- Dưới vùng DP: cũng bao gồm 2 bộ gien ,1 bộ chứa gien giả DPA2 và
1.3.2.Cấu trúc phân tử HLA lớp II:
Mỗi phân tử lớp II bao gồm 2 chuỗi glycoprotein αβ kết hợp khơng đồng hĩa trị. Chuỗi α cĩ trọng lượng phân tử là 34 KD, lớn hơn chuỗi β (cĩ trọng lượng phân tử là 29 KD), do chuỗi α cĩ glycosyl hĩa nhiều hơn. Hai chuỗi đều cĩ đầu tận amin ngoại bào và carboxyl nội bào, hơn 2/3 chuỗi là phần ngoại bào. Cả 2 chuỗi chạy dọc suốt màng tế bào, cĩ tác dụng như là một cái neo gắn phân tử vào màng. Tương tự như phân tử lớp I, phân tử lớp II được chia làm 3 vùng:
+ Vùng ngoại bào ưa nước + Vùng xuyên màng kỵ nước + Vùng nội bào ưa nước
Vùng ngoại bào của phân tử lớp II chứa 4 domain với 90 aa cho mỗi domain. Hai domain của chuỗi α ký hiệu là α1 và α2. hai chuỗi β ký hiệu là β1
β2, domain α 2 và β2 của lớp II (giống như domain α3 và β2M của lớp I) giống với vùng hằng định của Ig và vì thế chúng cũng thuộc gia đình các siêu cấu trúc Ig. Vùng gắn peptid liên quan đến 2 chuỗi α1 và β1. Khác với lớp I, α1 và β1 gập lại tạo thành nền là lá β cĩ 8 lớp. Hai cánh α1 và β1 tạo nên rãnh peptid.
Tính đa kiểu hình của gien HLA lớp II tập trung trong cấu trúc α1 và β1 của rãnh peptid, tạo nên bề mặt cĩ cấu trúc hĩa học đặc hiệu của rãnh, quyết định tính đặc hiệu và ái tính gắn peptid của rãnh cũng như sự nhận biết đặc hiệu của TCR với phức hợp peptid KN- HLA II.
Tính đa kiểu hình của các dưới nhĩm HLA lớp II khác nhau tùy thuộc vào từng dưới nhĩm: đối với phân tử HLA-DR, chuỗi DR α tương đối đồng nhất trong khi chuỗi DB thì cực kỳ đa kiểu hình. Đối với -DQ, chuỗi DQ α và DQ β
đều cĩ độ đa kiểu hình cao. Đối với -DP, chuỗi DP α cĩ tính đa kiểu hình giới hạn, trong khi DP β thì cực kỳ đa kiểu hình.[2], [3], [4], [59], [60], [75] [83]