Sự tỏch cỏc chất bằng CE dựa trờn tốc độ di chuyển khỏc nhau của hạt tớch điện dưới tỏc dụng của lực từ điện trường E thớch hợp, tốc độ đú tỷ lệ thuận với cường độ điện trường (E).
v = .E (1.1)
Trong đú à được gọi là độ điện di, là hằng số đặc trưng cho hạt tớch điện
trong một điều kiện điện di xỏc định. Độ điện di phụ thuộc vào lực điện di (Fe) và
lực cản trở (Ff), khi tốc độ của dũng ổn định, hai lực này sẽ cõn bằng (Fe = Ff).
Lực điện di gõy ra chuyển động của hạt mang điện trong mao quản, được tớnh bởi cụng thức:
Fe = q.E (1.2)
Lực cản trở sinh ra do độ nhớt của dung dịch đệm điện di, được thể hiện bằng định luật Stokes [12]:
Ff = – 6...r.v (1.3)
Trong đú là độ nhớt của dung dịch đệm điện di, r là bỏn kớnh ion. Từ cụng thức (1.1), (1.2), (1.3) ta cú:
à = q/(6...r.) (1.4)
Từ cụng thức (1.4) cú thể thấy, độ điện di tỷ lệ thuận với điện tớch của phần tử mang điện và tỷ lệ nghịch với độ nhớt của dung dịch đệm điện di, bỏn kớnh hydrat của phần tử mang điện. Nghĩa là, trong một điện trường E nhất định, chất nào cú điện tớch lớn và kớch thước nhỏ sẽ di chuyển nhanh; cỏc chất mang điện cựng điện tớch thỡ chất nào cú kớch thước nhỏ sẽ di chuyển nhanh hơn; cỏc chất mang điện cựng bỏn kớnh, chất nào cú điện tớch lớn sẽ di chuyển nhanh hơn.
Tuy nhiờn, trong thực tế, độ điện di cũn phụ thuộc vào cỏc yếu tố khỏc như pH, nồng độ của dung dịch đệm, thành phần, nồng độ của chất điện ly trong pha động, hằng số điện ly của chất phõn tớch, chất hoạt động bề mặt, chất phụ gia trung tớnh trong pha động, dung mụi hữu cơ thờm vào pha động điện di hay mẫu phõn tớch… Và đặc biệt, độ điện di cú mối quan hệ mật thiết với dũng EOF, cỏc yếu tố
trong phương phỏp điện di phải tỡm cỏc điều kiện thớch hợp để cú độ điện di và dũng EOF phự hợp nhất cho việc tỏch chất.