Cỏc NHTMCP được thành lập và hoạt động do UBND địa phương nơi NHTMCP đú đúng trụ sở chớnh cấp giấy phộp. NHNN cấp phộp hoạt động và đăng ký kinh doanh tại Sở Kế hoạch và Đầu tư. NHNN cú trỏch nhiệm quản lý, thanh tra và giỏm sỏt cỏc NHTMCP. Theo Phỏp lệnh, cú hai loại hỡnh NHTMCP là NHTMCP đụ thị tại cỏc đụ thị lớn và NHTMCP nụng thụn tại cỏc tỉnh thành.
NHTMCP là NHTM được thành lập dưới hỡnh thức cụng ty cổ phần thuộc sở hữu của cỏc cổ đụng. Cỏc NHTMCP được thành lập với cỏc cổ đụng là thể nhõn, cỏc phỏp nhõn và cú thể cú cả cổ đụng nước ngoài. Vỡ vậy, NHTMCP luụn tồn tại hỡnh thức sở hữu của nhõn dõn, sở hữu của Nhà nước và sở hữu của nước ngoài.
Cỏc NHTMCP đều được đặt dưới sự quản trị của HĐQT và HĐQT lại do Đại hội cổ đụng bầu ra. Đại hội cổ đụng cũng bầu ra Ban kiểm soỏt để kiểm tra và giỏm sỏt cỏc hoạt động của ngõn hàng. Điều hành NHTMCP đụ thị là tổng giỏm đốc và đối với NHTMCP nụng thụn là giỏm đốc, chức vụ này do thành viờn HĐQT hay cổ đụng đảm nhiệm, nhưng hầu hết là thuờ người cú đủ năng lực và trỡnh độ để điều hành ngõn hàng. Đa phần cỏc thành viờn HĐQT, Ban kiểm soỏt của cỏc NHTMCP cú vốn ớt và thiếu trỡnh độ hiểu biết về kinh tế, ngõn hàng và luật phỏp.
Cỏc NHTMCP cú bộ mỏy tổ chức gọn nhẹ, đội ngũ cỏn bộ nhõn viờn khụng nhiều và cú sự khụng đồng đều về trỡnh độ cỏn bộ giữa cỏc NHTMCP. Mặt khỏc, cỏc NHTMCP tại Việt Nam thường tập trung ở cỏc thành phố lớn nhất là TPHCM, Hà Nội và cỏc tỉnh đồng bằng sụng Cửu Long. Nhiều NHTMCP chỉ hoạt động trong phạm vi địa bàn mà mỡnh đúng trụ sở chớnh, một số ngõn hàng chỉ mở chi nhỏnh tại cỏc tỉnh thành lớn do khụng đủ mức vốn điều lệ cần thiết để mở chi nhỏnh tại cỏc nơi khỏc. Hiện nay, mới cú một số ớt NHTMCP cú cụng ty con, trung tõm dịch vụ riờng biệt như thẻ thanh toỏn, tư vấn tài chớnh, nghiờn cứu về chứng khoỏn và địa ốc…
Nhỡn chung, cỏc NHTMCP Việt Nam cú đặc điểm cơ bản là vốn điều lệ thấp, hoạt động với quy mụ nhỏ, cụng tỏc quản trị điều hành cũn nhiều bất cập, trỡnh độ của cỏn bộ nghiệp vụ cũn nhiều hạn chế.