoạch đề ra, khơng đề cập đến cách thức, chi phí bỏ ra để đạt được mục tiêu đĩ. Bản thân kết quả khơng thể hiện được chất lượng.
Hiệu quả thể hiện một cách tồn diện trên mặt định lượng và định tính, về định lượng hiệu quả thể hiện mối tương quan giữa chi phí (đầu vào) và kết quả (đầu ra). Về mặt định tính, hiệu quả khơng chỉ thể hiện qua các con số cụ thể mà cịn thể hiện nguyên nhân mang tính định tính để đạt được con số đĩ, phản ánh được sự nhất trí và khả năng đĩng gĩp của các mục tiêu trên thành phần vào mục tiêu chung. Như đã phân tích thì HQKT liên quan trực tiếp đến các yếu tố đầu vào và yếu tố đầu ra của quá trình sản xuất kinh doanh. Việc xác định các yếu tố đầu vào và đầu ra của quá trình sản xuất kinh doanh sẽ gặp một số vấn đề sau:
Đối với các yếu tố đầu vào:
Các tư liệu tham gia nhiều lần vào quá trình sản xuất khơng đồng đều trong nhiều năm, cĩ loại rất khĩ xác định đào thải và chi phí sửa chữa nên việc khấu hao và phân bổ chi phí để tính tốn các chỉ tiêu hiệu quả chỉ chĩ tính chất tương đối [?].
Sự biến động của giá cả thị trường gây trở ngại cho việc xác định chi phí biến đổi và chi phí khấu hao tài sản cố định.
Một số yếu tố đầu vào quan trọng cần phải được hạch tốn để tính các chi phí nhưng thực tế khơng thể tính được cụ thể chi phí đầu tư xây dựng cơ sở hạ tầng, thơng tin, giáo dục, đào tạo, tuyên truyền, khuyến cáo kỹ thuật,…
Các yếu tố của điều kiện tự nhiên kể cả thuận lợi và khĩ khăn cũng cĩ tác động rất lớn tới quá trình sản xuất. Tuy nhiên, mức độ tác động của các yếu tố này vẫn chưa cĩ phương pháp xác định chuẩn xác.
Đối với các yếu tố đầu ra:
Các kết quả đạt được về mặt vật chất cĩ thể lượng hĩa được để so sánh, nhưng cĩ những yếu tố khơng thể lượng hĩa được như vấn đề bảo vệ mơi trường sinh thái, tái sản xuất kỹ thuật của doanh nghiệp, khả năng cạnh tranh,…
Cĩ những hiệu quả bộc lộ ra trong một thời gian dài, thậm chí rất dài như mơi trường sinh thái, các tệ nạn xã hội,.. nên việc xác định các yếu tố đầu ra cũng gặp những trở ngại phức tạp.
Như vậy, HQKT phản ánh trình độ thực hiện các nhu cầu của xã hội, cịn mục đích cuối cùng của sản xuất là đáp ứng những nhu cầu vật chất, tinh thần cho xã hội. Do đĩ hiệu quả khơng phải là mục đích cuối cùng của sản xuất. Vì vậy, việc nghiên cứu HQKT khơng những để đánh giá mà cịn cơ sở để tìm ra các giải pháp phát triển sản xuất với trình độ cao hơn.