- Dưới vùng DP: cũng bao gồm 2 bộ gien ,1 bộ chứa gien giả DPA2 và
1.2.3.Sự mất cân bằng liên kết: [3],[4]
Sự tái tổ hợp gien thường gặp trong các hệ thống di truyền đa alen như HLA. Đĩ là kết quả của sự kết hợp ngẫu nhiên của 2 alen bất kỳ ở các locus HLA khác nhau. Tần suất kết hợp của 1 alen bất kỳ ở locus HLA thứ nhất và 1 alen bất kỳ ở locus HLA thứ hai là sản phẩm ngẫu nhiên của mỗi alen trong quần thể.
Tần suất của haplotype = tần suất của alen locus 1 x tần suất alen locus 2 (tính tốn lý thuyết).
Tuy nhiên, cĩ một sự kết hợp đặc biệt của các alen xảy ra với tần suất lớn hơn dự đốn. Sự kết hợp này gọi là sự mất cân bằng liên kết và được tính tốn như là một sai biệt (D) giữa tần suất quan sát được và tần suất dự đốn lý thuyết.
Ta cĩ: D = PAB –PA x PB với
PA = tần suất gien A, PB = tần suất gien B PAB = tần suất của giao tử mang cả gien A và B
Ví dụ: HLA-B*0801 được tìm thấy ở người da trắng với tần suất 0,092 và HLA-DRB1*0301 được tìm thấy với tần suất 0,089. Tần suất dự đốn của sự kết hợp HLA-B*0801/-DRB1*0301 trong quần thể này là 0,092 x 0,089 = 0,0082. Tuy nhiên, tần suất quan sát được là 0,0731. Vì vậy, sự mất cân đối liên kết (D) tính được là 0,0731 – 0,0082 = 0,0649.
Nguyên nhân của sự mất thăng bằng liên kết thường do 2 yếu tố sau: + Sự hợp nhất bẩm sinh giữa 2 quần thể: thường là các quần thể cơ lập và khoảng cách gien giữa 2 locus gần nhau.
+ Sự chọn lọc tự nhiên: chúng cĩ thể là nguồn gốc của sự mất thăng bằng liên kết, nếu nĩ được tạo thuận lợi bởi một sự kết hợp gien nào đĩ trên nhiễm sắc thể của nĩ và khoảng cách gien giữa 2 locus nhỏ hơn 1-2 centimorgans [3][4][6][17].